The object of research, development or design (in Russian) : Объектом исследования являются рекомбинантные белки TurboID-X (X - Sox2, Oct4, Nanog и GFP).

The object of research, development or design (in Kazakh) : Зерттеу объектісі TurboID-X (X - Sox2, Oct4, Nanog және GFP) рекомбинантты ақуыздар болып табылады.

Aim of work (in Russian) : Целью проекта является разработка способа мониторинга и количественного анализа пост-трансляционных модификаций рекомбинантных белков на основе транскрипционных факторов плюрипотентности Sox2, Oct4, Nanog, а также идентификация их белков-партнеров в ядрах эукариотических клеток с использованием сайт-специфичного и неспецифичного биотинилирования in vivo

Aim of work (in Kazakh) : Жобаның мақсаты, Sox2, Oct4, Nanog транскрипциялық плурипотенттілік факторлары негізінде рекомбинантты ақуыздардың кейінгі трансляциялық модификацияларын бақылау және сандық талдау әдісін жасау, сондай-ақ in vivo сайтқа тән және спецификалық емес биотинилирлеуді пайдалана отырып, эукариоттық жасуша ядроларындағы олардың серіктес ақуыздарын анықтау болып табылады.

Методы исследования (на русском) : В работе были использованы молекулярно-биологические, биохимические, генетические методы анализа, а также масс-спектрометрия.

Методы исследования (на казахском) : Жұмыста молекулярлы-биологиялық, биохимиялық, генетикалық талдау әдістері және масс-спектрометрия қолданылды.

Obtained results and novelty (in Russian) : 1. Получены 4 новых плазмидных конструкций: pOz.TurboID.GFP, pOz.TurboID.Sox2, pOz.TurboID.Oct4 и pOz.TurboID.Nanog. Правильность сборки плазмид, и отсутствие ошибок в нуклеотидной последовательности проверяли с помощью метода секвенирования по Сэнгеру. 2. Оптимизированы условия выделения биотинилированных белков из различных фракций клеток HEK293T и CHO. При этом из стрептавидиновых частиц трех производителей наиболее эффективным оказался Streptavidin Sepharose™ High Performance, 17-5113-01, компании Cytiva. 3. По результатам анализа образцов TurboID-GFP, TurboID-Sox2 и TurboID-Nanog, содержащих биотинилированные белки из клеток HEK293T и CHO с помощью жидкостной хроматографии тандемной масс-спектрометрии идентифицированы партнеры указанных рекомбинантных белков.

Obtained results and novelty (in Kazakh) : 1. 4 жаңа плазмида конструкциялар pOz.TurboID.GFP, pOz.TurboID.Sox2, pOz.TurboID.Oct4 и pOz.TurboID.Nanog алынды. Плазмидалардың дұрыс құрастырылуы және нуклеотидтер тізбегіндегі қателіктердің болмауы Сэнгер секвенирлеу әдісімен тексерілді. 2. HEK293T және CHO жасушаларының әртүрлі фракцияларынан биотинилденген ақуыздарды оқшаулау шарттары оңтайландырылған. Сонымен қатар, үш өндірушінің стрептавидин бөлшектерінің ішіндегі ең тиімдісі Cytiva компаниясының Streptavidin Sepharose ™ High Performance, 17-5113-01 болып табылды. 3. HEK293T және CHO жасушаларынан биотинилденген ақуыздары бар TurboID-GFP, TurboID-Sox2 және TurboID-Nanog үлгілерін талдау нәтижелері бойынша әреккеттесетін ақуыздар идентификацияланған.

The main constructive and technical economic indicators (in Russian) : За 2022 год опубликована 1 статья в журнале с импакт-фактором и 1 статья в отечественном журнале. 1. Kulyyassov A., Ramankulov Y., Ogryzko V. Generation of Peptides for Highly Efficient Proximity Utilizing Site-Specific Biotinylation in Cells // Life (Basel). ‒ 2022. ‒ Vol. 12, № 2, 300. ‒ P.1-14. – doi: 10.3390/life12020300, PMID: 35207587, IF3.817, Q2 (2020, WoS), percentile 50 on General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, CiteScore 2.6 (2020, Scopus); 2. Kulyyassov A. UniProt database - universal information resource of protein sequences // Eurasian journal of applied biotechnology. – 2022. – №1. – P.3-13; https://doi.org/10.11134/btp.1.2022.1 , рекомендован ККСОН МОН РК на 2021-2022 гг, https://www.internauka.org/blog/perechen-zhurnalov-rekomendovannyh-kkson-mon-rk;

The main constructive and technical economic indicators (in Kazakh) : 2022 жылы импакт-факторлы журналда 1 мақала және отандық журналда 1 мақала жарияланды. 1. Kulyyassov A., Ramankulov Y., Ogryzko V. Generation of Peptides for Highly Efficient Proximity Utilizing Site-Specific Biotinylation in Cells // Life (Basel). ‒ 2022. ‒ Vol. 12, № 2, 300. ‒ P.1-14. – doi: 10.3390/life12020300, PMID: 35207587, IF3.817, Q2 (2020, WoS), percentile 50 on General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, CiteScore 2.6 (2020, Scopus); 2. Kulyyassov A. UniProt database - universal information resource of protein sequences // Eurasian journal of applied biotechnology. – 2022. – №1. – P.3-13; https://doi.org/10.11134/btp.1.2022.1 , рекомендован ККСОН МОН РК на 2021-2022 гг, https://www.internauka.org/blog/perechen-zhurnalov-rekomendovannyh-kkson-mon-rk;

Level of implementation (in Russian) :

Level of implementation (in Kazakh) :

Efficiency (in Russian) : Проводимые в рамках выполнения проекта исследования расширят наши представления о структурно-функциональной организации клетки, а также предоставят более детальную информацию о механизмах действия транскрипционных факторов плюрипотентности.

Efficiency (in Kazakh) : Жобаны жүзеге асыру аясында жүргізілген зерттеулер жасушаның құрылымдық және функционалды ұйымдастырылуы туралы түсінігімізді кеңейтеді, сонымен қатар плурипотенттіліктің транскрипциялық факторларының әсер ету механизмдері туралы егжей-тегжейлі ақпарат береді.

Field of application (in Russian) : Результаты этой работы будут иметь непосредственное применение в разработке клеточных препаратов в персонализированной медицине.

Field of application (in Kazakh) : Бұл жұмыстың нәтижелері жеке медицинада жасушалық препараттарды әзірлеуде тікелей қолданылады.