Inventory number IRN Number of state registration
0322РК00772 AP09259735-KC-22 0121РК00302
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Краткие сведения Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 0
International publications: 1 Publications Web of science: 1 Publications Scopus: 1
Patents Amount of funding Code of the program
0 22569187.2 AP09259735
Name of work
Разработка и оценка химерных эндолизинов бактериофагов для борьбы с множественно лекарственно-устойчивыми грамотрицательными патогенами осетровых рыб
Type of work Source of funding Report authors
Applied Бисенбаев Амангельды Куанбаевич
0
1
2
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) МНВО РК
Full name of the service recipient
Некоммерческое акционерное общество "Казахский национальный университет имени аль-Фараби"
Abbreviated name of the service recipient НАО "КазНУ им. аль-Фараби"
Abstract

Осетровые рыбы, грамотрицательные бактерии возбудители аэромоноза и псевдомоноза осетровых рыб (Aeromonas и Pseudomonas spp.).

Бекіре балықтары, грамтеріс бактериялар, бекіре балықтарының аэромонозы мен псевдомонозының қоздырғыштары (Aeromonas және Pseudomonas spp.).

Конструирование химерных эндолизинов с повышенной литической активностью в отношении бактериальных патогенов, вызывающих заболевания осетровых рыб в аквакультуре.

Аквакультурадағы бекіре тұқымдас балықтарының ауруларын тудыратын бактерия патогендеріне қарсы жоғары литикалық белсенділігі бар химерлік эндолизиндерді құрастыру.

Молекулярно-генетические, биохимические и микробиологические.

Молекулалық-генетикалық, биохимиялық және микробиологиялық.

Произведен компьютерный анализ эндолизинов. Было отобрано три последовательности эндолизинов: Gp110, OBPgp279 и LysPA26. Клонированы гены трех родительских и 7 химерных эндолизинов, полученных путем комбинаций связывающих доменов с каталитическими доменами между Gp110, OBPgp279 и LysPA26 белков, в векторную систему pET28c. Произведена оптимизация их экспрессии и очистки с помощью аффинной хроматографии. В результате оптимальным условием индукции всех эндолизинов в E. coli было при 15оС, 0,2 мМ ИПТГ и времени экспрессии в течение ночи, кроме LysPA26, для которого использовали 25оС, 0,5 мМ ИПТГ и время экспрессии 4 часа. Исследованы биохимические свойства эндолизинов. Результаты указывают, что наибольшая эффективность эндолизинов наблюдается при значениях pH 7-8. Анализ ферментативной активности показало, что наибольшей эффективностью обладает эндолизин Gp110 и соответствующие ему химерные эндолизины при использовании которых оптическая плотность бактериальных клеток снижалась до 88,3% при использовании 10 мкг эндолизина 1 мл суспензий бактериальных клеток и до 78,6% при использовании 1,25 мкг эндолизина на 1 мл суспензий бактериальных клеток. Кроме того, анализы влияния температуры и pH показали, что химерные эндолизины на основе Gp110 обладают хорошей стабильностью в широком диапазоне значений pH и температур. Более того, Gp110-химеры могут эффективно убивать другие грамотрицательные бактерии, такие как A. hydrophila, A. salmonocida, E. coli, но не грамположительные бактерий.

Эндолизиндердің компьютерлік сараптамасы жасалды. Эндолизиндердің келесі үш тізбектері таңдалып алынды: Gp110, OBPgp279 және LysPA26. Gp110, OBPgp279 және LysPA26 протеиндерінің байланысу және каталитикалық домендерін pET28c векторлық жүйесіне қосу арқылы алынған үш ата-налық және жеті химерлік эндолизиндердің гендері клондалды. Олардың экспрессиясы мен аффиндік хроматография арқылы тазалауы оңтайландырылды. Нәтижесінде барлық эндолизиндердің E. coli-ғы индукцияның 15оС оңтайлы жағдайы келесідей болды: 0,2 мМ ИПТГ түні бойы индукция, ал LysPA26 үшін 25оС-та 0,5 мМ ИПТГ 4 сағаттық экспрессиясы. Эндолизиндердің биохимиялық қасиеттері зерттелді. Алынған нәтижелер эндолизиндердің ең жоғары тиімділігі pH 7-8 болатындығын көрсетті. Ферменттік активтілік бойынша сараптамасы Gp110 эндолизинінің және соған сәйкес химерлік эндолизиндердің ең жоғары тиімділікке ие екндігін көрсетті. 10 мкг эндолизинді қолданғанда 1 мл бактериялық клеткалардың оптикалық тығыздығы 88,3% азайды, ал 1,25 мкг эндолизинді қолданғанда 1 мл бактериялық клеткалардың оптикалық тығыздығы 78,6% азайды. Сонымен қатар, температура мен pH әсерін сараптау нәтижесінде Gp110 негізіндегі химерлік эндолизиндердің pH пен темпратураның кең диапазонында тұрақтылыққа ие екендігін көрсетті. Gp110-химерлері A. hydrophila, A. salmonocida, E. coli сияқты басқа да грамтеріс бактерияларды тиімді өлтіре алатындығын көрсетті, бірақ грамоң батерияларды өлтіре алмады.

Представленный проект направлен на разработку новых эффективных химерных эндолизинов с повышенной литической активностью в отношении грамотрицательных и устойчивых к антибиотикам бактерий, которые являются основной причиной заболеваний осетровых в аквакультуре.

Ұсынылған жоба аквкультурадағы бекіре тұқымдас балық ауруларының негізгі себебі болып табылатын грамтеріс және антибиотиктерге төзімді бактерияларға қарсы литикалық белсенділігі жоғары жаңа және тиімді химерлі эндолизиндерді жасауға бағытталған.

Рыбохозяйственные предприятия; включая промышленные аквакультурные комплексы и рыбоводные заводы, а также фермеры-рыбоводы.

Балық өндіру кәсіпорындары, оның ішінде өндірістік аквакультура кешендері мен балық өсіру шаруашылықтары, сондайақ балық өсіруші фермерлер.

UDC indices
577; 578; 579;
International classifier codes
34.15.27; 62.37.99;
Key words in Russian
осетровые; aeromonas hydrophila; pseudomonas putida; pseudomonas fluorescens; грамотрицательные бактерии; эндолизины; антибактериальная активность; химерные эндолизины;
Key words in Kazakh
бекіре балықтар; aeromonas hydrophila; pseudomonas putida; pseudomonas fluorescens; грам-теріс бактериялар; эндолизиндер; антибактериалды белсенділік; химерлік эндолизиндер;
Head of the organization Айдосов Нуржан Сарсынбекович магистр /
Head of work Бисенбаев Амангельды Куанбаевич Доктор биологических наук / профессор