Inventory number IRN Number of state registration
0322РК00101 AP13068118-KC-22 0122РК00137
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Краткие сведения Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 0
International publications: 0 Publications Web of science: 0 Publications Scopus: 0
Patents Amount of funding Code of the program
0 20500000 AP13068118
Name of work
Поиск генов, связанных с хозяйственно-ценными признаками сои (Glycine max (L.) Merr.), на основе использования ресеквенирования полного генома мировой коллекции
Type of work Source of funding Report authors
Applied Затыбеков Алибек Камзабекович
0
0
1
1
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) МНВО РК
Full name of the service recipient
Республиканское Государственное предприятие на праве хозяйственного ведения "Институт Биологии и биотехнологии растений"
Abbreviated name of the service recipient РГП на ПХВ «ИББР»
Abstract

мировая коллекция сои, состоящая из 252 сортов и линий.

252 сорт пен линиядан тұратын сояның әлемдік коллекциясы.

Идентификация локусов количественных признаков и генов, контролирующих продуктивность и качество, на основе ресеквенирования полного генома 252 образцов мировой коллекции сои и создания двух наборов KASP-маркеров по хозяйственно-ценным признакам для юго-востока и севера страны.

Сояның әлемдік коллекциясының 252 үлгісін толық геномдық ресеквенирлеу және елдің оңтүстік-шығысы мен солтүстігі үшін шаруашылық-құнды белгілері бойынша KASP-маркерлердің екі жиынтығын жасау негізінде өнімділік пен сапаны бақылайтын гендер мен сандық белгі локустарын анықтау.

выделение тотальной ДНК и РНК, электрофорез в 1,5 % агарозном геле, ресеквенирование полного генома, популяционный анализ. Полевые опыты, структурный анализ урожайности. Статистическая обработка данных ресеквенирования полного генома с использованием прикладных программ snpEff, GATK, VCFtools.

ДНҚ және РНҚ бөлу, 1,5 % агарозды гельдегі электрофорез, толық геномды ресеквенирлеу, популяциялық талдау. Далалық тәжірибелер, өнімділікті құрылымдық талдау. snpEff, GATK, VCFtools қолданбалы бағдарламаларын пайдалана отырып, толық геномды ресеквенирлеу деректерін статистикалық өңдеу.

В результате полевых испытаний 252 образцов мировой коллекции сои в Алматинской и Костанайской областях проведена сравнительная оценка вегетационных периодов и компонентов продуктивности исследуемых образцов. Наиболее высокие показатели по признаку массы семян с растения были отмечены в Костанайской области, по признаку массы семян с делянки – в Алматинской области. В северном регионе вызрел только 81 образец (32,1 %). В результате полногеномного ресеквенирования было идентифицировано более 4,5 млн SNP-маркеров, из которых после первичной обработки осталось 2 879 960 SNP-маркеров. Начаты работы по выделению и очистке ДНК и РНК для образцов коллекции сои и дополнительных гибридных популяций на различных стадиях развития растений. Проведена валидация четырех KASP-маркеров на гибридной популяции Зара х Малета. Осуществлен анализ RT-PCR (количественный ПЦР с обратной транскрипцией) с использованием 3 пар праймеров, связанных с признаками времени цветения, высоты растения и компонентов продуктивности.

Алматы және Қостанай облыстарында дүниежүзілік соя коллекциясының 252 үлгісін далалық сынау нәтижесінде зерттелетін үлгілердің вегетациялық кезеңдері мен өнімділік компоненттеріне салыстырмалы бағалау жүргізілді. Бір өсімдіктегі дән массасы бойынша ең жоғары көрсеткіштер Қостанай облысында, қатардан алынған дән массасы – Алматы облысында байқалды. Солтүстік өңірде 81 үлгі (32,1%) ғана жетілген. Толық геномды ресеквенирлеу нәтижесінде 4,5 миллионнан астам SNP-маркерлері анықталды, оның ішінде бастапқы өңдеуден кейін 2 879 960 SNP-маркерлері қалды. Өсімдік дамуының әртүрлі кезеңдерінде соя коллекциясы мен қосымша гибридті популяциялардың үлгілерінен ДНҚ мен РНҚ бөлу және тазарту жұмыстары басталды. Төрт KASP-маркерлері Зара х Малета гибридті популяциясында тексерілді. RT-ПТР (кері транскрипциялық сандық ПТР) талдауы гүлдеу уақытының белгілеріне, өсімдік биіктігіне және өнімділік компоненттеріне байланысты 3 жұп праймерді қолдану арқылы орындалды.

Коллекция сои, состоящая из 252 сортов и линий, в том числе 31 генотип из Казахстана, оцененные по времени вегетации, морфологическим признакам и компонентам продуктивности.

Вегетация уақыты, морфологиялық белгілері және өнімділік компоненттері бойынша бағаланған 252 сорт пен линиядан тұратын, оның ішінде Қазақстаннан 31 генотиптен тұратын соя коллекциясы.

Высокий отложенный эффект.

Жоғары кейінге қалдырылған әсер.

SNP-маркеры, идентифицированные на основе ПГАА мировой коллекции сои, могут быть использованы в селекционных программах, направленных на повышение продуктивности сои.

Дүниежүзілік соя коллекциясының АТГТ негізінде анықталған SNP-маркерлері соя өнімділігін арттыруға бағытталған селекциялық бағдарламаларда қолданылуы мүмкін.

генетика, селекция и семеноводство сои.

сояның генетикасы, селекциясы және тұқым шаруашылығы.

UDC indices
635.655:631.527:631.523.5:577.21
International classifier codes
34.15.23; 34.23.37; 34.23.41; 68.35.03;
Key words in Russian
Соя; ресеквенирование полного генома; продуктивность; качество; ассоциативное картирование; информативные ДНК-маркеры;
Key words in Kazakh
Соя; толық геномдық ресеквенирлеу; өнімділік; сапасы; ассоциятивтік карталау; ақпараттық ДНК-маркерлер;
Head of the organization Жамбакин Кабыл Жапарович Доктор биологических наук / профессор
Head of work Затыбеков Алибек Камзабекович PhD / нет