Inventory number IRN Number of state registration
0223РК00080 AP09259027-OT-23 0121РК00170
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Заключительный Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 1
International publications: 2 Publications Web of science: 2 Publications Scopus: 0
Number of books Appendicies Sources
1 4 84
Total number of pages Patents Illustrations
81 0 17
Amount of funding Code of the program Table
21000000 AP09259027 9
Name of work
Изучение генетического разнообразия видов рода Juniperus L., произрастающих в Казахстане.
Report title
Type of work Source of funding The product offerred for implementation
Fundamental Коллекции
Report authors
Альмерекова Шырын Семизбайкызы , Туруспеков Ерлан Кенесбекович , Ермағамбетова Мөлдір Мақатқызы , Амалова Акерке Ыкласкызы ,
0
0
1
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) МНВО РК
Full name of the service recipient
Республиканское Государственное предприятие на праве хозяйственного ведения "Институт Биологии и биотехнологии растений"
Abbreviated name of the service recipient РГП на ПХВ «ИББР»
Abstract

Виды рода Juniperus L., произрастающие в Казахстане.

Қазақстанда өсетін Juniperus L. туысы түрлері.

Изучить внутри- и межвидовое генетическое разнообразие семи видов можжевельника Казахстана на основе использования полиморфных и информативных ДНК-маркеров, в том числе и по нуклеотидным последовательностям хлоропластных геномов видов с использованием геномных технологий нового поколения.

Полиморфты және ақпаратты ДНҚ-маркерлерін пайдалану негізінде, оның ішінде жаңа буынның геномдық технологияларын қолдана отырып, түрлердің хлоропласттық геномдарының нуклеотидтік тізбегі бойынша Қазақстандағы аршалардың жеті түрінің түрішілік және түраралық генетикалық алуантүрлілігін зерттеу

Сбор популяций, определение видовой принадлежности и документирование, выделение ДНК, полимеразная цепная реакция (ПЦР), электрофорез, определение нуклеотидных последовательностей с использованием ДНК-анализатора, полногеномное секвенирование нового поколения. В работе использованы статистические прикладные программы MEGA, GenAlEx, DnaSP6 и др.

Популяцияларды жинау, өсімдік түрлерін анықтау және құжаттау, ДНҚ бөлу, полимеразды тізбекті реакция (ПТР), электрофорез, ДНҚ -анализаторын қолдану арқылы нуклеотидтер тізбегін анықтау, жаңа буынды толық геномдық секвенирлеу. Жұмыста MEGA, GenAlEx, DnaSP6 және т.б. статистикалық қолданбалы бағдарламалары қолданылды.

Осуществлен сбор 38 природных популяций видов можжевельника – J. pseudosabina, J. sabina, J. communis, J. seravschanica, J. semiglobosa, J. sibirica, J. x media, J. davurica и J. turkestanica (=J. pseudosabina) в восточном, северном, южном и юго-восточном Казахстане, Узбекистание и Кыргызстане. Определены ценопопуляционные характеристики краснокнижного вида J. seravschanica в Сайрам-Угамском ГНПП и Аксу-Жабаглинском ГПЗ. Определены филогенетические связи видов рода Juniperus Казахстана на основе использования ДНК-маркера ядерного генома – ITS. Применение данного маркера позволило разделить образцы изученных видов можжевельника на два основных клада, соответствующих 2 секциям, Juniperus и Sabina. Депонированы в международную базу данных NCBI 16 нуклеотидных последовательностей ITS видов можжевельника. Осуществлено генотипирование популяций видов Juniperus с использованием микросателлитных ДНК-маркеров. Проанализировано 15 популяций J. seravschanica, 2 популяции J. pseudosabina, 4 – и J. sibirica, 4 – J. sabina, 4 – J. turkestanica, 3 – J. communis, 2 – J. semiglobosa. Изучено генетическое разнообразие хлоропластного генома 7 казахстанских можжевельников, аннотированные последовательности хлоропластного генома были депонированы в международную базу данных NCBI.

Шығыс, солтүстік, оңтүстік және оңтүстік–шығыс Қазақстан, Өзбекстан және Қырғызстаннан J. pseudosabina, J. sabina, J. communis, J. seravschanica, J. semiglobosa, J. sibirica, J. x media, J. davurica және J. turkestanica (=J. pseudosabina) арша түрлерінің 38 табиғи популяциялары жиналды. Сайрам-Өгем МҰТП және Ақсу-Жабағлы МТҚ Қызыл кітапқа енген J. seravschanica түрінің ценопопуляциялық сипаттамалары анықталды. Ядролық геном – ITS ДНҚ- маркерін пайдалану негізінде Қазақстанның Juniperus туысы түрлерінің филогенетикалық байланыстары анықталды. Бұл маркерді қолдану зерттелген арша түрлерінің үлгілерін Juniperus және Sabina 2 секциясына сәйкес келетін екі негізгі кладқа бөлуге мүмкіндік берді. Арша түрлерінің ITS 16 нуклеотидтік тізбектері NCBI халықаралық деректер базасында сақталды. Микросателлиттік ДНҚ-маркерлерін пайдалана отырып, Juniperus түрлерінің популяцияларын генотиптеу жүзеге асырылды. J. seravschanica 15 популяциясы, J. pseudosabina – 2, J. sibirica – 4, J. sabina – 4, J. turkestanica – 4, J. communis – 3, J. semiglobosa – 2 популяциясы талданды. Қазақстандық 7 аршаның хлоропластты геномының генетикалық алуантүрлілігі зерттелді, хлоропласт геномының аннотацияланған тізбегі NCBI халықаралық деректер базасына сақталды.

Полученные данные могут быть в дальнейшем использованы для разработки научных рекомендации по сохранению генетических ресурсов можжевельника в стране.

Алынған мәліметтерді одан әрі еліміздегі аршаның генетикалық ресурстарын сақтау бойынша ғылыми ұсыныстар әзірлеуге пайдалануға болады.

Молекулярная систематика, популяционная и молекулярная генетика.

Молекулалық систематика, популяциялық және молекулалық генетика

UDC indices
577.21; 575.17; 504.062
International classifier codes
34.15.23; 34.23.35; 87.35.00; 87.35.29;
Readiness of the development for implementation
Key words in Russian
Juniperus; генетическое разнообразие; ITS маркеры; микросателлитные маркеры; геномные технологии нового поколения; хлоропластный геном;
Key words in Kazakh
Juniperus; генетикалық алуантүрлілік; ITS маркерлері; микросателлиттік маркерлер; жаңа буынды геномдық технологиялар; хлоропласттық геном;
Head of the organization Жамбакин Кабыл Жапарович Доктор биологических наук / профессор
Head of work Альмерекова Шырын Семизбайкызы PhD / нет
Native executive in charge Туруспеков Ерлан Кенесбекович профессор