Inventory number IRN Number of state registration
0323РК00106 AP14869099-KC-23 0122РК00490
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Краткие сведения Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 0
International publications: 1 Publications Web of science: 1 Publications Scopus: 1
Patents Amount of funding Code of the program
0 32988294.4 AP14869099
Name of work
Вирусные метапопуляции рукокрылых и рептилий Казахстана как потенциальный источник антропозоонозных инфекций
Type of work Source of funding Report authors
Fundamental Карамендин Кобей Омертаевич
0
0
0
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) Нет
Full name of the service recipient
ТОО "Научно-производственный центр микробиологии и вирусологии"
Abbreviated name of the service recipient ТОО "Научно-производственный центр микробиологии и вирусологии"
Abstract

Биологические пробы от летучих мышей

Жарқанаттардан алынған биологиялық сынамалар

Цель проекта - выявить вирусные метапопуляции, циркулирующих среди летучих мышей в Казахстане, провести их молекулярно-генетическую характеристику с целью расширить наши знания о летучих мышах как важного резервуара различных патогеноов в природе и оценить риск возникновения и распространения антропоззонозных инфекций в Казахстане.

Жобаның мақсаты - Қазақстанда жарқанаттар арасында айналымда болатын вирустық метапопуляцияларды анықтау, табиғаттағы әртүрлі қоздырғыштардың маңызды резервуары ретінде жарқанаттар туралы білімімізді кеңейту және Қазақстанда антропозоонозды инфекциялардың пайда болуы мен таралу қаупін бағалау үшін олардың молекулалық-генетикалық сипаттамасын жүргізу.

В работе применяли вирусологические и молекулярно-биологические методы исследования, а также массовое параллельное секвенирование

Біз вирусологиялық және молекулалық биологиялық зерттеу әдістерін, сондай-ақ жаппай параллельді секвендеуді қолдандық.

Собраны пробы от летучих мышей в виде глазных, носоглоточных, ротовых и ректальных смывов , с помощью массового параллельного секвенирования и биоинформационного анализа определены новые для науки и традиционные вирусы. Состоялись экспедиционные выезды в южный регион Казахстана с целью сбора биологического материала от летучих мышей. Получены пробы в виде смывов от 167 особей 2 видов, принадлежащих к семейству Рукокрылые. В результате проведенных работ для дальнейшего секвенирования на приборе MinION (Oxford Nanopore, Великобритания) приготовлены соответствующие библиотеки и секвенированы на приборе Oxford Nanopore. Проведен биоинформационный анализ результатов массового параллельного секвенирования с помощью специализированного программного обеспечения. Выявлены новые вирусы летучих мышей из семейств Adenoviridae et Herpesviridae. Проведено их секвенирование. Проведены филогенетические исследования полученных нуклеотидных последовательностей нового аденовируса и других. Проведен анализ половозрастного, видового состава, территориальной принадлежности летучих мышей. Выявлены новые вирусы у местного вида Myotis blythii, которые филогенетически оказались значительно отдаленными и выявлен новый вид

Жарқанаттардан көз, мұрын, ауыз және тік ішек сынамалары жиналды, жаңа және дәстүрлі вирустар жаппай параллелді секвендеу мен биоақпараттық талдау арқылы анықталды. Жарқанаттардан биологиялық сынамалар жинау мақсатында Қазақстанның оңтүстік өңіріне экспедициялық сапарлар болды. Сынамалар жұғынды түрінде Chiroptera тұқымдасына жататын 2 түрдегі 167 бастан алынды.Жүргізілген жұмыстардың нәтижесінде MinION жабдығында (Oxford Nanopore, Ұлыбритания) секвендеу үшін кітапханалар дайындалып, Oxford Nanopore құралында секвенделген.Арнайы бағдарламалдың қолдануымен жаппай параллельді секвендеу нәтижелеріне биоинформатикалық талдау жүргізілді. Жарғанаттардың Adenoviridae et Herpesviridae жаңа вирустары анықталды. Гендері секвенделді. Жаңа аденовирустың және басқалардың алынған нуклеотидтер тізбегіне филогенетикалық зерттеулер жүргізілді. Жарқанаттардың жынысына, жасына, түріне, аумақтық тиесілілігіне талдау жасалды. Жергілікті Myotis blythii түрінен жаңа вирустар анықталды. Олар филогенетикалық жағынан алыс болды және жаңа түрі болып анықталды.

Основные конструктивные и технико-экономические показатели: повышение эффективности мониторинговых исследований у летучих мышейи улучшении знаний об эпидемической ситуации и распространения вирусов этих животных.

Негізгі конструктивті және техникалық-экономикалық көрсеткіштер жарқанаттарға мониторингтік зерттеулерінің тиімділігін арттыру және эпидемиялық ахуал және осы жануарлардың вирустарының таралуы туралы білімді жетілдіру болып табылады.

Работы находятся в процессе внедрения.

Жұмыстар өндіріске енгізу сатысында.

Все работы проведены с высокой степенью эффективности.

Барлық жұмыстар жоғары тиімділікпен жүргізілді.

Медицина, ветеринария, териология

Медицина, ветеринария, териология

UDC indices
УДК 578.42
International classifier codes
34.25.39; 34.25.00;
Key words in Russian
Летучая мышь; Вирус; Секвенирование нового поколения; Эпидемиология; Коронавирус;
Key words in Kazakh
Жарқанат; Вирус; Жаңа буынды секвендеу; Індеттану; Коронавирус;
Head of the organization Саданов Аманкелди Курбанович Доктор биологических наук / профессор, академик КазНАЕН
Head of work Карамендин Кобей Омертаевич Кандидат ветеринарных наук / профессор