Inventory number IRN Number of state registration
0321РК00436 AP08052960-KC-21 0120РК00043
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Краткие сведения Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 0
International publications: 0 Publications Web of science: 0 Publications Scopus: 0
Patents Amount of funding Code of the program
0 24000000 AP08052960
Name of work
Породоспецифичное QTL-маркирование мясной продуктивности крупного рогатого скота аулиекольской и казахской белоголовой породы на основе полногеномного SNP-чипирования
Type of work Source of funding Report authors
Applied Бейшова Индира Салтановна
0
0
1
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) МСХ РК
Full name of the service recipient
НАО «Западно-Казахстанский Аграрно-технический университет имени Жангир Хана»
Abbreviated name of the service recipient НАО "ЗКАТУ им. Жангир хана"
Abstract

Животные аулиекольской и казахской белоголовой пород казахстанской селекции.

Қазақстан селекциясының әулиекөл және қазақ ақбас тұқымдарының жануарлары.

На основе данных полногеномного ДНК-чипирования, разработать породоспецифичный SNP-комплекс для QTL-маркирования мясной продуктивности у крупного рогатого скота аулиекольской и казахской белоголовой пород казахстанской селекции.

Толық геномдық ДНҚ-чиптеу деректерінің негізінде, әулиекөл және қазақтың ақбас тұқымдары ірі қара малдарының ет өнімділігін тұқымдық айрықша QTL-таңбалау үшін тұқымдық айрықша SNP-кешенін әзірлеу.

Генотипирование животных проводилось с помощью биочипа GeneSeek GGP Bovine 150K, со средней плотностью покрытия 150 000 SNP («Illumina Inc.», США). Протяженные гомозиготные области (ROH), коэффициент инбридинга (F) определяли для исследуемых животных, используя программу PLINK. Для выявления особенностей генома аулиекольской и казахской белоголовой пород и оценки степени их родства между собой и по отношению к родительским породам применяли анализ главных компонент. Массивы SNP-полиморфизмов выявляли с помощью метода полногеномного поиска ассоциаций (genome wide association study, или GWAS).

Жануарларды генотиптеу GeneSeek GGP Bovine 150K биочипімен, орташа тығыздығы 150 000 SNP ("Illumina Inc.", АҚШ). Кеңейтілген гомозиготалы аймақтарды (ROH), инбридинг коэффициенті (F) зерттелетін жануарлар үшін PLINK бағдарламасын қолдану арқылы анықталды. Әулиекөл және қазақтың ақбас ірі қара мал тұқымдары геномының ерекшеліктерін анықтау және олардың бір-бірімен және ата-аналық тұқымдарға қатысты туыстық дәрежесін бағалау үшін негізгі компоненттер анализі қолданылды. SNP-полиморфизм массивтері қауымдастықтардың толық геномдық ассоциативті іздеу әдісімен анықталды (genome wide association study немесе GWAS).

Выявлено 5 SNP-маркеров повышенной мясной продуктивности у крупного рогатого скота аулиекольской породы: аллель С (rs108957811) в гене тиреоглобулина (thyroglobulin (TG)), аллель Т (rs134860368) в гене фактора сетевого клеточного взаимодействия (cellular communication network factor 4 (CCN4)), аллель С (rs135948785) в гене мотив IQ и анкириновый повтор, содержащего фактора (IQANK1 (IQ motif and ankyrin repeat containing 1 (IQANK1), аллель Т (rs435135552) в гене миостатина (myostatin (MSTN), аллель А (rs720275361) в гене миостатина (myostatin (MSTN). Выявлено 7 SNP-маркеров повышенной мясной продуктивности у крупного рогатого скота казахской белоголовой породы: аллель С (rs109910863) в гене гистоферина (histatherin (HSTN)), аллель С (rs110065568) в гене миостатина (myostatin (MSTN), аллель G (rs110320975) в гене гистоферина (histatherin (HSTN)), аллель С (rs135748641) в гене нуклеолярного протеина, взаимодействующего с доменом FHA фактора MKI67 (nucleolar protein interacting with the FHA domain of MKI67 (NIFK), аллель G (rs136552787) в гене инсулиноподобный фактор связывающий протеин 6 (insulin like growth factor binding protein 6 (IGFBP6-202)), аллель А (rs137243785) в гене гистоферина (histatherin (HSTN-201)), аллель А (rs522351439) в гене миостатина (myostatin (MSTN)).

Әулиекөл тұқымды ірі қара малында ет өнімділігі жоғарылаған 5 SNP-маркері анықталды: тиреоглобулин (thyroglobulin (TG)) генінде аллель С (rs108957811), желілік жасушалық өзара әрекеттесу факторы генінде аллель Т (rs134860368) (cellular communication network factor 4 (CCN4)), аллель С (rs135948785) IQ мотив генінде және анкиринді қайталау құрамында фактор, (IQANK1 (IQ motif and ankyrin repeat containing 1 (IQANK1) бар, аллель Т (RS435135552) миостатин генінде (myostatin (MSTN), аллель А (rs720275361) миостатин генінде (myostatin (MSTN). Қазақтың ақбас тұқымды ірі қара малында ет өнімділігі жоғарылаған 7 SNP-маркері анықталды: гистоферин генінде аллель С (rs109910863) (histatherin (HSTN)), миостатин генінде аллель С (rs110065568) (myostatin (MSTN), гистоферин генінде аллель G (rs110320975) (histatherin (HSTN)), аллель С (rs135748641) FHA доменімен әрекеттесетін нуклеолярлы ақуыз генінде MKI67 факторы (nucleolar protein interacting with the FHA domain of MKI67 (NIFK), аллель G (rs136552787) генінде инсулин тәрізді фактор байланыстыратын ақуыз 6 (insulin like growth factor binding protein 6 (IGFBP6-202)), аллель А (rs137243785) гистоферин генінде (histatherin (HSTN-201)), аллель А (rs522351439) генінде миостатин (myostatin (MSTN)).

Полученная информация об ассоциации породоспецифичных генетических маркеров с мясной продуктивностью аулиекольской и казахской белоголовой пород даст в руки казахстанских селекционеров конкретные маркерные последовательности в QTL, которые позволят проводить оценку потенциала мясной продуктивности животных, не тратя деньги на их выращивание и время на получение от них потомства. Это значительно ускорит селекционные мероприятия по повышению мясной продуктивности этих пород и поспособствует интенсификации мясной отрасли животноводства Республики Казахстан.

Тұқымдық айрықша генетикалық маркерлердің әулиекөл және қазақтың ақбас тұқымдарының ет өнімділігімен ассоциациясы туралы алынған ақпарат қазақстандық селекционерлерге QTL-гі нақты маркерлік бірізділіктерді ұсынады, олар жануарларды өсіруге ақша жұмсамай-ақ және олардың ұрпағын алуға уақыт кетірмей-ақ, жануарлардың ет өнімділігінің әлеуетін бағалауға мүмкіндік береді. Бұл осы тұқымдардың ет өнімділігін арттыру жөніндегі селекциялық іс-шараларды айтарлықтай жеделдетеді және Қазақстан Республикасының мал шаруашылығының ет саласын қарқындатуға ықпал етеді.

Целевые потребителями полученных результатов будут организации, занимающиеся товарным разведением, селекционно-племенной работой в животноводстве, научно-исследовательские институты.

Алынған нәтижелердің мақсатты тұтынушыларыболып тауарлық өсірумен, мал шаруашылығындағы селекциялық-асыл тұқымдық жұмыстармен айналысатын ұйымдар, ғылыми-зерттеу институттары болады.

UDC indices
636.018; 636.033
International classifier codes
34.23.59; 68.39.19;
Key words in Russian
крупный рогатый скот; аулиекольская порода; казахская белоголовая порода; мясная продуктивность; SNP-маркеры;
Key words in Kazakh
ірі қара мал; әулиекөл тұқымы; қазақтың ақбас тұқымы; ет өнімділігі; SNP маркерлері;
Head of the organization Наметов Аскар Мырзахметович Доктор ветеринарных наук / Профессор
Head of work Бейшова Индира Салтановна Доктор биологических наук / Ассоциированный профессор