Inventory number IRN Number of state registration
0225РК00134 AP19677163-OT-25 0123РК00515
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Заключительный Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 1
International publications: 2 Publications Web of science: 1 Publications Scopus: 1
Number of books Appendicies Sources
1 7 110
Total number of pages Patents Illustrations
105 0 15
Amount of funding Code of the program Table
35588528 AP19677163 8
Name of work
Разработка SNP-маркеров по признаку засухоустойчивости на основе полногеномного анализа ассоциаций (GWAS) для применения в маркер-опосредованной селекции сои (Glycine max L.)
Report title
Type of work Source of funding The product offerred for implementation
Fundamental Метод, способ
Report authors
Ержебаева Раушан Сайлаувна , Дидоренко Светлана Владимировна , Мазқират Шынар , Амангелдиева Айгүл Айдарқызы , Майкотов Бекжан Нурқадамұлы , Дженисбаева Асель Муратовна , Касенов Ринат Жанасилович , Берсимбаева Гульнара Хабибуллаевна ,
0
4
1
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) МСХ РК
Full name of the service recipient
Товарищество с ограниченной ответственностью"Казахский научно-исследовательский институт земледелия и растениеводства"
Abbreviated name of the service recipient ТОО "КазНИИЗиР"
Abstract

188 образцов коллекции сои, гибридные популяции сои

соя коллекциясының 188 үлгісі, сояның гибридті популяциясы

Поиск генов-кандидатов засухоустойчивости сои (Glycine max L.), связанных с урожайностью семян и ее компонентами на основе полногеномного анализа ассоциаций (GWAS) и создание информативных SNP-маркеров для использования в маркер-опосредованной селекции.

Ассоциациялардың толық геномдық талдауы (GWAS) негізінде тұқым өнімділігі және оның компоненттерімен байланысты сояның (Glycine max L.), құрғақшылыққа төзімді ген-кандидаттарды іздеу және маркерлік селекцияда пайдалану үшін ақпараттық SNP-маркерлерін жасау.

Далалық эксперименттер, өнімділікті және оның компоненттерін бағалау, 295k DArT көмегімен генотиптеу, GAPIT пакетін (Нұсқа 3) қолдана отырып, ассоциациялардың толық геномдық талдау, сандық ПТР, кластерлік, дисперсиялық, корреляциялық талдау негізінде деректерді статистикалық өңдеу.

Полевые эксперименты, оценка урожайности и ее компонентов, генотипирование с использованием 295K DArT, полногеномный анализ ассоциаций с использованием пакета GAPIT (версия 3), количественная ПЦР, статистическая обработка данных на основе кластерного, дисперсионного, корреляционного анализа.

188 образцов сои различного происхождения были оценены по урожайности и восьми компонентам урожайности в условиях орошения и отсутствия орошения (засуха) в течение 2 лет в полевых испытаниях на юго-востоке Казахстана. Генотипирование 188 образцов сои проведено с использованием технологии 295K Diversity Array Technology (DArT). В результате полногеномного анализа ассоциаций с использованием данных генотипирования по 16K-фильтрованным DArT-маркерам и фенотипирования по 9 признакам урожайности был идентифицирован 41 QTN. Оценка объединенных результатов GWAS и BSA выявила 10 наиболее значимых QTN и восемь наиболее перспективных предполагаемых генов-кандидатов. Результаты анализа qRT-PCR подтвердили вовлеченность выделенных восьми генов в регуляцию устойчивости к засухе. Разработаны и апробирована эффективность 6 SNP–маркеров. По результатам исследований опубликованы 6 статей и тезисов, в том числе 2 статьи в рецензируемых журналах входящих в первый квартиль (Q1) базы Scopus, 1 статья в журнале КОКСНВО, 1 статья в журнале входящий в RSCI. Получен патент и авторское свидетельство на селекционное достижение засухоустойчивый сорт сои «Северное сияние».

Қазақстанның оңтүстік-шығысындағы далалық сынақтарда 2 жыл бойы суару және суармау (құрғақшылық) жағдайында шығу тегі әр түрлі сояның 188 үлгісі өнімділік және өнімділіктің сегіз компоненті бойынша бағаланды. Сояның 188 үлгісін генотиптеу 295k Diversity Array Technology (DArT) технологиясын қолдану арқылы жүргізілді. 16K-фильтрленген DArT маркерлері бойынша генотиптеу және 9 өнімділік белгісі бойынша фенотиптеу деректерін пайдалана отырып, ассоциациялардың толық геномдық талдауы нәтижесінде 41 QTN анықталды. GWAS және BSA біріктірілген нәтижелерін бағалау ең маңызды 10 QTN және ең перспективалы сегіз болжамды ген-кандидаттарды анықтады. qRT-PCR талдауының нәтижелері таңдалған сегіз геннің құрғақшылыққа төзімділікті реттеуге қатысуын растады. 6 SNP-маркерлердің тиімділігі әзірленді және сыналды. Зерттеу нәтижелері бойынша 6 мақалалар мен тезистер, оның ішінде Scopus базасының бірінші квартиліне (Q1) кіретін рецензияланатын журналдарда 2 мақала, БҒССҚК ұсынған басылымдар тізіміне кіретін журналында 1 мақала, RSCI құрамына кіретін журналда 1 мақала жарияланды. Құрғақшылыққа төзімді соя «Северное сияние» сортының селекциялық жетістігі үшін патент пен авторлық куәлік алынды.

Выделены засухоустойчивые сорта сои, которые рекомендуются фермерам для возделывания и получения рентабельного урожая. Разработаны SNP-маркеры, которые рекомендуются для использования в МАС-селекции для отбора засухоустойчивых генотипов.

Құрғақшылыққа төзімді соя сорттары анықталып, шаруаларға өсіріп, тиімді өнім алу үшін ұсынылды. SNP маркерлері әзірленді және құрғақшылыққа төзімді генотиптерді таңдау үшін MAS селекциясында қолдануға ұсынылады.

не предусмотрено

не предусмотрено

Информативные SNP-маркеры могут быть использованы в селекционных программах, направленных на повышение засухоустойчивости сои.

Ақпараттық SNP-маркерлерін сояның құрғақшылыққа төзімділігін арттыруға бағытталған селекциялық бағдарламаларда қолдануға болады.

MAS-cелекция сои, генетика и селекция сои

сояның MAS-cелекциясы, сояның генетикасы мен селекциясы

UDC indices
633.81/85:631.52:577.21
International classifier codes
68.35.37; 34.23.57; 34.15.23;
Readiness of the development for implementation
Key words in Russian
коллекция; гибридные популяции; соя; засуха; орошение; урожайность семян; компоненты урожайности; полногеномный анализ ассоциаций; ген-кандидат; экспрессия гена; SNP-маркер;
Key words in Kazakh
коллекция; гибридті популяциялар; қытай бұршақ; құрғақшылық; суару; тұқым өнімділігі; өнімділік компоненттері; ассоциациялардың толық геномдық талдауы; ген-кандидат; геннің экспрессиясы; SNP-маркер;
Head of the organization Бастаубаева Шолпан Оразовна Кандидат сельскохозяйственных наук / академик АСХН РК
Head of work Ержебаева Раушан Сайлаувна Кандидат биологических наук / нет
Native executive in charge