The object of research, development or design (in Russian) : Объектом исследования являются штаммы вируса SARS-COV-2

The object of research, development or design (in Kazakh) : Зерттеу нысаны болып SARS-COV-2 вирусының штамдары болып табылады

Aim of work (in Russian) : Целью данного проекта является определение противовирусной активности современных лекарственных препаратов в отношении вируса SARS-COV-2 in vitro. Мониторинг и выявление возбудителя COVID-19 в популяции летучих мышей. Проведение молекулярно-эпидемиологического анализа циркулирующих штаммов, выделенных в пандемический и постпандемический периоды.

Aim of work (in Kazakh) : Бұл жобаның мақсаты in vitro жағдайында SARS-COV-2 вирусына қарсы заманауи препараттардың вирусқа қарсы белсенділігін анықтау болып табылады. Жарғанаттар популяциясында COVID-19 қоздырғышын бақылау және анықтау. Пандемия және постпандемия кезеңдерінде оқшауланған және таралған штаммдардың молекулалық эпидемиологиялық талдауын жасау.

Методы исследования (на русском) : Исследования проводятся с использованием современных методов молекулярной биологии и генной инженерии. В НИИПББ внедрена практика исследования инфекционных агентов от первичной диагностики и идентификации до выделения возбудителя с последующим изучением молекулярно-биологических свойств методами электронной микроскопии, ПЦР в Реальном Времени и секвенирование (Sanger, NGS). Все исследовательские работы, выполняемые в ходе реализации проекта состоят из 8 (восьми) основных этапов: Изучение противовирусной активности современных лекарственных препаратов в отношении вируса SARS-COV-2 in vitro. Эпидемиологический мониторинг и отбор проб; Электронная микроскопия вирусов; Идентификация методами ПЦР в Реальном Времени, ОТ- ПЦР и с использованием олигнуклеотидного микрочипа; Выделение изолятов, изучение биологических свойств вирусов; Депонирование штаммов в «Коллекцию микроорганизмов» НИИПББ; Секвенирование значимых генов вирусов: Spike pritein, Envelope proteine, RdRP gene. Сравнительный и филогенетический анализ нуклеотидной последовательности генов; Загрузка полногеномной нуклеотидной последовательности в базу данных GenBank и оформление публикация отечественных и зарубежных статей, тезисов и патентов.

Методы исследования (на казахском) : Зерттеулер молекулярлық биология мен гендік инженерияның заманауи әдістерін қолдану арқылы жүзеге асырылады. БҚПЗИ-да бастапқы диагностика мен анықтаудан бастап қоздырғышты оқшаулауға дейін жұқпалы агенттерді зерттеу тәжірибесін енгізді, содан кейін электронды микроскопия, нақты уақыттағы ПТР және секвенирлеу (Сэнгер, NGS) арқылы молекулалық биологиялық қасиеттерді зерттеу әдістері қолданылады. Жобаны жүзеге асыру барысында жүргізілетін барлық ғылыми-зерттеу жұмыстары 8 (сегіз) негізгі кезеңнен тұрады: - SARS-COV-2 вирусына қарсы заманауи препараттардың вирусқа қарсы белсенділігін in vitro зерттеу. - Эпидемиологиялық мониторинг және сынама алу; - Вирустардың электронды микроскопиясы; - Нақты уақыттағы ПТР, RT-ПТР және олигонуклеотидті микрочипті қолдану арқылы сәйкестендіру; - Изоляттарды бөліп алу, вирустардың биологиялық қасиеттерін зерттеу; - БҚПЗИ «Микроорганизмдер коллекциясында» штаммдарды тіркеу; - Маңызды вирустық гендердің секвенциясы: Spike pritein, Envelope proteine, RdRP гені; - Гендердің нуклеотидтер тізбегін салыстырмалы және филогенетикалық талдау; - Бүкіл геномдық нуклеотидтер тізбегін GenBank дерекқорына жүктеу және отандық және шетелдік мақалаларды, тезистерді және патенттерді жариялауды ресімдеу.

Obtained results and novelty (in Russian) : Проведен анализ состава современных лекарственных препаратов, способных ингибировать воздействие вируса SARS-COV-2 in vitro. В результате анализа были выбраны следующие препараты: Тромбовазим® (Trombovazim®), Ремдесивир (Remdesivir), Калетра® (Kaletra), Лопинавир/ритонавир, тенофовир, Рибавирин (Ribavirin), Авифавир (Avifavir), интерферон-альфа и Дексаметазон (Dexamethasone). Проводятся исследования по изучению противовирусной активности современных лекарственных препаратов в отношении вируса SARS-COV-2 in vitro с использованием вышеуказанных препаратов. В периоде с 14.06.2021 г. по 03.07.2021 г. был проведен экспедиционный выезд по сбору летучих мышей. Согласно поставленным задачам по маршруту «пгт. Гвардейский - с. Кордай – с. Мерке – г. Тараз – г. Туркестан – пгт. Гвардейский» были собраны образцы в колличестве 139 проб. Собранные в результате мониторинга пробы (139 образцов) исследованы с использованием метода реал-тайм ПЦР. Все положительные образцы направлены на серии "слепых пассажей" с целью выделения вируса в культуре клеток. Проведена морфометрия изолятов вируса SARS-COV-2 на электронном микроскопе JEOL Jem-100 (Япония). Установлено, что вирионы сферической формы, размером 120-125 нанометров. Все положительные образцы направлены на серии "слепых пассажей" с целью выделения вируса в культуре клеток Vero. Выделенные изоляты после генетической паспортизации подготовлены для депонирования.

Obtained results and novelty (in Kazakh) : SARS-COV-2 вирусының in vitro әсерін тежеуге қабілетті заманауи препараттардың құрамына талдау жүргізілді. Талдау нәтижесінде келесі препараттар таңдалды: Тромбовазим®, Ремдесивир, Калетра®, Лопинавир/ритонавир, тенофовир, Рибавирин, Авифавир, альфа интерферон (Дексаметазон) және Dexamethasone. Жоғарыда аталған препараттарды қолдану арқылы in vitro жағдайында SARS-COV-2 вирусына қарсы заманауи препараттардың вирусқа қарсы белсенділігін зерттеу бойынша зерттеулер жүргізілуде. 2021 жылдың 14 маусымы мен 2021 жылдың 3 шілдесі аралығында жарғанаттарды жинау бойынша экспедиция сапары өткізілді. Маршрут бойынша қойылған міндеттерге сәйкес «Гвардейский - Қордай - Меркі - Тараз қаласы - Түркістан қаласы - Гвардейский» 139 сынама үлгілері жиналды. Мониторинг нәтижесінде жиналған үлгілер (139 үлгі) нақты уақыттағы ПТР әдісімен зерттелді. Барлық оң үлгілер Vero жасуша өсіндісінде вирусты оқшаулау үшін «соқыр пассаждау» сериясына жіберілді. SARS-COV-2 вирусының изоляттарының морфометриясы JEOL Jem-100 электронды микроскопының (Жапония) көмегімен жүргізілді. Вириондар шар тәрізді, көлемі 120-125 нанометр болатыны анықталды. Барлық позитивті үлгілер Vero жасушаларының өсіндісінде вирусты оқшаулау үшін «соқыр жолдар» сериясына жіберіледі. Оқшауланған изоляттар генетикалық талдаудан кейін депонирлеу үшін дайындалды.

The main constructive and technical economic indicators (in Russian) : Проведен анализ состава современных лекарственных препаратов, способных ингибировать воздействие вируса SARS-COV-2 in vitro. В результате анализа были выбраны следующие препараты: Тромбовазим® (Trombovazim®), Ремдесивир (Remdesivir), Калетра® (Kaletra), Лопинавир/ритонавир, тенофовир, Рибавирин (Ribavirin), Авифавир (Avifavir), интерферон-альфа и Дексаметазон (Dexamethasone). Собранные в результате мониторинга пробы (139 образцов) исследованы с использованием метода реал-тайм ПЦР. Все положительные образцы направлены на серии "слепых пассажей" с целью выделения вируса в культуре клеток. Проведена морфометрия изолятов вируса SARS-COV-2 на электронном микроскопе JEOL Jem-100 (Япония). В результате проведенной электронной микроскопии изолятов вируса SARS-COV-2 определены морфометрические характеристики вирионов. Установлено, что вирионы сферической формы, размером 120-125 нанометров. Для данных вирионов характерно наличие шипов (поверхностные гликопротеиды), длиной порядка 10-15 нанометров.

The main constructive and technical economic indicators (in Kazakh) : SARS-COV-2 вирусының in vitro әсерін тежеуге қабілетті заманауи препараттардың құрамына талдау жүргізілді. Талдау нәтижесінде келесі препараттар таңдалды: Тромбовазим®, Ремдесивир, Калетра®, Лопинавир/ритонавир, тенофовир, Рибавирин, Авифавир, альфа интерферон (Дексаметазон) және Dexamethasone. Мониторинг нәтижесінде жиналған үлгілер (139 үлгі) нақты уақыттағы ПТР әдісімен зерттелді. Барлық оң үлгілер жасуша мәдениетінде вирусты оқшаулау үшін «соқыр жолдар» сериясына жіберіледі. SARS-COV-2 вирусының изоляттарының морфометриясы JEOL Jem-100 электронды микроскопының (Жапония) көмегімен жүргізілді. SARS-COV-2 вирусының изоляттарын электронды микроскопиялау нәтижесінде вириондардың морфометриялық сипаттамалары анықталды. Вириондар шар тәрізді, көлемі 120-125 нанометр болатыны анықталды. Бұл вириондар ұзындығы шамамен 10-15 нанометр тікенектердің (беттік гликопротеидтердің) болуымен сипатталады.

Level of implementation (in Russian) :

Level of implementation (in Kazakh) :

Efficiency (in Russian) :

Efficiency (in Kazakh) :

Field of application (in Russian) : Результаты данных исследований могут быть применены в области вирусологии и молекулярной биологии, а также для оптимизации терапии при заболевании COVID-19.

Field of application (in Kazakh) : Бұл зерттеулердің нәтижелері вирусология және молекулалық биология саласында, сондай-ақ COVID-19 ауруының терапиясын оңтайландыру үшін қолданылу мүмкін.