Inventory number IRN Number of state registration
0323РК01389 AP14870678-KC-23 0122РК00815
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Краткие сведения Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 0
International publications: 1 Publications Web of science: 1 Publications Scopus: 1
Patents Amount of funding Code of the program
0 32214101 AP14870678
Name of work
Изучение генетического разнообразия и популяционно-генетической структуры верблюдов Сamelus dromedarius и Сamelus bactrianus в Казахстане
Type of work Source of funding Report authors
Fundamental Досыбаев Кайрат Жумагалиевич
0
0
0
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) МНВО РК
Full name of the service recipient
Республиканское государственное предприятия на праве хозяйственного ведения «Институт генетики и физиологии» Комитета науки Министерства образования и науки Республики Казахстан
Abbreviated name of the service recipient РГП на ПХВ ИГИФ КН МОН РК
Abstract

Породы верблюдов Сamelus dromedarius и Сamelus bactrianus, разводимые в Казахстане

Қазақстанда өсірілетін Сamelus dromedarius және Сamelus bactrianus түйе тұқымдары

Оценка генетического разнообразия видов верблюдов, разводимых в Казахстане, на основе микросателлитных маркеров и проведение сравнительного филогенетического анализа с использованием участка D-петли мтДНК.

Қазақстанда өсірілетін түйе түрлерінің генетикалық әртүрлілігін микросателлитті маркерлер негізінде бағалау және оларға мтДНҚ D-loop аймағы арқылы салыстырмалы филогенетикалық талдау жүргізу.

Молекулярно-генетические, биоинформатические

Молекулалық-генетикалық, биоинформатикалық

С целью определения генетических особенностей и разнообразия верблюдов был проведен предварительный литературный анализ 17 микросателлитных локусов в отобранных для исследования популяциях. Далее, в зависимости от расположения на хромосоме и температуры отжига праймеров, данные маркеры были объединены в мультиплексные наборы: (1) VOLP03, VOLP08, LCA66, CVRL5D; (2) CVRL07, YWLL44, VOLP32, CMS15, YWLL38; (3) LCA63, VOLP67, YWLL08, CMS50; (4) VOLP10, CMS13, CVRL6D и (5) YWLL09. В результате расчета среднее число аллелей в общей популяции составило 10,25±1,26, эффективное число аллелей - 5,91±0,77, индекс Шеннона - 1,90±0,14. Среднее количество наблюдаемых и ожидаемых гетерозигот для всей популяции составило 0,99±0,005 и 0,801±0,034 соответственно. Генетическая дифференциация и структура популяций верблюдов в исследовании анализировались в каждом локусе по трем показателям F-статистики Райта. Значение FIS составляло 0,249±0,071, значение FIT составляло 0,204±0,073 и значение FST показало 0,037±0,008. В результате исследования установлено, что маркеры, используемые при оценке генетического разнообразия популяций верблюдов, обладают высокой информативностью. Ожидаемое и наблюдаемые рассчеты гетерозиготности и значения F-статистики показали, что в изученных популяциях верблюдов наблюдается свободное скрещивение.

Зерттеуге іріктелген популяциялардағы түйелердің генетикалық еркешеліктері мен әртүрлілігін анықтауда 17 микросателитті локустарға алдын ала әдебиеттік талдаулар жүргізілді. Келесі ретте бұл маркерлер хромосомадағы орналасу орны және праймерлердің жабысу (отжиг) температурасы бойынша мультиплексті жиынтыққа біріктірілді: (1) VOLP03, VOLP08, LCA66, CVRL5D; (2) CVRL07, YWLL44, VOLP32, CMS15, YWLL38; (3) LCA63, VOLP67, YWLL08, CMS50; (4) VOLP10, CMS13, CVRL6D; (5) YWLL09. Нәтижесінде жалпы популяциядағы орташа аллельдер саны 10,25±1,26, ал аллельдердің тиімді саны 5,91±0,77 мәніне тең және Шэннон көрсеткіші 1,90±0,14 болды. Байқалатын және күтілетін гетерозиготалардың орташа мәні жалпы популяция бойынша сәкесінше 0,99±0,005 және 0,801±0,034 болды. Зерттеудегі түйе популяцияларының генетикалық дифференциациясы мен құрылымын Райт F-статистикасының үш индексі әрбір локус бойынша талданды. FIS мәні - 0,249±0,071, FIT мәні - 0,204±0,073 және FST мәні - 0,037±0,008 тең болды. Зерттеу нәтижесінде түйе популяцияларының генетикалық әртүрлілігін бағалауда қолданылған маркерлердің ақпараттылығы жоғары екені анықталды. Есептелген байқалатын және күтілетін гетерозиготалар көрсеткіштері мен F-статистика мәндері зерттеуге алған түйе популяцияларында еркін шағылысу жүріп жатқанын көрсетті.

В ходе реализации данного проекта будет проведен сбор биоматериала, выделения геномной ДНК, ПЦР, микросателлитный анализ и секвенирование участка D-loop мтДНК.

Бұл жобаны жүзеге асыруда биоматериал жинау, геномдық ДНҚ молекуласын бөлу, ПТР, микросателлитті талдау, мтДНҚ молекуласының D-loop аймағын секвенирлеу жұмыстары орындалады.

Данные, полученные в результате исследования (участок D-loop мтДНК), будут включены в базу данных (Национальный центр биотехнологической информации США, NCBI) и будут доступны ученым. Результаты исследований 2023 года опубликованы в материалах международной конференции (один тезис) и журнале Scopus (одна статья).

Зерттеу нәтижесінде алынған мәліметтер (мтДНҚ молекуласының D-loop аймағы) әлемдік генқорына (АҚШ Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, NCBI) енгізіледі және ғалымдарға қолжетімді болады. Жоба бойынша 2023 жылы скопус базасына кіретін журналда бір мақала және халықаралық конференция материалдарында бір тезис жарыққа шықты.

Использование современных молекулярно-генетических методов в исследованиях помогает решить ключевые вопросы верблюдоводства. Например, это позволяет определить степень инбридинга особей в популяции верблюдов, долю неслучайного спаривания и эффекты дрейфа генов между субпопуляциями, коэффициент инбридинга особей в общей популяции, поток генов и эффект мутации и отбора.

Қазіргі заман талабына сай молекулалы-генетикалық тәсілдерді ғылыми зерттеу жұмыстарында қолдану түйе шаруашылығындағы көптеген сұрақтарды шешуге көмектеседі. Мысалы, түйе популяциясындағы даралардың туыстық шағылысу дәрежесін, кездейсоқ емес шағылысудың үлесі мен субпопуляциялар арасындағы гендер дрейфінің әсерлерін, жалпы популяциядағы даралардың инбридинг коэффициентін, гендер ағынын, мутация мен іріктеудің бірлескен әсерін анықтауға мүмкіндік береді.

Животноводство, верблюдоводства

Мал шаруашылығы, түйе шаруашылығы

UDC indices
636.295(574)
International classifier codes
34.23.59;
Key words in Russian
Верблюды; генотипирование; филогенез; популяция; Генетическое разнообразие;
Key words in Kazakh
Түйелер; генотиптеу; филогенез; популяция; Генетикалық әртүрлілік;
Head of the organization Жунусова Гульнур Сагиндыковна PhD в области биологических наук / нет
Head of work Досыбаев Кайрат Жумагалиевич Phd / нет