Inventory number IRN Number of state registration
0322РК00081 AP09259027-KC-22 0121РК00170
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Краткие сведения Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 1
International publications: 3 Publications Web of science: 0 Publications Scopus: 2
Patents Amount of funding Code of the program
0 21000000 AP09259027
Name of work
Изучение генетического разнообразия видов рода Juniperus L., произрастающих в Казахстане.
Type of work Source of funding Report authors
Fundamental Альмерекова Шырын Семизбайкызы
0
0
0
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) МНВО РК
Full name of the service recipient
Республиканское Государственное предприятие на праве хозяйственного ведения "Институт Биологии и биотехнологии растений"
Abbreviated name of the service recipient РГП на ПХВ «ИББР»
Abstract

Объекты исследований – виды рода Juniperus L., произрастающие в Казахстане.

Зерттеу нысандары – Қазақстанда өсетін Juniperus L. туысы түрлері.

Цель работы – изучить внутри- и межвидовое генетическое разнообразие семи видов можжевельника Казахстана на основе использования полиморфных и информативных ДНК-маркеров, в том числе и по нуклеотидным последовательностям хлоропластных геномов видов с использованием геномных технологий нового поколения.

Жұмыстың мақсаты – полиморфты және ақпаратты ДНҚ-маркерлерін пайдалану негізінде, оның ішінде жаңа буынның геномдық технологияларын қолдана отырып, түрлердің хлоропласттық геномдарының нуклеотидтік тізбегі бойынша Қазақстандағы аршалардың жеті түрінің түрішілік және түраралық генетикалық алуантүрлілігін зерттеу.

Основные методы исследований – сбор популяций, определение видовой принадлежности растений и документирование, выделение ДНК, полимеразная цепная реакция (ПЦР), электрофорез, определение нуклеотидных последовательностей с использованием ДНК-анализатора, полногеномное секвенирование нового поколения. В работе использованы статистические прикладные программы MEGA, GenAlEx, PopGene, DnaSP6 и др.

Зерттеудің негізгі әдістері – популяцияларды жинау, өсімдік түрлерін анықтау және құжаттау, ДНҚ бөлу, полимеразды тізбекті реакция (ПТР), электрофорез, ДНҚ -анализаторын қолдану арқылы нуклеотидтер тізбегін анықтау, жаңа буынды толық геномдық секвенирлеу. Жұмыста MEGA, GenAlEx, PopGene, DnaSP6 және т.б. статистикалық қолданбалы бағдарламалары қолданылды.

Полученные результаты и их новизна. Осуществлен сбор природных популяций видов можжевельника – J. pseudosabina, J. sabina, J. communis, J. semiglobosa, J. seravschanica, J. sibirica и J. x media в восточном, северном, южном и юго-восточном Казахстане. Определены ценопопуляционные характеристики краснокнижного вида J. seravschanica. Определены филогенетические связи видов рода Juniperus Казахстана на основе использования ДНК-маркера ядерного генома – ITS. Применение данного маркера позволило разделить образцы изученных видов можжевельника на два основных клада, соответствующих 2 секциям, Juniperus и Sabina. Депонированы в международную базу данных NCBI 6 нуклеотидных последовательностей ITS видов J. seravschanica, J. semiglobosa, J. communis и J. pseudosabina. Осуществлено генотипирование популяций видов можжевельника с использованием микросателлитных ДНК-маркеров. Проанализировано 15 популяций J. seravschanica (по 16 маркерам), 4 популяции J. sabina (по 10 маркерам) и 2 популяции J. turkestanica (= J. pseudosabina) (по 10 маркерам). Проведена статистическая обработка для 15 популяций J. seravschanica. Осуществлено секвенирование хлоропластного генома вида J. turkestanica (= J. pseudosabina) на платформе Illumina: NovaSeq 6000.

Алынған нәтижелер және олардың жаңалығы. Шығыс, солтүстік, оңтүстік және оңтүстік–шығыс Қазақстандағы J. pseudosabina, J. sabina, J. communis, J. semiglobosa, J. seravschanica, J. sibirica және J. x media арша түрлерінің табиғи популяциялары жиналды. Қызыл кітапқа енгізілген J. seravschanica түрінің ценопопуляциялық сипаттамалары анықталды. Ядролық геномның ДНҚ-маркерін – ITS пайдалану негізінде Қазақстанның Juniperus туысы түрлерінің филогенетикалық байланыстары айқындалды. Бұл маркерді қолдану зерттелген арша түрлерінің үлгілерін екі секцияға Juniperus және Sabina сәйкес 2 негізгі бөлімге бөлуге мүмкіндік берді. J. seravschanica, J. semiglobosa, J. communis және J. pseudosabina түрлерінің 6 нуклеотидті ITS тізбегі NCBI халықаралық деректер базасына енгізілді. Арша түрлерінің популяцияларын генотиптеу микросателлиттік ДНҚ-маркерлерінің көмегімен жүргізілді. J. seravschanica 15 популяциясы (16 маркер бойынша), J. sabina 4 популяциясы (10 маркер) және J. turkestanica (= J. pseudosabina) 2 популяциясы (10 маркер) талданды. J. seravschanica 15 популяциясына статистикалық өңдеу жүргізілді. J. turkestanica (= J. pseudosabina) түріне хлоропласттық геномын секвенирлеу Illumina: NovaSeq 6000 платформасында жүргізілді.

Коллекция популяций 7 видов Juniperus – J. pseudosabina, J. sabina, J. communis, J. semiglobosa, J. seravschanica, J. sibirica и J. x intermedia, произрастающих в Казахстане (29 популяций). Коллекция популяций можжевельников, проанализированная по маркеру ядерного генома ITS и 16 микросателлитным маркерам. Изученный хлоропластный геном J. turkestanica (= J. pseudosabina) Казахстана.

Қазақстанда өсетін 7 арша түрінің популяцияларының коллекциясы – J. pseudosabina, J.sabina, J. communis, J. semiglobosa, J. seravschanica, J. sibirica және J. x intermedia (29 популяция). Ядролық геномының ITS маркері және 16 микросателлиттік маркерлері негізінде талданған арша популяцияларының коллекциясы. Қазақстанның J. turkestanica (= J. pseudosabina) зерттелген хлоропласттық геномы.

Степень внедрения: 6 нуклеотидных последовательностей депонированы в БД NCBI.

Еңгізілу дәрежесі: 6 нуклеотид тізбегі NCBI ДБ енгізілді.

Эффективность: Полученные данные могут быть использованы для разработки научных рекомендации по сохранению генетических ресурсов можжевельника в стране.

Тиімділігі: Алынған мәліметтерді еліміздегі аршаның генетикалық ресурстарын сақтау бойынша ғылыми ұсыныстар әзірлеуге пайдалануға болады.

Область применения: молекулярная систематика, популяционная и молекулярная генетика.

Қолдану саласы: молекулалық систематика, популяциялық және молекулалық генетика.

UDC indices
577.21; 575.17; 504.062
International classifier codes
34.15.23; 34.23.35; 87.35.00; 87.35.29;
Key words in Russian
Juniperus; генетическое разнообразие; ITS маркеры; микросателлитные маркеры; геномные технологии нового поколения; хлоропластный геном;
Key words in Kazakh
Juniperus; генетикалық алуантүрлілік; ITS маркерлері; микросателлиттік маркерлер; жаңа буынды геномдық технологиялар; хлоропласттық геном;
Head of the organization Жамбакин Кабыл Жапарович Доктор биологических наук / профессор
Head of work Альмерекова Шырын Семизбайкызы PhD / нет