Inventory number IRN Number of state registration
0220РК00589 AP05132856-OT-20 0118РК00927
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Заключительный Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 0
International publications: 3 Publications Web of science: 1 Publications Scopus: 2
Number of books Appendicies Sources
1 7 53
Total number of pages Patents Illustrations
85 0 10
Amount of funding Code of the program Table
6688989 AP05132856 8
Code of the program's task under which the job is done
AP05132856
Name of work
Идентификация и молекулярно-генетическая характеристика штаммов Borrelia sp., распространенных в различных регионах Казахстана, для усовершенствования системы эпидемиологического надзора за клещевым боррелиозом
Report title
Type of work Source of funding The product offerred for implementation
Applied Другая (укажите)
Report authors
Скиба Юрий Александрович , Мальцева Элина Романовна , Мамадалиев Сейдигапбар , Остапчук Екатерина Олеговна , Шапиева Жанна Жакановна , Исмагулова Гульнара Акимжановна , Низкородова Анна Сергеевна ,
0
0
0
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) МНВО РК
Full name of the service recipient
Товарищество с ограниченной ответственностью "Национальный центр биотехнологии"
Abbreviated name of the service recipient ТОО "Национальный центр биотехнологии"
Abstract

клещи (Acari), выделенные из них ДНК, сыворотки людей

кенелер (Acari), олардан бөлініп алынған ДНҚ, адамдардан алынған сарысулар

Изучение проблемы распространения боррелиоза и генетических характеристик его возбудителей для создания диагностических рекомендаций и совершенствования системы эпидемиологического надзора за боррелиозом в РК

Қазақстан Республикасында боррелиоздың эпидемиологиялық қадағалау жүйесін жетілдіру және диагностикалық ұсыныстар жасау үшін боррелиоздың таралу мәселесінің және оның қоздырғыштарының генетикалық сипаттамаларын зерттеу

сбор клещей, их морфологическая идентификация, картографический анализ, ГИС-технологии; выделение ДНК; спектрофотометрия, ИФА, методы описательной и аналитической эпидемиологии; биоинформатический анализ нуклеотидных последовательностей, статистические методы; ПЦР, ПЦР в реальном времени, электрофорез нуклеиновых кислот, секвенирование ДНК, филогенетический анализ

кенелерді жинау, олардың морфолигиялық түрлерін анықтау, картографиялық талдау, ГАЖ-технологиялар; ДНҚ бөліп алу; спектофотометрия, ИФТ, сипаттамалық және аналитикалық эпидемиология әдістері, нуклеотидтік тізбектердің биоинформатикалық талдауы, статистикалық әдістер; ПТР, нақты уақыттағы ПТР, нуклеин қышқылдарының электрофорезы, ДНҚ секвенирлеу, филогенетикалық талдау

: 1) Уточнены ареалы переносчиков Лайм-боррелиоза в РК. Собраны клещи (всего - 1652), определена их видовая принадлежность. 2) Из гомогенатов клещей выделены ДНК, которые протестироаны qPCR на присутствие ДНК Borrelia burgdorferii sensu lato. Общий уровень инфицированности клещей составил 5,41%; этот же показатель для Ixodes persulcatus составил 23,08%. 3) Проведено ПЦР-типирование ДНК боррелий для установления геновида (выявлены ДНК B. afzelii и B. garinii; B. afzelii доминировали). 4) Проведено секвенирование ПЦР-положительных образцов ДНК по локусу 16S rDNA. 5) Для трех образцов проведен MLSA/MLST-анализ. Проведен филогенетический анализ боррелий. 6) Собрано 886 образцов сывороток крови (589 – в Алматинской области и 72 – в Туркестанской области РК). 7) Проведены серологические исследования на присутсвие в сыворотках IgG (405 сывороток) и IgM (256 сывороток) к боррелиям. Общая серопозитивность (IgG к B. burgdorferii s.l.) в «здоровой» популяции составила 5,03% для Алматинской и 1,39% для Туркестанской области. В популяции людей в Алматинской области с подозрением на поздний/хронический нейроборрелиоз этот показатель состаавил 12,77%. Всего выявлено 9 IgM-положительных образцов по B. burgdorferii s.l. 8) Разработаны стандартные операционные процедуры для выявления Лайм-боррелиоза. 9) Разработано стандартное определение случая по Лайм-боррелиозу в Казахстане

ҚР Лайм-боррелиоз тасымалдаушыларының мекен ету ареалдары нақтыланды. Кенелер жиналды (барлығы - 1652), олардың түрлік қатынасы анықталды. 2) Кене гомогенаттарынан ДНҚ бөлініп алынды және Borrelia burgdorferii sensu lato ДНҚ-сының бар болуына qPCR арқылы талданды. Кенелердің жалпы инфекциялану деңгейі 5,41%-ды құрды; Ixodes persulcatus үшін нақ осы көрсеткіш 23,08% болды. 3) Генетикалық түрді анықтау үшін боррелиялардың ДНҚ-сына ПТР-типтеу жүргізілді (B. afzelii және B. garinii ДНҚ-лары анықталды; B. afzelii басым боды). 4) ПТР оң ДНҚ үлгілері үшін 16S rDNA локусы бойынша секвенирлеу жүргізілді. 5) Үш үлгіге MLSA/MLST-талдау және боррелиялардың филогенетикалық талдауы жүргізілді. 6) Қан сарысуының 886 үлгісі жиналды (ҚР Алматы облысынан – 589, Түркістан облысынан - 72) 7) Сарысуларда борелияларға IgG (405 сарысу) және IgM (256 сарысу) бар болуына серологиялық зерттеулер жүргізілді. Сау адамдар популяциясында жалпы серопозитивтік (B. burgdorferii s.l. қарсы IgG) Алматы облысында 5,03%, Түркістан облысында 1,39% құрды. Алматы облысының кеш/созылмалы нейроборрелиоз күдігі бар адамдар популяциясында бұл көрсеткіш 12,77% болды. Жалпы B. burgdorferii s.l. бойынша 9 IgM-оң үлгі анықталды. 8) Лайм-боррелиозды анықтауға стандартты жұмыс рәсімдері жасалды. 9) Қазақстандағы Лайм-боррелиоз бойынша стандартты жағдайды анықтау құрастырылды

не предусмотрено

қарастырылмаған

эпидемиология, вирусология, молекулярная медицина

эпидемиология, вирусология, молекулалық медицина

UDC indices
573.6; 616-093/-098; 579.083.13; 577.2.01
International classifier codes
34.15.23; 76.03.43; 34.27.59; 34.15.05;
Readiness of the development for implementation
Key words in Russian
Borrelia sp.; Клещевой боррелиоз; Болезнь Лайма; Диагностические тест-системы; Полногеномное секвенирование;
Key words in Kazakh
Borrelia sp.; Кене боррелиоз; Лайм ауруы; Диагностикалық тест-жүйелер; Толықгеномды секвенирлеу;
Head of the organization Раманкулов Ерлан Мирхайдарович Phd / Профессор
Head of work Скиба Юрий Александрович Кандидат биологических наук / нет
Native executive in charge Мальцева Элина Романовна магистр