Inventory number IRN Number of state registration
0220РК00127 AP05130238-OT-20 0118РК00928
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Заключительный Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 0
International publications: 2 Publications Web of science: 1 Publications Scopus: 2
Number of books Appendicies Sources
1 3 32
Total number of pages Patents Illustrations
52 0 6
Amount of funding Code of the program Table
6688989 AP05130238 5
Name of work
Протеогеномный анализ лекарственно-устойчивых штаммов Mycobacterium tuberculosis, циркулирующих в Казахстане
Report title
Type of work Source of funding The product offerred for implementation
Fundamental Метод, способ
Report authors
Тарлыков Павел Викторович , Абельденов Сайлау Касенович , Атавлиева Сабина Шамшиддинкызы , Актаева Сания Айдарбековна ,
0
0
1
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) МНВО РК
Full name of the service recipient
Товарищество с ограниченной ответственностью "Национальный центр биотехнологии"
Abbreviated name of the service recipient ТОО "Национальный центр биотехнологии"
Abstract

Объектом исследования являются клинические изоляты M. tuberculosis с различным спектром лекарственной чувствительности, а также музейный штамм H37Rv.

Зерттеу нысаны дәрілік сезімталдықтың әртүрлі спектрі бар M. tuberculosis клиникалық изоляттары, сондай-ақ h37rv мұражай штаммы болып табылады.

Цель работы – проведение комплексного молекулярно-генетического анализа лекарственно-устойчивых штаммов Mycobacterium tuberculosis, циркулирующих на территории Республики Казахстан.

Цель работы – проведение комплексного молекулярно-генетического анализа лекарственно-устойчивых штаммов Mycobacterium tuberculosis, циркулирующих на территории Республики Казахстан.

В процессе работы использовались такие молекулярно-генетические методы, как выделение ДНК, ПЦР, масс-спектрометрия, полногеномное секвенирование.

Зерттеу әдістері. Процесс барысында ДНҚ оқшаулау, ПТР, масс-спектрометрия, толық геномдық реттілік сияқты молекулалық-генетикалық әдістер қолданылды.

В результате исследований был проведен полногеномный анализ 13 коллекционных образцов M. tuberculosis для определения профиля резистентности, обуславливающего устойчивость к препаратам первого и второго ряда. На основе полногеномного секвенирования был проведен анализ мутаций в генах M. tuberculosis, обуславливающий устойчивость к препаратам первого и второго ряда, определен профиль резистентности 13 изолятов. Был разработан протокол сполиготипирования образцов M. tuberculosis. С помощью разработанного метода сполиготипирования на основе реакции удлинения зонда с последующим масс-спектрометрическим анализом проведено сполиготипирование 103 образцов M. tuberculosis, циркулирующих на территории Казахстана. Новизна полученных результатов заключается в применении современного подхода молекулярного типирования штаммов M. tuberculosis, основанного на использовании технологии полногеномного секвенирования, а также разработке метода сполиготипирования на основе масс-спектрометрического анализа, способного заменить классический гибридизационный метод.

Алынған нәтижелер. Зерттеулер нәтижесінде бірінші және екінші қатардағы препараттарға төзімділікті анықтайтын төзімділік профилін анықтау үшін M. tuberculosis 13 коллекциялық үлгілеріне толық геномдық талдау жүргізілді. Толық геномдық секвенирлеу негізінде M. tuberculosis гендеріндегі мутацияларға талдау жүргізілді, ол бірінші және екінші қатардағы препараттарға төзімділікті негіздейді, 13 изоляттың резистенттілік бейіні анықталды. M. tuberculosis үлгілерін сполиготиптеу хаттамасы жасалды. Әзірленген сполиготиптеу әдісінің көмегімен зондты ұзарту реакциясы негізінде кейіннен масс-спектрометриялық талдау арқылы Қазақстан аумағында айналатын M. tuberculosis 103 үлгісін сполиготиптеу жүргізілді. Алынған нәтижелердің жаңалығы толық геномдық секвенирлеу технологиясын пайдалануға негізделген M. tuberculosis штаммдарын молекулярлық типтеудің қазіргі заманғы тәсілін қолдану, сондай-ақ классикалық будандастыру әдісін алмастыра алатын масс-спектрометриялық талдау негізінде сполиготиптеу әдісін әзірлеу болып табылады.

Так как проект фундаментальный, степень внедрения результатов и основные технико-экономические показатели остаются невысокими.

Жоба іргелі болғандықтан, нәтижелерді енгізу дәрежесі мен негізгі техникалық-экономикалық көрсеткіштер жоғары емес.

Экономическая эффективность – в результате точного определения вида лекарственной устойчивости изолятов микобактерии исключается возможность неправильного назначения дорогостоящих лекарственных средств.

Экономикалық тиімділік – микобактерия изоляттарының дәрілік тұрақтылық түрін дәл анықтау нәтижесінде қымбат тұратын дәрілік заттарды дұрыс тағайындамау мүмкіндігі жоққа шығарылады.

Область применения – фтизиатрия

Қолдану саласы - фтизиатрия

UDC indices
577.29; 579.253
International classifier codes
34.27.29; 76.29.53;
Readiness of the development for implementation
Key words in Russian
Mycobacterium tuberculosis; протеом; масс-спектрометрия; секвенирование; сполиготипирование;
Key words in Kazakh
Mycobacterium tuberculosis; протеом; масс-спектрометрия; секвенирлеу; сполиготипирлеу;
Head of the organization Раманкулов Ерлан Мирхайдарович Phd / Профессор
Head of work Тарлыков Павел Викторович Ph.D / Ассоциированный профессор
Native executive in charge