Inventory number IRN Number of state registration
0219РК00519 BR05236307-OT-19 0118РК00943
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Промежуточный Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 0
International publications: 0 Publications Web of science: 0 Publications Scopus: 0
Number of books Appendicies Sources
1 1 36
Total number of pages Patents Illustrations
33 0 7
Amount of funding Code of the program Table
31570000 О.0810 4
Code of the program's task under which the job is done
06
Name of work
Разработка ПЦР тест- системы для выявления Streptococcus equi при диагностике мыта лошадей.
Report title
Type of work Source of funding The product offerred for implementation
Applied research Метод, способ
Report authors
Шевцов Александр Борисович , Бердимуратова Калыш Тлеухановна , Рыскельдина Анара Жанкожаевна , Махамед Риза , Луцай Виктория Борисовна , Ташкенбаев Арман Собетбекович ,
0
0
0
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) МНВО РК
Full name of the service recipient
Товарищество с ограниченной ответственностью "Национальный центр биотехнологии"
Abbreviated name of the service recipient ТОО "Национальный центр биотехнологии"
Abstract

Объектами исследования являлись образцы ДНК: S. еqui, сапрофитной и патогенной микрофлоры.

Зерттеу нысандары ретіне S. equi, сапрофитті және патогенді микрофлораның ДНҚ сынамалары алынды.

Цель этапа – Подбор праймеров и флуоресцентно-меченых зондов для выявления Streptococcus equi методом ПЦР с детекцией в режиме реального времени и оптимизация условий постановки ПЦР с детекцией в режиме реального времени, оценка чувствительности и специфичности.

Кезең мақсаты – Streptococcus equi subsp. equi нақты уақыт кезіндегі ПТР әдісі арқылы айқындау үшін праймерлер мен флуоресцентті-таңбаланған зондтартарды іріктеп алу және нақты уақыт кезіндегі ПТР жүргізу шарттарын оңтайландыру. Әзірленген протоколдардың сезімталдығы мен ерекшелігіне баға беру.

Задачи были выполнены с использованием молекулярно-генетических и информационных методов.

Міндеттер молекулалы - генетикалық және ақпараттық әдістер арқылы жүзеге асырылды.

В отчетный период проведен подбор праймеров и флуоресцентно-меченых зондов для выявления и видовой дифференциации Streptococcus equi subsp. equi методом ПЦР с детекцией в режиме реального времени. Подобраны 6 пар праймеров и 3 флуоресцентных зонда. Оптимизированы условия постановки ПЦР с детекцией в режиме реального времени и разработаны два «мультиплексных» протокола. Проведена оценка специфичности разработанных условий постановки ПЦР на 95 коллекционных образцах ДНК. Установлено, что ПЦР протоколы с электрофоретической детекцией и детекцией в режиме реального времени с праймерами sodA_F, sodA_R, S_equi_F, S_equi_R, S_zooep_F, S_zooep_R и соответствующими зондами строго специфичны. Проведена оценка чувствительности разработанных ПЦР протоколов, предельная чувствительность к ДНК S.equi subsp. equi составила 66 копий. Новизна результатов: подобраны оригинальные праймеры и флуоресцентные зонды, а также оптимизированы условия ПЦР в режиме реального времени для диагностики мыта лошадей.

Есеп кезінде Streptococcus equi subsp. equi нақты уақыт кезіндегі ПТР әдісі арқылы айқындау үшін праймерлер мен флуоресцентті-таңбаланған зондтардтарды іріктеу жүргізілді. 6 жұп праймерлер мен 3 флуоресцентті зондтар іріктеп алынды. Нақты уақыт кезіндегі ПТР жүргізу шарттары оңтайландырылып, екі мультиплексті протокол әзірленді. 95 ДНҚ үлгілер топтамасына ПЦР жүргізу арқылы әзірленген шарттардың ерекшелігіне баға берілді. Нәтижесінде электрофоретикалық және нақты уақыт кезіндегі электрофорез арқылы sodA_F, sodA_R, S_equi_F, S_equi_R, S_zooep_F, S_zooep_R праймерлерін және сәкесінше флуоресценциялық зондтарын қолдану арқылы олардың қатаң түрде ерекшелікке ие болатыны айқындалды. Әзірленген ПТР протоколдарының сезімталдығына баға берілді. S.equi subsp. equi ДНҚ-ының сезімталдығынң ең аз мөлшері 66 копия. Алынған нәтижелердің жаңашылдығы: түпнұсқалық праймерлер таңдалып, жылқы сақауы ауруының диагностикасын жүргізу үшін ПТР шарттары оңтайландырылды.

Реализация проекта и последующее производство позволит внедрить в ветеринарную диагностическую практику ПЦР тест-систему, обладающую высокой специфичностью и чувствительностью. Отечественная тест-система позволит сократить себестоимость диагностики. Возможен эффект импортозамещения.

Жобаны жүзеге асыру және одан кейінгі өндіруарқылы ветеринарлық диагностика тәжірибесіне жоғары ерекшелікке және сезімталдыққа ие ПТР тест-жүйелерін енгізуге мүмкіндік береді. Отандық тест-жүйе әзірлеу диагностиканың өзіндік құнын төмендетеді. Сонымен қатар импортқа шығарылуына мүмкіндік береді.

Область применения: ветеринария, лабораторная диагностика.

Қолдану аумағы: ветеринария, зертханалық диагностика.

UDC indices
619:616-07, 619:579.62
International classifier codes
68.41.41; 68.41.35;
Readiness of the development for implementation
Key words in Russian
ПОЛИМЕРАЗНАЯ ЦЕПНАЯ РЕАКЦИЯ; ЛОШАДИНЫЙ МЫТ; STREPTOCOCCUS EQUI; ДНК; ТЕСТ-СИСТЕМА;
Key words in Kazakh
ПОЛИМЕРАЗДЫ ТІЗБЕКТІК РЕАКЦИЯ; ЖЫЛҚЫ САҚАУЫ; STREPTOCOCCUS EQUI; ДНҚ; ТЕСТ-ЖҮЙЕ;
Head of the organization Раманкулов Ерлан Мирхайдарович PhD / профессор
Head of work Шевцов Александр Борисович Кандидат биологических наук / ассоциированный профессор
Native executive in charge Бердимуратова Калыш Тлеухановна Магистр