The object of research, development or design (in Russian) : Паттерны раковых мутаций

The object of research, development or design (in Kazakh) : Қатерлі ісік мутациясының ерекшеліктер

Aim of work (in Russian) : Этот проект направлен на характеризацию паттернов раковых мутаций и включает три взаимодополняющие цели: (i) анализ полногеномных данных раковых мутаций, (ii) новый пакет программного обеспечения для анализа и моделирования кластерных мутаций, (iii) новые человеческие клеточные линии для экспериментальных исследований мутагенеза.

Aim of work (in Kazakh) : Бұл жоба қатерлі ісіктің кластерлік мутациясының ерекшеліктерін сипаттауға бағытталған және үш қосымша мақсаттан тұрады: (i) қатерлі ісік ауруының толық геномды мутациялар деректер жиынтығын талдау; (ii) кластерлі мутацияны талдау мен модельдеуге арналған жаңа бағдарламалық пакеттер, (iii) эксперименттік мутагенезді зерттеу үшін жаңа адам жасушасының бағыттары.

Методы исследования (на русском) : Компьютерный анализ данных полногеномного секвенирования и кластеров раковых мутаций

Методы исследования (на казахском) : Толық геном бойынша секвенирлеу деректерін және қатерлі ісік мутациясының кластерлерін компьютерлік талдау

Obtained results and novelty (in Russian) : Одобрен доступ к данным проектов контролируемого доступа NCBI dbGAP, США. Получен набор данных полногенномного секвенирования для пациентов клиники Гюстава Росси, Франция, с дефектами в генах репарации ДНК. Разработаны процедуры выделения и статистического анализа кластерных мутаций для данных полногеномного секвенирования. Разработан протокол создания клеточных линий человека с избыточной экспрессией белков репарации ДНК для экспериментальных исследований мутагенеза. Результаты работы доложены на международной конференции 45th FEBS Congress, Любляна, Словения, 3-8 Июля 2021. Проведен анализ эволюции белков семейства ДНК гликозилаз. Проведен анализ структурной роли ароматических остатков в белках. Опубликованы 2 статьи и 1 тезис в зарубежных журналах.

Obtained results and novelty (in Kazakh) : NCBI dbGAP, АҚШ, бақыланатын қол жеткізу жобаларының деректеріне қол жеткізу бекітілген. Густав Росси клиникасындағы (Франция) ДНҚ қалпына келтіру гендерінде ақаулары бар емделушілер үшін толық геномды реттілік деректер жинағы алынды. Толық геномды секвенирлеу деректері үшін кластерлік мутацияларды оқшаулау және статистикалық талдау процедуралары әзірленді. Мутагенездің эксперименттік зерттеулері үшін ДНҚ репарациясының артық шығарылынған экспрессия ақуызымен адамның жасушалық желілерін құруға арналған хаттама әзірленді. Жұмыс нәтижелері 2021 жылғы 3-8 шілдеде Любляна, Словенияда өткен 45-ші FEBS конгресінде өткен халықаралық конференцияда айтылды. ДНҚ гликозилаза тұқымдасының белоктарының эволюциясына талдау жасалды. Ақуыздардағы ароматты қалдықтардың құрылымдық рөліне талдау жасалды. Шетелдік журналдарда 2 мақала және 1 тезис жариялады.

The main constructive and technical economic indicators (in Russian) : Опубликованы 2 статьи и 1 тезис в зарубежных журналах

The main constructive and technical economic indicators (in Kazakh) : Шетелдік журналдарда 2 мақала және 1 тезис жариялады

Level of implementation (in Russian) : Проект фундаментальный, внедрение не предусмотрено

Level of implementation (in Kazakh) : Іргелі жоба, іске асыру көзделмеген

Efficiency (in Russian) : Эффективность научной работы высокая

Efficiency (in Kazakh) : Ғылыми жұмыстың тиімділігі жоғары

Field of application (in Russian) : Биоинформатика, анализ данных полногеномного севенирования рака

Field of application (in Kazakh) : Биоинформатика, қатерлі ісік толық геномды секвенирлеу деректерін талдау