Inventory number IRN Number of state registration
0325РК00231 AP23488108-KC-25 0124РК00453
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Краткие сведения Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 0
International publications: 0 Publications Web of science: 0 Publications Scopus: 0
Patents Amount of funding Code of the program
0 41991301.4 AP23488108
Name of work
Сравнительное изучение противовирусной активности различных классов поликетидов
Type of work Source of funding Report authors
Fundamental Богоявленский Андрей Павлинович
0
2
0
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) Нет
Full name of the service recipient
ТОО "Научно-производственный центр микробиологии и вирусологии"
Abbreviated name of the service recipient ТОО "Научно-производственный центр микробиологии и вирусологии"
Abstract

вирусные инфекции, поликетиды различных классов

вирустық инфекциялар, әртүрлі класстардың поликетидтері

Сравнительное изучение противовирусного действия поликетидов разных групп, как основа для создания новых эффективных противовирусных препаратов

Жаңа тиімді вирусқа қарсы препараттарды құрудың негізі ретінде әртүрлі топтағы поликетидтердің вирусқа қарсы әсерін салыстырмалы зерттеу

Для изучения возможного противовирусного действия с использованием международных баз данных подобран широкий спектр поликетидов различных групп. Пространственное позиционирование лигандов с белками вируса гриппа проведено с использованием программ AutoDock Vina 1.1.2 http://vina.scripps.edu/, AutoDock Tools (ADT) http://mgltools.scripps.edu/downloads и PyMol. https://pymol.org/2/. Визуализация белок-лигандного комплекса производилась в программе PyMol. 2D визуализация белка с лигандом проводилась в программе LigPlot+ https://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/software/LigPlus/download2.html. Для оцкеки токсичности поликетидов разных классов использован инструментADMET (абсорбция, распределение, метаболизм, выведение и токсичность).

Ықтимал вирусқа қарсы әсерді зерттеу үшін халықаралық мәліметтер базасының көмегімен әртүрлі топтардың поликетидтерінің кең ауқымы таңдалды. Тұмау вирусының ақуыздары бар лигандтардың кеңістікте орналасуы AutoDock Vina 1.1.2 http://vina.scripps.edu/, AutoDock құралдары (ADT) http://mgltools.scripps.edu/downloads және PyMol бағдарламалары арқылы орындалды. https://pymol.org/2/. Протеин-лиганд кешенінің визуализациясы PyMol бағдарламасында орындалды. Лигандпен ақуыздың 2D визуализациясы LigPlot+ бағдарламасында https://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/software/LigPlus/download2.html орындалды. Әртүрлі кластағы поликетидтердің уыттылығын бағалау үшін ADMET құралы (сіңуі, таралуы, метаболизмі, шығарылуы және уыттылығы) пайдаланылды.

С помощью компьютерного моделирования проведено сравнительное изучение позиционирования низкомолекулярных соединений, относящихся к различным классам поликетидов (полиены, макролиды, статины, тетрациклины, ансамицины, полиэфиры, ацетогенины, полиолы) в активный центр белков гемагглютинина и нейраминидазы вирусов гриппа. Показано, что независимо от типа углеродного скелета, поликетиды способны в той или иной степени влиять на структуру белков оболочки вируса гриппа. Отобраны соединения, способные формировать ковалентные связи с гликопротеидами вируса гриппа. На модели отобранных препаратов с максимальной способностью влиять на структуру вирусных белков проведен анализ стимуляции молекулярной динамики Моделирование молекулярной динамики показало, что связывание полиеновых антибиотиков с вирусными белками демонстрируют наибольшую стабильность с минимальными флуктуациями RMSD и умеренной гибкостью, что имеет значение для разработки лекарственных средств.. Проведена оценка токсичности поликетидов разных классов с помощью компьютерного моделирования ADMET (абсорбция, распределение, метаболизм, выведение и токсичность). При оценке более 13 показателей показано, что, несмотря на на мембранотропность поликетидов, в целом, они соответствуют требованиям лекарственных препаратов

Компьютерлік модельдеуді пайдалана отырып, гемагглютининдер мен нейроминидоз протеиндерінің вирустарының белсенді орнында поликетидтердің (полиендер, макролидтер, статиндер, тетрациклиндер, ансамициндер, полиэфирлер, ацетогениндер және полиолдар) әртүрлі кластарына жататын төмен молекулалы қосылыстардың орналасуына салыстырмалы зерттеу жүргізілді. Көміртек қаңқасының түріне қарамастан, поликетидтер тұмау вирусының қабықшасының ақуыздарының құрылымына әртүрлі дәрежеде әсер ете алатыны көрсетілді. Тұмау вирусының гликопротеиндерімен коваленттік байланыс түзуге қабілетті қосылыстар таңдалды. Молекулалық динамиканы модельдеу полиенді антибиотиктердің вирустық ақуыздармен байланысуы ең аз RMSD ауытқуларымен және орташа икемділікпен ең үлкен тұрақтылықты көрсететінін көрсетті, бұл дәрілік заттардың дамуына әсер етеді.. ADMET компьютерлік модельдеу (сіңіру, тарату, метаболизм, жою және уыттылық) көмегімен әртүрлі кластағы поликетидтердің уыттылығын бағалау жүргізілді. 13-тен астам көрсеткішті бағалау кезінде поликетидтердің мембранотроптылығына қарамастан, олар жалпы дәрілік заттардың талаптарына сәйкес келетіндігі көрсетілген

Показано, что изменение структуры поликетидов тесным образом влияет на степень их взаимодействия с вирусными белками. Изменение гидрофобности структуры поликетида ведет к увеличению противовирусных свойств на модели оболочечных вирусов, свидетельствуя о преимущественно мембранотропной активности структуры поликетидов.

Поликетидтердің құрылымындағы өзгерістер олардың вирустық ақуыздармен әрекеттесу дәрежесіне тығыз әсер ететіні көрсетілген. Поликетид құрылымының гидрофобтылығының өзгеруі қабықшалы вирустар үлгісінде вирусқа қарсы қасиеттердің жоғарылауына әкеледі, бұл поликетидтік құрылымның басым мембранотропты белсенділігін көрсетеді.

Не применимо

Қолданылуы мүмкін емес

Не применимо

Қолданылуы мүмкін емес

Фундаментальные научные исследования в области биологии

Биология саласындағы іргелі ғылыми зерттеулер

UDC indices
615.281.8, УДК 574.1
International classifier codes
34.25.00;
Key words in Russian
Поликетиды; противовирусная активность; Компьютерное моделирование; ADMET; молекулярная динамика;
Key words in Kazakh
Поликетидтер; вирусқа қарсы белсенділік; компьютерлік модельдеу; ADMET; молекулалық динамика;
Head of the organization Саданов Аманкелди Курбанович Доктор биологических наук / профессор, академик КазНАЕН
Head of work Богоявленский Андрей Павлинович Доктор биологических наук / профессор