Inventory number | IRN | Number of state registration | ||
---|---|---|---|---|
0324РК00008 | AP23484684-KC-24 | 0124РК00312 | ||
Document type | Terms of distribution | Availability of implementation | ||
Краткие сведения | Gratis | Number of implementation: 0 Not implemented |
||
Publications | ||||
Native publications: 0 | ||||
International publications: 1 | Publications Web of science: 1 | Publications Scopus: 1 | ||
Patents | Amount of funding | Code of the program | ||
0 | 33949792.75 | AP23484684 | ||
Name of work | ||||
Молекулярная эпизоотология вирусов диких птиц, ассоциированных с их массовой гибелью | ||||
Type of work | Source of funding | Report authors | ||
Fundamental | Карамендин Кобей Омертаевич | |||
0
0
0
0
|
||||
Customer | МНВО РК | |||
Information on the executing organization | ||||
Short name of the ministry (establishment) | Нет | |||
Full name of the service recipient | ||||
ТОО "Научно-производственный центр микробиологии и вирусологии" | ||||
Abbreviated name of the service recipient | ТОО "Научно-производственный центр микробиологии и вирусологии" | |||
Abstract | ||||
Биологические пробы от диких птиц Жабайы құстардан алынған биологиялық сынамалар Изучить процессы изменения вирома, микробиома и квазивидового состава вирусов, происходящих в организме диких птиц во время массовых падежей. Жабайы құстардың организмінде жаппай қырылу кезінде болатын виром, микробиом және квазитүрлік құрамы өзгеру процестерін зерттеу. В работе применяли вирусологические и молекулярно-биологические методы исследования, а также массовое параллельное секвенирование Біз вирусологиялық және молекулалық биологиялық зерттеу әдістерін, сондай-ақ жаппай параллельді секвендеуді қолдандық. Сформирована выборка изолятов вируса гриппа птиц подтипаH5 от чегравы, черноголового хохотуна и лебедя кликуна. На вирус болезни Ньюкасла и аденовирус сформированы выборка из материалов от большого баклана. Проведены их восстановительные пассажи на клеточных культурах и куриных эмбрионах. Для исследований взяты пробы в виде смывов, сывороток крови и желтков от особей 3 видов (Phalacrocorax carbo / Большой баклан, Hydropogne caspia / Чеграва и Cygnus cygnus / Лебедь кликун), принадлежащих к отрядам Пеликановые и Гусеобразные. Для секвенирования вирома в исследованных образцах, выделены вируссодержащие нуклеиновые кислоты с использованием набора QIAamp Viral RNA Mini kit (Qiagen, Hilden, ФРГ) в соответствии с рекомендациями производителя. Предварительно образцы фильтровали, центрифугировали и обработали нуклеазами. Для синтеза двуцепочечной ДНК использовали метод единственного праймера Sequence Independent Single Primer Amplification (SISPA). Синтез библиотек осуществляли с помощью набора NEBNext Ultra Directional DNA Library Prep Kit for Illumina (NEB, США). Результаты биоинформационного анализа показали наличие нескольких квазивидов H5 и вируса болезни Ньюкасла, а также аденовируса бакланов в исследованных образцах. Серологические исследования выявили носительство антител к подтипу Н5 в образцах от диких птиц. Өгіз шағалалардан, үлкен қарқылдақ шағалалардан және аққулардан Н5 тип тармағы құс тұмауы вирусының изоляттарының іріктемесі құрастырылды. Ньюкасл ауруы вирусы мен аденовирусқа арналған іріктеме су құзғыны материалдарынан жиналды. Олардың қалпына келтіру үшін жасуша дақылдары мен тауық эмбриондарында пассаж жүргізілді. Зерттеулер үшін Бірқазандар және Қаздар отрядына жататын құстардың 3 түрінен (Phalacrocorax carbo / Су құзғын, Hydropogne caspia / Үлкен қарқылдақ шағалала және Cygnus cygnus / Сұңқылдақ аққу) шайынды, қан сарысуы және сарыуыз түрінде сынамалар алынды. Зерттелген сынамалардың құрамындағы виромды секвендеу үшін вирусы бар нуклеин қышқылдары өндірушінің ұсыныстарына сәйкес QIAamp Viral RNA Mini жинағы (Qiagen, Hilden, Германия) арқылы бөлініп алынды. Сынамалар алдымен сүзілген, центрифугаланған және нуклеазалармен өңделген. Екі тізбекті ДНҚ синтезі үшін Sequence Independent Single Primer Amplification (SISPA) әдісі қолданылды. Кітапхана синтезі Illuminaға (NEB, АҚШ) арналған NEBNext Ultra Directional DNA Library Prep Kit көмегімен жүзеге асырылды. Биоинформатикалық талдау нәтижелері зерттелген сынамалардаH5 және Ньюкасл ауруы вирусының бірнеше квазитүрінің, сондай-ақ су құзғыны аденовирусының болуын көрсетті. Серологиялық зерттеулер жабайы құстардан алынған сынамаларда H5 тип тармағына антиденелердің тасымалдануын анықтады. Основные конструктивные и технико-экономические показатели: повышение эффективности мониторинговых исследований у диких птиц и улучшении знаний об эпидемической ситуации и распространения вирусов этих животных. Негізгі конструктивті және техникалық-экономикалық көрсеткіштер жабайы құстарға мониторингтік зерттеулерінің тиімділігін арттыру және эпидемиялық ахуал және осы жануарлардың вирустарының таралуы туралы білімді жетілдіру болып табылады. Работы находятся в процессе внедрения. Жұмыстар өндіріске енгізу сатысында. Все работы проведены с высокой степенью эффективности. Барлық жұмыстар жоғары тиімділікпен жүргізілді. Область применения - природоохранные структуры, ветеринарные и медицинские работники, орнитологи, волонтеры по защите животных и птиц. Целевые потребители - Комитет лесного и охотничьего хозяйства МСХ РК Комитет ветеринарии МСХ РК, Международный союз по охране дикой природы, Международное эпизоотическое бюро. Қолдану саласы – табиғатты қорғау құрылымдары, ветеринарлық және медицина қызметкерлері, орнитологтар, жануарлар мен құстарды қорғау жөніндегі волонтерлер. Мақсатты тұтынушылар – Қазақстан Республикасы Ауыл шаруашылығы министрлігінің Орман және аңшылық шаруашылығы комитеті, Қазақстан Республикасы Ауыл шаруашылығы министрлігінің Ветеринария комитеті, Жануарлар дүниесін қорғаудың халықаралық одағы, Халықаралық эпизоотиялық бюро. |
||||
UDC indices | ||||
578.42 | ||||
International classifier codes | ||||
34.25.00; 34.25.39; 34.25.21; 68.41.35; 76.33.43; | ||||
Key words in Russian | ||||
Окружающая среда; Вирус; Виром; Патоген; Птица; Водоем; | ||||
Key words in Kazakh | ||||
Қоршаған орта; Вирус; Виром; Патоген; Құс; Су айдыны; | ||||
Head of the organization | Саданов Аманкелди Курбанович | Доктор биологических наук / профессор, академик КазНАЕН | ||
Head of work | Карамендин Кобей Омертаевич | Кандидат ветеринарных наук / профессор |