Inventory number IRN Number of state registration
0322РК00304 AP09259105-KC-22 0121РК00208
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Краткие сведения Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 0
International publications: 0 Publications Web of science: 0 Publications Scopus: 0
Patents Amount of funding Code of the program
0 23000000 AP09259105
Name of work
Изучение распространенности и генотипов коксиелл Бернета (Coxiella burnetii) в южном регионе Казахстана
Type of work Source of funding Report authors
Fundamental Дмитровский Андрей Михайлович
0
0
0
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) МНВО РК
Full name of the service recipient
Товарищество с ограниченной ответственностью "Национальный центр биотехнологии"
Abbreviated name of the service recipient ТОО "Национальный центр биотехнологии"
Abstract

Клещи (Acari), выделенные из них препараты ДНК, а также сыворотки и цельная кровь сельскохозяйственных животных и выделенные из крови препараты ДНК.

Кенелер (Acari), олардан бөлінген ДНҚ препараттары, сондай-ақ ауыл шаруашылығы жануарларының сарысулары мен толық қаны және қаннан бөлінген ДНҚ препараттары.

Изучение распространения C. burnetii в южном регионе Казахстана

Қазақстанның оңтүстік аймағындағы C. burnetii таралуын зерттеу

Cбор клещей методом «флага» и с укушенных животных; картографический анализ, ГИС-картирование; морфологическая видовая идентификация клещей; гомогенизация клещей; экстракция препаратов ДНК; спектрофотометрия; забор крови у животных и получение из нее сыворотки; ИФА; методы описательной и аналитической эпидемиологии; статистические методы; классичекая ПЦР и ПЦР в реальном времени, электрофорез нуклеиновых кислот в агарозном геле, элюция ДНК из геля, секвенирование ДНК по Сэнгеру.

Кенелерді «жалау» әдісімен және шаққан жануарлардан жинау; картографиялық талдау, ГАЖ-карта жасау; кенелердің морфологиялық түрлерін анықтау; кенелерді гомогенизациялау; ДНҚ препараттарының экстракциясы; спектрофотометрия; жануарлардан қан алу және одан сарысу алу; ИФТ; сипаттамалық және аналитикалық эпидемиология әдістері; статистикалық әдістер; классикалық ПТР және нақты уақыттағы ПТР, агарозды гельдегі нуклеин қышқылының электрофорезі, гельден ДНҚ элюциясы, Сэнгердің ДНҚ секвенциясы.

Изучена распространённость C. burnetii среди сельскохозяйственных животных и клещей южного региона Казахстана. Для этого: 1) Организован и проведен полевой сбор иксодовых клещей, потенциальных резервуаров коксиеллеза, в эпид. сезон 2022 г. на территории Жамбылской (99 клещей) и Алматинской (59 клещей) областях. Всего собрано 158 клещей, определена их видовая принадлежность. Проведено занесение всех данных в базу. 2) Из собранных клещей получены гомогенаты, выделены препараты ДНК. Проведен анализ 142 образцов ДНК методом ПЦР в реальном времени на наличие ДНК C. burnetii, выявлено 14,8% положительных образцов 3) Для серологического мониторинга проведен сбор образцов сыворотки у 216 жителей Жамбылской области. 4) Проведен серологический анализ сывороток крови от 189 Ovis aries и 186 Bos taurus, собранных в 2019 и 2022 гг, соответственно. Серопревалентность составила 38,1% и 2,1%, соответственно. 5) Проведен эпидемиологический анализ данных серомониторинга домашнего скота. Показано, что проживание в Байдибекском районе Туркестанской области и в районе Турар Рыскулов Жамбылской области являются факторами риска инфицирования C. burnetii. 6) Проведена генетическая характеризация циркулирующих штаммов C. burnetii. Установлено, что один из изолятов, выявленный в клеще, принадлежащем к виду На. sulcata, был на 95,7% идентичен Uncultured Coxiella sp. clone T3115 (KJ459074.1). 7) Разработаны четыре стандартные операционные процедуры (СОП), связанные с проведением работ по проекту.

Қазақстанның оңтүстік өңірінің ауылшаруашылық жануарлары мен кенелер арасында C. burnetii таралуы зерттелді: 2022 жылғы маусымда Жамбыл және Алматы облыстарында (99 және 59 кене), барлығы 158 кене, олардың түр сәйкестігі анықталды, барлық деректер базаға енгізілді. 2) Жиналған кенелерден гомогенаттар алынды, 142 ДНҚ препараты бөлініп алынды. C. burnetii ДНҚ болуы үшін нақты уақыт ПТР талдауы жүргізілді. 14,8% оң сынамалардың табылды. 3) Серологиялық мониторинг үшін Жамбыл облысының 216 тұрғынынан сарысу сынамалары алынды. 4) 2019 және 2022 жылдары жиналған 189 Овис тоқты және 186 Бос таурус қан сарысуларына серологиялық талдау жүргізілді. Серопреваленттілік сәйкесінше 38,1% және 2,1% құрады. 5) Малдың серомониторлық мәліметтеріне эпидемиологиялық талдау жүргізілді. Түркістан облысы Бәйдібек ауданында және Жамбыл облысы Тұрар Рысқұлов ауданында тұратындар C. burnetii жұқтырудың қауіп факторлары екені көрсетілген. 6) C. burnetii циркуляциялық штаммдарының генетикалық сипаттамасы жүргізілді. На sulcata кенесінің бір изолят Uncultured Coxiella sp. T3115 клонына 95,7% ұқсас болды (KJ459074.1). 7) Төрт стандартты операциялық процедуралар (СОР) әзірленді.

Синтезированы и очищены праймеры для детекции и генетической характеризации C. burnetii. Построено филогенетическое дерево по локусам гена 16S рРНК с секвенированными участками генома отечественного изолята C. burnetii. Выявлены эпизоотически благополучные и напряженные в отношении коксиеллёза районы южного региона Казахстана, что может быть использовано для проведения зонирования и регионализации территории страны в отношении данной инфекции.

C. burnetii анықтау және генетикалық сипаттамасы үшін праймерлер синтезделді және тазартылды. Отандық C. burnetii изолятының геномының реттелген аймақтары бар 16S рРНҚ генінің локустары бойынша филогенетикалық ағаш салынды. Қазақстанның оңтүстік өңірінің коксиеллезге қатысты эпизоотиялық қауіпсіз және шиеленісті аймақтары анықталды, оларды осы инфекцияға қатысты ел аумағын аудандастыру және аудандастыру үшін пайдалануға болады.

Не внедрено.

Енгізілмеген.

Все запланированные работы выполнены в срок и в полном объеме.

Барлық тапсырмалар мерзімінде және толық көлемде орындалды.

Эпидемиология, микробиология. Полученные результаты помогут разработать систему эпидемиологического надзора за коксиеллезом в Казахстане.

Эпидемиология, микробиология. Алынған нәтижелер Қазақстанда коксиеллезді эпидемиологиялық қадағалау жүйесін әзірлеуге көмектеседі.

UDC indices
573.6; 616.093; 579.083.13; 577.2.01
International classifier codes
62.00.00;
Key words in Russian
Coxiella burnetii; Ку-лихорадка; генотип; эпидемиология; клещи;
Key words in Kazakh
Coxiella burnetii; Ку-безгегі; генотип; эпидемиология; кенелер;
Head of the organization Раманкулов Ерлан Мирхайдарович Ph.D / Профессор
Head of work Дмитровский Андрей Михайлович Доктор медицинских наук / профессор