The object of research, development or design (in Russian) : Сальмонеллезный аборт лошадей (Salmonella abortus equi)

The object of research, development or design (in Kazakh) : Жылқылардың сальмонеллездік іш тастауы (Salmonella abortus equi)

Aim of work (in Russian) : Отбор проб образцов материала из хозяйств северных регионов РК, их исследование методом ИФА и ПЦР, генотипирование выделенных изолятов

Aim of work (in Kazakh) : ҚР солтүстік облыстарының шаруашылықтарынан материал сынамаларын іріктеп, оларды ИФТ және ПТР зерттеп, оқшауланған изоляттарды генотиптеу.

Методы исследования (на русском) : Микробиологические, иммунологические, молекулярно-генетические.

Методы исследования (на казахском) : Микробиологиялық, иммунологиялық, молекулалы-генетикалық.

Obtained results and novelty (in Russian) : Проведен отбор 247 проб биологического материала от лошадей из хозяйств северных регионов РК и проведено их исследование иммунологическими и молекулярно-генетическими методами (ИФА и ПЦР). Пробы, оказавшиеся положительными по результатам хотя бы одного из тестов, использовали для выделения изолятов бактерий S. enterica subsp. enterica serovar abortus equi и последующего изучения. В результате микробиологических исследований выделен 41 изолят бактерий, из бактериальной массы которых выделена ДНК высокой чистоты. Выделенные ДНК изолятов использовали для генотипирования методом анализа фрагмента 16S rRNA гена. В результате 7 изолятов были идентифицированных как Salmonella enterica. Проведено полногеномное секвенирование 7 изолятов S. enterica. Количество полученных прочтений варьировало от 587918 до 1463230 на изолят. Средняя длина прочтений варьировала от 261 до 269 п.н. Метрика GC% составила 53%. Доля дуплицирующихся последовательностей варьировалась от 8,2% до 18,5%. Собрано 4 генома изолятов S. enterica. Количество контигов в сборках и метрика N50 варьировались от 281 до 1275 и от 5785 до 33454, соответственно. В результате сравнения в BLAST, все полученные нуклеотидные последовательности имели максимальную идентичность (99-100%) с нуклеотидными последовательностями вида Salmonella enterica. Новизна исследований: проведено полногеномное секвенирование и генотипирование возбудителя сальмонелезного аборта лошадей выделенного на территории Казахстана.

Obtained results and novelty (in Kazakh) : ҚР солтүстік облыстарының шаруашылықтарынан жылқылардан 247 биологиялық материал сынамасы алынды және олар иммунологиялық, молекулалық-генетикалық әдістермен (ИФТ және ПТР) зерттелді. Сынақтардың кем дегенде біреуі бойынша оң болған сынамалар S. enterica subsp. enterica serovar abortus equi бактериясын оқшаулау үшін және кейінгі зерттеулер үшін пайдаланылды. Микробиологиялық зерттеулер нәтижесінде 41 бактерия изоляты бөлініп алынды, олардың бактериялық массасынан жоғары тазалықтағы ДНҚ бөлініп алынды. Оқшауланған ДНҚ изоляттары 16S rRNA генінің фрагментін талдау арқылы генотиптеу үшін пайдаланылды. Нәтижесінде 7 изолят Salmonella enterica болып анықталды. S.enterica-ның 7 изолятының толық геномдық секвенирлеуі жүргізілді. Алынған оқылымдардың саны бір изолят үшін 587 918-ден 1 463 230-ға дейін болды. Оқылымның орташа ұзындығы 261 ден 269 ж.н. дейін болды. GC% метрикасы 53% құрады. Қайталанатын тізбектердің үлесі 8,2%-дан 18,5%-ға дейін өзгерді. S.enterica изоляттарының 4 геномы жиналды. Жинақтардағы контигтер саны және N50 метрикасы сәйкесінше 281-ден 1275-ке дейін және 5785-тен 33454-ке дейін аралықта. BLAST-те салыстыру нәтижесінде барлық алынған нуклеотидтер тізбер Salmonella enterica түрінің нуклеотидтер тізбегімен максималды сәйкестікке (99-100%) ие болды. Зерттеудің жаңалығы: Қазақстан территориясында жылқылардың сальмонеллалық аборты қоздырғышының толық геномдық тізбегі секвенирленді және генотиптелді

The main constructive and technical economic indicators (in Russian) : Выделены бактериальные изоляты Salmonella spp. и проведено их секвенирование и генотипирование

The main constructive and technical economic indicators (in Kazakh) : Salmonella spp бактерияларының изоляттары бөлініп алынды және олар секвенирленді және генотиптелді

Level of implementation (in Russian) :

Level of implementation (in Kazakh) :

Efficiency (in Russian) :

Efficiency (in Kazakh) :

Field of application (in Russian) : Ветеринария

Field of application (in Kazakh) : Ветеринария