The object of research, development or design (in Russian) : ДНК Babesia spp

The object of research, development or design (in Kazakh) : Babesia spp ДНҚ-сы.

Aim of work (in Russian) : Изучение видового разнообразия Babesia spp на территории Казахстана и разработка мультиплекс ПЦР тест-системы для дифференциальной диагностики бабезиозов КРС

Aim of work (in Kazakh) : Қазақстан аумағындағы Babesia spp түрлік алуантүрлілігін зерттеу және ірі қара мал бабезиозын дифференциалды диагностикалауға арналған мультиплексті ПТР тест-жүйесін әзірлеу.

Методы исследования (на русском) : Применялись молекулярно-генетические методы исследований

Методы исследования (на казахском) : Зерттеулер барысында молекулалық-генетикалық зерттеу әдістері қолданылды

Obtained results and novelty (in Russian) : Проведено ПЦР тестирование 7000 проб ДНК выделенной из цельной крови КРС на наличие ДНК паразитов рода Babesia spp. ПЦР тестирование проводили с использованием универсальных праймеров подобранных к роду Babesia spp. Видовая принадлежность установлена методом прямого секвенирования. Установлено, что наиболее распространенными видами бабезии являются: Babesia bigemina, Babesia major, Babesia occultans. Проведен подбор праймеров и флуоресцентных TaqMan зондов для выявления Babesia bigemina, Babesia major, Babesia occultans. К каждому возбудителю было подобрано по 2 пары праймеров и по два флуоресцентных TaqMan зонда. Расчетная температура отжига праймеров составляла от 58 до 62ºС, праймеры не образуют тугоплавкие димеры при проверке в PrimerSelect (Lasergene, DNASTAR). При проверке в PrimerBLAST, подобранные праймеры приводят к образованию соответсвеющих ПЦР продуктов только в Babesia bigemina, Babesia major, Babesia occultans. Оптимизацию ПЦР с детекцией в режиме реального времени для выявления и видовой идентификации превалирующих патогенных видов Babesia spp проводили по температуре отжига праймеров и программе ПЦР циклирования, а также составу ПЦР реакции. Диапазон температурного градиента расчитывали на основании расчетной температуры отжига праймеров в PrimerBlast. При оптимизации выявили что оптимальная температура отжига праймеров для 3 пар праймеров составляла 60°С, 61ºС для 2 пар праймеров и 59ºС для 1 пары праймеров.

Obtained results and novelty (in Kazakh) : Ірі қара малдың тұтас қанынан бөлінген 7000 ДНҚ үлгісіне Babesia spp тектес паразиттердің ДНҚ-сын анықтау үшін ПТР тестілеуі жүргізілді. ПТР тестілеуі Babesia spp түрі үшін арнайы таңдалған әмбебап праймерлерді пайдалану арқылы жүзеге асырылды. Түрлік тиесілілік тікелей секвенирлеу әдісімен анықталды. Нәтижесінде, бабезиялардың ең көп таралған түрлері Babesia bigemina, Babesia major және Babesia occultans екені анықталды. Babesia bigemina, Babesia major, Babesia occultans анықтау үшін праймерлер мен флуоресцентті TaqMan зондтарын таңдау жүргізілді. Әрбір қоздырғышқа 2 жұп праймер және екі флуоресцентті TaqMan зонды таңдалды. Праймерлердің шамаланған отжиг температурасы 58-ден 62ºС-қа дейін болды, және PrimerSelect (Lasergene, DNASTAR) бағдарламасында тексерілгенде праймерлер қиын балқитын димерлер түзбеді. PrimerBLAST арқылы тексеру кезінде таңдалған праймерлер тек Babesia bigemina, Babesia major және Babesia occultans үшін сәйкес ПТР өнімдерін берді. Нақты уақыттағы детекциясы бар ПТР-ды оңтайландыру патогенді Babesia spp басым түрлерін анықтау және түрлік идентификациялау үшін праймерлердің отжиг температурасы, ПТР циклдеу бағдарламасы және ПТР реакциясының құрамы бойынша жүргізілді. Температуралық градиент диапазоны PrimerBlast арқылы есептелген праймерлердің отжиг температурасына негізделді. Оңтайландыру нәтижесінде 3 праймер жұбы үшін оңтайлы отжиг температурасы 60°С, 2 праймер жұбы үшін 61ºС, және 1 праймер жұбы үшін 59ºС екені анықталды.

The main constructive and technical economic indicators (in Russian) : Подобраны праймеры и флуоресцентных TaqMan зондов для выявления Babesia bigemina, Babesia major, Babesia occultans.

The main constructive and technical economic indicators (in Kazakh) : Babesia bigemina, Babesia major, Babesia occultans анықтау үшін праймерлер мен флуоресцентті TaqMan зондтары таңдалды.

Level of implementation (in Russian) :

Level of implementation (in Kazakh) :

Efficiency (in Russian) : Использование специфичных праймеров и флуоресцентных TaqMan зондов позволит проводить оценку видового разнообразия Babesia spp

Efficiency (in Kazakh) : Арнайы праймерлер мен флуоресцентті TaqMan зондтарын қолдану Babesia spp түрлік алуантүрлілігін бағалауға мүмкіндік береді.

Field of application (in Russian) : Ветеринария

Field of application (in Kazakh) : Ветеринария