Inventory number IRN Number of state registration
0324РК01415 AP19678812-KC-24 0123РК00297
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Краткие сведения Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 2
International publications: 1 Publications Web of science: 0 Publications Scopus: 0
Patents Amount of funding Code of the program
0 35000000 AP19678812
Name of work
Использование генетических и биоинформационных методов для идентификации возбудителей зооантропонозных микозов промысловых и сельскохозяйственных животных, циркулирующих на территории Казахстана
Type of work Source of funding Report authors
Fundamental Кухар Елена Владимировна
1
1
1
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) МСХ РК
Full name of the service recipient
Казахский агротехнический исследовательский университет имени Сакена Сейфуллина
Abbreviated name of the service recipient НАО «КАТИУ им. С.Сейфуллина»
Abstract

дерматомицеты, плесневые грибы, дрожжи, классические и оппортунистические возбудителей микозов людей, диких и сельскохозяйственных животных, геномная ДНК, маркерные участки генома

дерматомицеттер, зеңдер, ашытқылар, адамдардың, жабайы және ауылшаруашылық жануарларының микоздарының классикалық және оппортунистік қоздырғыштары, геномдық ДНҚ, геномның маркер аймақтары

На 2 год исследований ставилась цель провести характеристику и сравнительный анализ биологических и патогенных свойств возбудителей, выделенных от животных; отработка протоколов и методов выделения геномной ДНК возбудителей микозов и создание коллекции; проведение ПЦР анализа для наработки ампликонов маркерных участков генома возбудителей классических и оппортунистических микозов

Зерттеудің 2 жылында жануарлардан оқшауланған қоздырғыштардың биологиялық және патогендік қасиеттеріне сипаттама мен салыстырмалы талдау жүргізу; микоз қоздырғыштарының геномдық ДНҚ оқшаулау хаттамалары мен әдістерін пысықтау және коллекция құру; классикалық және оппортунистік микоз қоздырғыштарының геномының маркерлік учаскелерінің ампликондарын жасау үшін ПТР талдау жүргізу мақсаты қойылды.

Микологические, биотехнологические, молекулярно-генетические: Отбор проб и первичное выделение возбудителя. Получение чистой культуры, культурально-морфологическая характеристика штаммов микромицетов, анализ ферментативной активности и степени патогенности грибов, изучение чувствительности к антимикотикам чистых культур дерматомицетов. Выделение ДНК и постановка ПЦР-анализа.

Микологиялық, биотехнологиялық, молекулалық-генетикалық: сынамаларды алу және патогенді бастапқы оқшаулау: Таза дақыл алу, микромицет штаммдарының мәдени-морфологиялық сипаттамасы, саңырауқұлақтардың ферментативті белсенділігі мен патогенділік дәрежесін талдау, таза дерматомицет дақылдарының антимикотиктерге сезімталдығын зерттеу. ДНҚ оқшаулау және ПТР талдауын құру

Отобрано 239 образцов биоматериала от людей, животных и объектов внешней среды. Проведено первичное установление таксономической принадлежности 204 возбудителей микозов. Изучены биологические и патогенные свойства 74 изолятов дерматомицетов. Установлено наличие ферментативной активности: сахаролитическая – 89,1%, коллагеназная – у 63,4%, казеинолитическая – 54,0%, уреазная – у 55,9%, кератинолитическая – 21,8%. Выявлена устойчивость к антимикотикам у 25% штаммов возбудителей. Отработаны протокола и методы выделения геномной ДНК. От дерматомицетов выделена ДНК в концентрации от 0,7 до 416,4 нг/мкл с частотой 1,65-1,9 по ОП, от остальных микромицетов – 429,2 до 2258,2 нг/мкл. Синтезированы специфические и видовые праймеры для выделения ДНК и проведения ПЦР анализа. Лучшие результаты показали праймеры ITS1/ITS4 и Pan_derm2. Подобраны и оптимизированы параметры постановки ПЦР анализа для маркерного гена Pan-derm Наработаны ампликоны специфических маркерных генов для их секвенирования. Собрана коллекция штаммов возбудителей. Создана коллекция геномной ДНК возбудителей микозов в количестве 87 образцов. Опубликована 1 (одна) статья в рецензируемом отечественном издании, рекомендованном КОКСОН, 2 тезиса в сборниках конференций

Адамдардан, жануарлардан және сыртқы орта объектілерінен биоматериалдың 239 үлгісі алынды. Микоздардың 204 қоздырғышының таксономиялық тиістілігін бастапқы анықтау жүргізілді. 74 дерматомицет изоляттарының биологиялық және патогендік қасиеттері зерттелді. Ферментативті белсенділіктің болуы анықталды: сахаролитикалық – 89,1%, коллагеназа – 63,4%, казеинолитикалық – 54,0%, уреаза – 55,9%, кератинолитикалық – 21,8%. Патогендік штамдардың 25% - у антимикотиктерге төзімділік анықталды. Геномдық ДНҚ-ны оқшаулау хаттамалары мен әдістері пысықталды. Дерматомицеттерден ДНҚ 0,7-ден 416,4 нг/мкл – ге дейін, жиілігі 1,65-1,9 ОП бойынша, қалған микромицеттерден-429,2-ден 2258,2 нг/мкл-ге дейінгі концентрацияда оқшауланған. ДНҚ оқшаулау және ПТР талдауын жүргізу үшін арнайы және түрлік праймерлер синтезделді. Ең жақсы нәтижелер its1/ITS4 және Pan_derm2 праймерлерін көрсетті. Pan-derm маркер гені үшін ПТР талдауын қою параметрлері таңдалды және оңтайландырылды, оларды ретке келтіру үшін арнайы маркер гендерінің ампликондары жасалды. Патогендердің штаммдарының жинағы жинақталған. 87 үлгідегі микоз қоздырғыштарының геномдық ДНҚ жинағы жасалды. КОКСОН ұсынған рецензияланған отандық басылымда 1 (бір) мақала, конференция жинақтарында 2 тезис жарияланды.

Характеристика и сравнительный анализ биологических и патогенных свойств 204 штаммов возбудителей, выделенных от людей, сельскохозяйственных и диких животных. Отработка протоколов и методов выделения геномной ДНК возбудителей микозов и создание двух коллекций. Проведение ПЦР анализа для наработки ампликонов маркерных участков генома возбудителей классических и оппортунистических микозов с праймерами ITS1/ITS4 и Pan_derm2. Выявление устойчивости к противогрибковым препаратам у 25% штаммов дерматомицетов.

Адамдардан, ауылшаруашылық және жабайы жануарлардан оқшауланған 204 қоздырғыш штаммының биологиялық және патогендік қасиеттерін сипаттау және салыстырмалы талдау. Микоз қоздырғыштарының геномдық ДНҚ-сын оқшаулау хаттамалары мен әдістерін әзірлеу және екі жинақ жасау. ITS1/ITS4 және Pan_derm2 праймерлерімен классикалық және оппортунистік микоз қоздырғыштарының геномының маркерлік учаскелерінің ампликондарын жасау үшін ПТР талдау жүргізу. Дерматомицет штамдарының 25% - ында саңырауқұлаққа қарсы препараттарға төзімділікті анықтау.

Апробация результатов на международной конференции, публикация одной статьи в рецензируемом отечественном издании, рекомендованном КОКСОН и 2 тезисов в материалах конференций

Халықаралық конференцияда нәтижелерді апробациялау, КОКСОН ұсынған рецензияланатын отандық басылымда бір мақаланы және конференция материалдарында 2 тезисті жариялау

Новые сведения о возбудителях микозов кожи и их патогенных свойствах. Выявление чувствительности к противогрибковым препаратам у 25% возбудителей дерматомикозов

Тері микоздарының қоздырғыштары және олардың патогендік қасиеттері туралы жаңа мәліметтер. Дерматомикоз қоздырғыштарының 25% - у саңырауқұлаққа қарсы препараттарға сезімталдықты анықтау

Ветеринарные и медицинские диагностические лаборатории, научно-исследовательские организации

Ветеринариялық-емдік диагностикалық зертханалар, ғылыми-зерттеу ұйымдары

UDC indices
579.8-579.62
International classifier codes
34.15.23;
Key words in Russian
микозы; дерматомикозы; оппортунистические микозы; природные очаги; зооантропонозы; ПЦР-анализ; секвенирование; маркерные участки гена; биоинформатический анализ;
Key words in Kazakh
микоздар; дерматомикоздар; оппортунистік микоздар; табиғи ошақтар; зооантропоноздар; ПТР талдауы; реттілік; геннің маркер аймақтары; биоинформатикалық талдау;
Head of the organization Тиреуов Канат Маратович Доктор экономических наук / профессор
Head of work Кухар Елена Владимировна Доктор биологических наук / доцент