Inventory number | IRN | Number of state registration | ||
---|---|---|---|---|
0322РК00081 | AP09259027-KC-22 | 0121РК00170 | ||
Document type | Terms of distribution | Availability of implementation | ||
Краткие сведения | Gratis | Number of implementation: 0 Not implemented |
||
Publications | ||||
Native publications: 1 | ||||
International publications: 3 | Publications Web of science: 0 | Publications Scopus: 2 | ||
Patents | Amount of funding | Code of the program | ||
0 | 21000000 | AP09259027 | ||
Name of work | ||||
Изучение генетического разнообразия видов рода Juniperus L., произрастающих в Казахстане. | ||||
Type of work | Source of funding | Report authors | ||
Fundamental | Альмерекова Шырын Семизбайкызы | |||
0
0
0
0
|
||||
Customer | МНВО РК | |||
Information on the executing organization | ||||
Short name of the ministry (establishment) | МНВО РК | |||
Full name of the service recipient | ||||
Республиканское Государственное предприятие на праве хозяйственного ведения "Институт Биологии и биотехнологии растений" | ||||
Abbreviated name of the service recipient | РГП на ПХВ «ИББР» | |||
Abstract | ||||
Объекты исследований – виды рода Juniperus L., произрастающие в Казахстане. Зерттеу нысандары – Қазақстанда өсетін Juniperus L. туысы түрлері. Цель работы – изучить внутри- и межвидовое генетическое разнообразие семи видов можжевельника Казахстана на основе использования полиморфных и информативных ДНК-маркеров, в том числе и по нуклеотидным последовательностям хлоропластных геномов видов с использованием геномных технологий нового поколения. Жұмыстың мақсаты – полиморфты және ақпаратты ДНҚ-маркерлерін пайдалану негізінде, оның ішінде жаңа буынның геномдық технологияларын қолдана отырып, түрлердің хлоропласттық геномдарының нуклеотидтік тізбегі бойынша Қазақстандағы аршалардың жеті түрінің түрішілік және түраралық генетикалық алуантүрлілігін зерттеу. Основные методы исследований – сбор популяций, определение видовой принадлежности растений и документирование, выделение ДНК, полимеразная цепная реакция (ПЦР), электрофорез, определение нуклеотидных последовательностей с использованием ДНК-анализатора, полногеномное секвенирование нового поколения. В работе использованы статистические прикладные программы MEGA, GenAlEx, PopGene, DnaSP6 и др. Зерттеудің негізгі әдістері – популяцияларды жинау, өсімдік түрлерін анықтау және құжаттау, ДНҚ бөлу, полимеразды тізбекті реакция (ПТР), электрофорез, ДНҚ -анализаторын қолдану арқылы нуклеотидтер тізбегін анықтау, жаңа буынды толық геномдық секвенирлеу. Жұмыста MEGA, GenAlEx, PopGene, DnaSP6 және т.б. статистикалық қолданбалы бағдарламалары қолданылды. Полученные результаты и их новизна. Осуществлен сбор природных популяций видов можжевельника – J. pseudosabina, J. sabina, J. communis, J. semiglobosa, J. seravschanica, J. sibirica и J. x media в восточном, северном, южном и юго-восточном Казахстане. Определены ценопопуляционные характеристики краснокнижного вида J. seravschanica. Определены филогенетические связи видов рода Juniperus Казахстана на основе использования ДНК-маркера ядерного генома – ITS. Применение данного маркера позволило разделить образцы изученных видов можжевельника на два основных клада, соответствующих 2 секциям, Juniperus и Sabina. Депонированы в международную базу данных NCBI 6 нуклеотидных последовательностей ITS видов J. seravschanica, J. semiglobosa, J. communis и J. pseudosabina. Осуществлено генотипирование популяций видов можжевельника с использованием микросателлитных ДНК-маркеров. Проанализировано 15 популяций J. seravschanica (по 16 маркерам), 4 популяции J. sabina (по 10 маркерам) и 2 популяции J. turkestanica (= J. pseudosabina) (по 10 маркерам). Проведена статистическая обработка для 15 популяций J. seravschanica. Осуществлено секвенирование хлоропластного генома вида J. turkestanica (= J. pseudosabina) на платформе Illumina: NovaSeq 6000. Алынған нәтижелер және олардың жаңалығы. Шығыс, солтүстік, оңтүстік және оңтүстік–шығыс Қазақстандағы J. pseudosabina, J. sabina, J. communis, J. semiglobosa, J. seravschanica, J. sibirica және J. x media арша түрлерінің табиғи популяциялары жиналды. Қызыл кітапқа енгізілген J. seravschanica түрінің ценопопуляциялық сипаттамалары анықталды. Ядролық геномның ДНҚ-маркерін – ITS пайдалану негізінде Қазақстанның Juniperus туысы түрлерінің филогенетикалық байланыстары айқындалды. Бұл маркерді қолдану зерттелген арша түрлерінің үлгілерін екі секцияға Juniperus және Sabina сәйкес 2 негізгі бөлімге бөлуге мүмкіндік берді. J. seravschanica, J. semiglobosa, J. communis және J. pseudosabina түрлерінің 6 нуклеотидті ITS тізбегі NCBI халықаралық деректер базасына енгізілді. Арша түрлерінің популяцияларын генотиптеу микросателлиттік ДНҚ-маркерлерінің көмегімен жүргізілді. J. seravschanica 15 популяциясы (16 маркер бойынша), J. sabina 4 популяциясы (10 маркер) және J. turkestanica (= J. pseudosabina) 2 популяциясы (10 маркер) талданды. J. seravschanica 15 популяциясына статистикалық өңдеу жүргізілді. J. turkestanica (= J. pseudosabina) түріне хлоропласттық геномын секвенирлеу Illumina: NovaSeq 6000 платформасында жүргізілді. Коллекция популяций 7 видов Juniperus – J. pseudosabina, J. sabina, J. communis, J. semiglobosa, J. seravschanica, J. sibirica и J. x intermedia, произрастающих в Казахстане (29 популяций). Коллекция популяций можжевельников, проанализированная по маркеру ядерного генома ITS и 16 микросателлитным маркерам. Изученный хлоропластный геном J. turkestanica (= J. pseudosabina) Казахстана. Қазақстанда өсетін 7 арша түрінің популяцияларының коллекциясы – J. pseudosabina, J.sabina, J. communis, J. semiglobosa, J. seravschanica, J. sibirica және J. x intermedia (29 популяция). Ядролық геномының ITS маркері және 16 микросателлиттік маркерлері негізінде талданған арша популяцияларының коллекциясы. Қазақстанның J. turkestanica (= J. pseudosabina) зерттелген хлоропласттық геномы. Степень внедрения: 6 нуклеотидных последовательностей депонированы в БД NCBI. Еңгізілу дәрежесі: 6 нуклеотид тізбегі NCBI ДБ енгізілді. Эффективность: Полученные данные могут быть использованы для разработки научных рекомендации по сохранению генетических ресурсов можжевельника в стране. Тиімділігі: Алынған мәліметтерді еліміздегі аршаның генетикалық ресурстарын сақтау бойынша ғылыми ұсыныстар әзірлеуге пайдалануға болады. Область применения: молекулярная систематика, популяционная и молекулярная генетика. Қолдану саласы: молекулалық систематика, популяциялық және молекулалық генетика. |
||||
UDC indices | ||||
577.21; 575.17; 504.062 | ||||
International classifier codes | ||||
34.15.23; 34.23.35; 87.35.00; 87.35.29; | ||||
Key words in Russian | ||||
Juniperus; генетическое разнообразие; ITS маркеры; микросателлитные маркеры; геномные технологии нового поколения; хлоропластный геном; | ||||
Key words in Kazakh | ||||
Juniperus; генетикалық алуантүрлілік; ITS маркерлері; микросателлиттік маркерлер; жаңа буынды геномдық технологиялар; хлоропласттық геном; | ||||
Head of the organization | Жамбакин Кабыл Жапарович | Доктор биологических наук / профессор | ||
Head of work | Альмерекова Шырын Семизбайкызы | PhD / нет |