Inventory number IRN Number of state registration
0322РК00097 AP09259730-KC-22 0121РК00178
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Краткие сведения Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 0
International publications: 2 Publications Web of science: 1 Publications Scopus: 1
Patents Amount of funding Code of the program
0 22981086.72 AP09259730
Name of work
Изучение кишечного микробиома и микробиома ротовой полости у пациентов, страдающих болезнью Альцгеймера
Type of work Source of funding Report authors
Fundamental Аскарова Шолпан Несипбаевна
0
0
2
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) Нет
Full name of the service recipient
Частное учреждение "National Laboratory Astana"
Abbreviated name of the service recipient National Laboratory Astana
Abstract

Объектами исследования являются люди с диагнозом болезнь Альцгеймера и пожилые люди без когнитивных расстройств (контроль) и их кишечный и ротовой микробиом.

Зерттеу субъектілері - Альцгеймер ауруы диагнозы бар адамдар және бақылау тобы ретінде когнитивті бұзылыстары жоқ егде жастағы адамдар және олардың ішек және ауыз қуысы микробиомасы.

Целью проекта является изучение состава и разнообразия микробиома кишечника и полости рта, выделенных у местных пациентов с диагнозом болезнь Альцгеймера, по сравнению со здоровыми пожилыми людьми с целью лучшего понимания патологии, поиска новых диагностических биомаркеров и стратегий профилактики на основе анализа микробиома.

Жобаның мақсаты - патологияны жақсырақ түсіну, жаңа диагностикалық биомаркерлерді іздеу және микробиомалық анализге негізделген алдын алу стратегияларын іздеу үшін жергілікті Альцгеймер ауруымен сырқаттанушылардан бөлінген ішек пен ауыз микробиомасының құрамын және әртүрлілігін зерттеу.

Выделение бактериальной ДНК производилось по протоколу QIAamp DNA stool Mini Kit (Qiagen, 51504). Подготовка образцов проводилась с использованием набора Nextflex 16s V1-V3 Amplicon-seq (BIOO Scientific, NOVA-4202-04). Ампликоны секвенировали на приборе MiSeq (Illumina). Библиотеку количественно оценивали на приборе Qubit 2.0 с использованием набора для анализа dsDNA BR Qubit (ThermoFisher, 32853). Библиотеки были проверены с использованием Agilent Bioanalyzer 2100 с использованием набора Agilent High Sensitivity DNA Kit (Agilent Technologies, 5067-4626). Анализ данных выполнен с использованием операционных скриптов таксономических единиц (LotuS). Таксономическое присвоение OTU выполнено с использованием баз данных SILVA (v138), greengenes (v13-5) и HITdb (v1.00).

Бактериялық ДНҚ оқшаулануы QIAamp DNA stool Mini Kit (Qiagen, 51504) протоколына сәйкес орындалды. Үлгіні дайындау Nextflex 16s V1-V3 Amplicon-seq жинағы (BIOO Scientific, NOVA-4202-04) арқылы орындалды. Ампликондар MiSeq құралында (Illumina) реттелген. Кітапхананың саны Qubit 2.0 құралында dsDNA BR Qubit талдау жинағы (ThermoFisher, 32853) арқылы анықталды. Кітапханалар Agilent Bioanalyzer 2100 көмегімен Agilent High Sensitivity DNA Kit (Agilent Technologies, 5067-4626) көмегімен тексерілді. Деректерді талдау таксономиялық бірліктердің операциялық сценарийлерінің (LotuS) көмегімен орындалды. OTU-лардың таксономиялық тағайындалуы SILVA (v138), greengenes (v13-5) және HITdb (v1.00) дерекқорлары арқылы орындалады.

Проведен анализ кишечного микробиома участников с болезнью Альцгеймера и контрольной группы. Результаты анализа таксономической классификации выявила высокую индивидуальную вариабельность относительного количества микробов на уровнях типа, класса, порядка и рода у пациентов с БА по сравнению со здоровыми людьми. Анализ относительной численности выявил повышенное количество таксонов, принадлежащих к типам Acidobacteriota, Verrucomicrobiota, Planctomycetota и Synergistota, у пациентов с БА. Среди бактериальных родов микробиота участников БА характеризовалась сниженным количеством Bifidobacterium, Clostridiabacterium, Castellaniella, Erysipelotrichaceae UCG-003, Roseburia, Tuzzerella, Lactobacillaceae и Monoglobus. Дифференциальный анализ численности определил обогащенные роды группы Christensenellaceae R-7, Prevotella, Alloprevotella, группы Eubacterium coprostanoligenes, Ruminococcus, Flavobacterium, Ohtaekwangia, Akkermansia, Bacteroides sp. Marseille-P3166 у пациентов с AD, тогда как количество Levilactobacillus, Lactiplantibacillus, Tyzzerella, группа Eubacterium siraeum, Monoglobus, Bacteroides, Erysipelotrichaceae UCG-003, Veillonella, Faecalibacterium, Roseburia, Haemophilus было уменьшено.

АА бар қатысушылардың және бақылау тобының ішек микробиомасына талдау жүргізілді. Таксономиялық классификацияны талдау нәтижелері дені сау адамдармен салыстырғанда АД-мен ауыратын науқастарда микробтардың типі, класы, реті және тектік деңгейлері бойынша салыстырмалы санының жоғары жеке өзгергіштігін анықтады.Салыстырмалы молшылық талдау АА пациенттерінде phyla Acidobacteriota, Verrucomicrobiota, Planctomycetota және Synergistota түріне жататын таксондар санының артқанын анықтады. Бактериялық тектердің ішінде AD қатысушыларының микробиотасы Bifidobacterium, Clostridiabacterium, Castellaniella, Erysipelotrichaceae UCG-003, Roseburia, Tuzzerella, Lactobacillaceae және Monoglobus санының азаюымен сипатталды. Дифференциалды молшылық талдауы Christensenellaceae R-7, Prevotella, Alloprevotella, Eubacterium coprostanoligenes, Ruminococcus, Flavobacterium, Ohtaekwangia, Akkermansia, Bacteroides sp. АА науқастарында Marseille-P3166, ал Levilactobacillus, Lactiplantibacillus, Tyzzerella, Eubacterium siraeum тобы, Monoglobus, Bacteroides, Erysipelotrichaceae UCG-003, Veillonella, Faecalibacterium, Roseburia, Haemophilus азайды.

В результате проведенных исследований, согласно календарному плану, все задачи были выполнены в полном объеме. Наши результаты продемонстрировали значительные различия в обилии бактерий на уровнях типа, класса, порядка и рода у пациентов с БА по сравнению со здоровыми людьми.

Жүргізілген зерттеу жұмыстарының нәтижесінде кестеге сәйкес барлық тапсырмалар толығымен орындалды. Біздің нәтижелеріміз сау адамдармен салыстырғанда АА пациенттеріндегі бактериялардың түрі, класы, тәртібі және тектік деңгейлері бойынша айтарлықтай айырмашылықтарды көрсетті.

Внедрение результатов реализации научно-исследовательской работы не предусмотрено.

Ғылыми-зерттеу жұмыстарын орындау нәтижелерінің іске асырылуы көзделмеген.

Эффективность реализации научно-исследовательской работы высокая и обусловлена возможностью наращивания потенциала развития отечественной науки, публикацией работ в международных рецензируемых журналах и их цитируемостью.

Ғылыми-зерттеу жұмыстарын жүзеге асырудың тиімділігі жоғары және отандық ғылымның даму әлеуетін арттыру, халықаралық рецензияланған журналдарда жұмыстарды жариялау және оларға сілтеме жасау мүмкіндігімен түсіндіріледі.

биомедицина

биомедицина

UDC indices
579.61
International classifier codes
76.03.43;
Key words in Russian
болезнь Альцгеймера; кишечный микробиом; оральный микробиом; микробиом; Нейродегенерация;
Key words in Kazakh
Альцгеймер ауруы; ішек микробиомы; ауыз микробиомы; микробиомы; Нейродегенерациясы;
Head of the organization Сарбасов Дос Журмаханбетович Dr.,Ph.D. Biochemistry and Molecular Biology / Professor
Head of work Аскарова Шолпан Несипбаевна PhD in Bioengineering, кандидат биологических наук / Professor