Inventory number IRN Number of state registration
0325РК00292 AP23483825-KC-25 0124РК00635
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Краткие сведения Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 3
International publications: 0 Publications Web of science: 0 Publications Scopus: 0
Patents Amount of funding Code of the program
0 37800000 AP23483825
Name of work
Биологическое разнообразие видов рода Iris L. из Казахстана
Type of work Source of funding Report authors
Fundamental Альмерекова Шырын Семизбайкызы
0
0
1
1
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) МНВО РК
Full name of the service recipient
Республиканское Государственное предприятие на праве хозяйственного ведения "Институт Биологии и биотехнологии растений"
Abbreviated name of the service recipient РГП на ПХВ «ИББР»
Abstract

Виды рода Iris L., произрастающие в Казахстане.

Қазақстанда өсетін Iris L. туысы түрлері.

Изучить биоразнообразие видов Iris L. Казахстана с применением современных молекулярно-генетических технологий и биохимических методов.

Заманауи молекулалық-генетикалық технологиялар мен биохимиялық әдістерді қолдана отырып, Қазақстандағы Iris L. түрлерінің биоалуантүрлілігін зерттеу.

Сбор популяций, определение видовой принадлежности, экстракция ДНК, полимеразная цепная реакция (ПЦР), генотипирование с помощью SSR-маркеров, определение нуклеотидных последовательностей с использованием генетического анализатора ABI3130, полногеномное секвенирование нуклеотидных последовательностей (нп) хлоропластного (хп) генома с помощью технологии нового поколения. В работе использованы статистические прикладные программы BioEdit, MEGA, FigTree и др.

Популяцияларды жинау, түрлерді анықтау, ДНҚ бөлу, полимеразды тізбекті реакция (ПТР), SSR маркерлері арқылы генотиптеу, ABI3130 генетикалық анализаторы арқылы нуклеотидтер тізбегін (нт) анықтау, алдыңғы буын технологиясы бойынша хлоропласт (хп) геномының нуклеотидтер тізбегінің толық геномдық секвенирлеу. Жұмыста статистикалық қолданбалы BioEdit, MEGA, FigTree және т.б. бағдарламалары пайдаланылды.

Продолжен сбор растительного материала популяций видов Iris. Собрано 796 образцов 13 видов: I.kolpakowskiana, I.songarica, I.willmottiana, I.subdecolorata, I.halophila, I.lactea, I.pseudacorus, I.sibirica, I.pallasii, I.pumila, I.orchioides, I.albomarginata, I.kuschakewiczii. Просеквенировано 8 образцов по маркеру ITS для видов I.halophila, I.songarica, I.kuschakewiczii, I.lactea; 12 образцов по маркеру matK и 12 образцов по маркеру rbcL для I.kolpakowskiana. I.songarica, I.kuschakewiczii, I.tenuifolia, I.lactea; 10 образцов по psbA-trnH для I.kolpakowskiana. I.songarica, I.kuschakewiczii, I.tenuifolia, I.orchioides. По маркеру ITS в NCBI были депонированы нп I.halophila, PX467100 и I.sogdiana, PX467101. Нп маркеров matK и rbcL загружены под номерами 3015667 и 3015750, соответственно, для I.halophila, I.sogdiana, I.tenuifolia, I.kuschakewiczii. Определены нп хп геномов I.sogdiana, I.halophila, I.tenuifolia, I.kuschakewiczii. Аннотировано 133 гена: 87 белок-кодирующих, 38 тРНК и 8 рРНК. Депонированы хп геномы I.sogdiana, I.halophila, I.tenuifolia, и I.kuschakewiczii под номерами 3012642, 3012636, 3012645, и 3012650, соответственно. Проведено генотипирование 9 популяций I.kuschakewiczii с использованием 10 SSR-маркеров, из них 5 маркеров полиморфные. Также, выполнено генотипирование по 1 популяции I.sogdiana и I.halophila по 9 маркерам, 7 показали полиморфизм. Начат биохимический анализ видов I.songarica и I.tenuifolia на основе изучения вторичных метаболитов из листьев.

Iris жабайы түрінің популяциясынан өсімдік материалын жинау жалғасты. 13 түрден жалпы 796 үлгі жиналды: I.kolpakowskiana, I.songarica, I.willmottiana, I.subdecolorata, I.halophila, I.lactea, I.pseudacorus, I.sibirica, I.pallasii, I.pumila, I.orchioides, I.albomarginata, I.kuschakewiczii. ITS маркерімен I.halophila, I.songarica, I.kuschakewiczii, I.lactea түрлерінен сегіз үлгі; matK 12 және rbcL 12 үлгі келесі түрлер үшін – I.kolpakowskiana. I.songarica, I.kuschakewiczii, I.tenuifolia, I.lactea; I.kolpakowskiana. I.songarica, I.kuschakewiczii, I.tenuifolia, I.orchioides үшін psbA-trnH маркерімен 10 үлгі секвенирленді. I.halophila, PX467100 және I.sogdiana, PX467101 ITS нт NCBI енгізілді. matK және rbcL маркерінің нт I.halophila, I.sogdiana, I.tenuifolia және I.kuschakewiczii геномдары үшін 3015667 және 3015750 нөмірімен жүктелді. I.sogdiana, I.halophila, I.tenuifolia және I.kuschakewiczii хп геномының нт анықталды. Барлығы 133 генге аннотация жасалды: 87 ақуыз кодтайтын, 38 тРНҚ және 8 рРНҚ. I.sogdiana, I.halophila, I.tenuifolia және I.kuschakewiczii хп геномдары 3012642, 3012636, 3012645 және 3012650 нөмірлерімен депонирленді. I.kuschakewiczii 9 популяциясы 10 SSR маркерін пайдаланып генотиптелді, оның 5 полиморфты болды. 9 маркер бойынша I.sogdiana мен I.halophila түрлерінің әрбірінің бір популяциясы генотиптелді, оның 7 полиморфизмді көрсетті. Жапырақтан алынған екінші реттік метаболиттерді зерттеу I.songarica және I.tenuifolia түрлерінің биохимиялық талдауы басталды.

Коллекция 13 видов Iris – I. kolpakowskiana, I. songarica, I. willmottiana, I. subdecolorata, I. halophila, I. lactea, I. pseudacorus, I. sibirica, I. pallasii, I. pumila, I. orchioides, I. albomarginata, и I. kuschakewiczii.

13 Iris түрінің коллекциясы – I. kolpakowskiana, I. songarica, I. willmottiana, I. subdecolorata, I. halophila, I. lactea, I. pseudacorus, I. sibirica, I. pallasii, I. pumila, I. orchioides, I. albomarginata және I. kuschakewiczii.

Полученные нуклеотидные последовательности универсальных маркеров ядерного и хлоропластного генома, а также нуклеотидные последовательности хлоропластного генома были депонированы в международную базу данных NCBI.

Ядролық және хлоропласт геномының әмбебап маркерлерінің нуклеотидтік тізбектері, сондай-ақ хлоропласт геномының нуклеотидтік тізбектері NCBI халықаралық дерекқорына енгізілді.

Результаты исследований могут быть применимы для изучения молекулярной таксономии рода Iris и оценки генетического разнообразия в популяциях видов ирисов.

Зерттеу нәтижелері құртқашаш туысының молекулалық таксономиясын зерттеуге және құртқашаш түрлері популяцияларының генетикалық алуантүрлілігін бағалауға қолданылуы мүмкін.

Генетика, ботаника и фармакология.

Генетика, ботаника және фармакология.

UDC indices
575.174; 57.063
International classifier codes
34.15.23; 34.23.35; 87.35.29; 34.03.21;
Key words in Russian
Iris; генетическое разнообразие; структура популяций; полногеномное секвенирование; хлоропластный геном;
Key words in Kazakh
Iris; генетикалық алуантүрлілік; популяция құрылымы; толық геномдық секвенирлеу; хлоропластты геном;
Head of the organization Жамбакин Кабыл Жапарович Доктор биологических наук / профессор
Head of work Альмерекова Шырын Семизбайкызы PhD / Ассоциированный профессор