Inventory number IRN Number of state registration
0321РК00239 AP09259103-KC-21 0121РК00195
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Краткие сведения Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 0
International publications: 0 Publications Web of science: 0 Publications Scopus: 0
Patents Amount of funding Code of the program
0 18600000 AP09259103
Name of work
Выявление геномных и субгеномных характеристик циркулирующих в РК штаммов SARS-CoV-2 для разработки научно-обоснованных подходов к диагностике COVID-19
Type of work Source of funding Report authors
Applied Скиба Юрий Александрович
0
0
3
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) МНВО РК
Full name of the service recipient
Товарищество с ограниченной ответственностью "Национальный центр биотехнологии"
Abbreviated name of the service recipient ТОО "Национальный центр биотехнологии"
Abstract

Использовались назофарингеальные смывы людей

Адамдардың мұрын қуысы шайындылары қолданылды

Провести популяционные исследования в отношении генотипов SARS-CoV-2, циркулировавших в Казахстане во время пандемии 2020 г., анализ их субгеномных характеристик и получить рекомбинантные белки SARS-CoV-2 для выработки научно-обоснованных подходов к диагностике COVID-19.

2020 жылғы пандемия кезінде Қазақстанда айналымда болған SARS-CoV-2 генотиптеріне қатысты популяциялық зерттеулер жүргізу, олардың субгеномдық сипаттамаларын талдау және COVID-19 диагностикасына ғылыми негізделген тәсілдерді әзірлеу үшін SARS-CoV-2 рекомбинантты ақуыздарын алу.

компьютерный анализ нуклеотидных последовательностей, выделение РНК из биологического материала, обратная транскрипция, PCR, RT-qPCR, электрофорез нуклеиновых кислот, спектрофотометрический анализ, секвенирование ДНК, статистический анализ данных.

нуклеотидтер тізбегін компьютерлік талдау, биологиялық материалдан РНҚ оқшаулау, кері транскрипция, ПТР, RT-qPCR, нуклеин қышқылының электрофорезі, спектрофотометриялық талдау, ДНҚ реттілігі, статистикалық деректерді талдау.

1) Проведен компьютерный анализ нуклеотидных последовательностей SARS-CoV-2, разработаны, синтезированы и очищены праймеры и пробы для детекции и характеризации РНК вируса. 2) Выделены РНК из 26285-и фаренгоназальных мазков и 32-я образцов от восьми умерших от пневмонии пациентов, все выделенные РНК были протестированы методом RT-qPCR на присутствие нуклеиновой кислоты SARS-CoV-2. 3) Проведена характеристика эпидемиологии COVID-19 за 2021 год, исходя из полученных данных. 4) Проведено частичное секвенирование геномов SARS-CoV-2 (полной открытой рамки считывания спайкового S-гликопротеина), выделенных из образцов пациентов с тяжелой формой пневмонии, последовательности выложены в базу данных GenBank.

1) SARS-CoV-2 нуклеотид тізбектеріне компьютерлік талдау жүргізілді, вирустың РНҚ-ны анықтау және сипаттау үшін праймерлер мен сынамалар жасалды, синтезделді және тазартылды; 2) 26285 және фаренгоназальды жағындылардан РНҚ және пневмониядан қайтыс болған сегіз пациенттің 32 үлгісі бөлінді, барлық оқшауланған РНҚ-лар SARS-CoV-2 нуклеин қышқылының болуына RT-qPCR әдісімен сыналды; 3) алынған деректерге сүйене отырып, 2021 жылға арналған covid-19 эпидемиологиясының сипаттамасы жүргізілді. 4) SARS-CoV-2 геномдарының (s-гликопротеиннің толық ашық дәнекерлеу шеңбері) ішінара жүйеленуі жүргізілді, пневмонияның ауыр түрі бар пациенттердің үлгілерінен бөлініп, жүйелілік GenBank деректер базасына орналастырылды.

Разработаны и синтезированы праймеры и пробы для детекции и частичного секвенирования геномов SARS-CoV-2.

SARS-CoV-2 геномдарын анықтау және ішінара ретке келтіру үшін праймерлер мен сынамалар жасалып, синтезделді.

эпидемиология, молекулярная генетика, вирусология

эпидемиология, молекулалық генетика, вирусология

UDC indices
577.21 : 578.834.1 : 616.24-002 : 616-036.22
International classifier codes
62.00.00;
Key words in Russian
COVID-19; Генотипирование; Субгеномная РНК; Коронавирус SARS-CoV-2; Секвенирование ДНК;
Key words in Kazakh
COVID-19; Генотиптеу; Субгеномды РНҚ; SARS-CoV-2 коронавирус; ДНҚ секвенирлеу;
Head of the organization Раманкулов Ерлан Мирхайдарович Ph.D / Профессор
Head of work Скиба Юрий Александрович Кандидат биологических наук / нет