Inventory number | IRN | Number of state registration | ||
---|---|---|---|---|
0321РК00189 | AP09258993-KC-21 | 0121РК00430 | ||
Document type | Terms of distribution | Availability of implementation | ||
Краткие сведения | Gratis | Number of implementation: 0 Not implemented |
||
Publications | ||||
Native publications: 0 | ||||
International publications: 3 | Publications Web of science: 0 | Publications Scopus: 0 | ||
Patents | Amount of funding | Code of the program | ||
0 | 19992624.56 | AP09258993 | ||
Name of work | ||||
Молекулярная эволюция и экология вирусов гриппа А, циркулирующих среди диких птиц в Казахстане и выявление нового подтипа | ||||
Type of work | Source of funding | Report authors | ||
Fundamental | Кыдырманов Айдын Исагалиевич | |||
0
1
3
1
|
||||
Customer | МНВО РК | |||
Information on the executing organization | ||||
Short name of the ministry (establishment) | Нет | |||
Full name of the service recipient | ||||
ТОО "Научно-производственный центр микробиологии и вирусологии" | ||||
Abbreviated name of the service recipient | ТОО "Научно-производственный центр микробиологии и вирусологии" | |||
Abstract | ||||
Объектом исследования явились биологические образцы, ПЦР-положительные пробы а также гемагглютинирующие агенты, выделенные от диких птиц водного и околоводного комплексов в различных регионах Казахстана. Зерттеу нысаны Қазақстанның әртүрлі аймақтарындағы су мен су маңындағы кешендерінің жабайы құстарынан бөлінген биологиялық үлгілер, ПТР-оң үлгілер, сондай-ақ гемагглютининдеуші агенттер. Целью проекта является изучение возникновения и распространения новых вариантов и подтипа вирусов гриппа А среди диких птиц на территории Казахстана, их генетическое разнообразие и филогенетические взаимосвязи для получения новых данных о направлениях их эволюции и отбор наиболее актуальных вариантов для использования их в качестве вакцинных и диагностических препаратов. Жобаның мақсаты - Қазақстандағы жабайы құстар арасында А тұмауы вирустарының жаңа нұсқалары мен түртармағының пайда болуы мен таралуын, олардың эволюциясының бағыттары туралы жаңа мәліметтер алу үшін генетикалық әртүрлілігі мен филогенетикалық байланыстарын зерттеу және вакцина мен диагностикалық препарат ретінде қолдануға ең өзекті нұсқаларын таңдау. В работе использованы современные вирусологические, молекулярно-биологические, метагеномные методы исследований и проведен статистический анализ всех изученных показателей. Жұмыста заманауи вирусологиялық, молекулалық биологиялық, метагеномдық зерттеу әдістері қолданылды және барлық зерттелген параметрлерге статистикалық талдау жасалды. Для вирусологического исследования собрано 672 биологических образцов от 407 особей 28 видов диких птиц, относящихся к 14 семействам 8 отрядов из описанных в Казахстане 62 семейств 21 отряда орнитофауны. В результате первичного заражения развивающихся куриных эмбрионов с ПЦР-положительными образцами и двух последовательных пассажей изолированы шесть гемагглютинирующих агентов. Результаты ОТ-ПЦР показала наличие вирусоспецифической последовательности фрагмента РНК, кодирующего М-белок вируса гриппа А, в 17 пробах из 224 исследованных. Из коллекции лаборатории выявлена положительная в ПЦР на грипп А проба от утки голубой чернети. Методом секвенирования по Сенгеру была установлена полная открытая рамка считывания последовательности HA (1686 нт). Обширные поиски в базе данных показали, что ген HA имеет только 75,41% гомологии с наиболее близкими последовательностями подтипа H9 выделенных от диких и домашних птиц в мире, что подтверждает идентификацию нового подтипа вируса гриппа А – Н19. Вирусологиялық зерттеу үшін Қазақстанда сипатталған орнитофаунаның 21 отрядының 62 тұқымдасының 8 отрядының 14 тұқымдасына жататын жабайы құстардың 28 түрінің 407 басынан 672 биологиялық сынама алынды.ПТР-оң үлгілерімен дамып келе жатқан тауық эмбриондарын бірінші рет жұқтырып, оны ізінше екі рет пассаждан өткізу нәтижесінде алты гемагглютинациялаушы агент бөлініп алынды. КT-ПТР нәтижелері зерттелген 224 үлгінің 17-де А тұмауы вирусының М-ақуызын кодтайтын вирусқа тән РНҚ фрагменті тізбегінің болуын көрсетті. Зертхана коллекциясынан А тұмауына ПТР оң нәтиже берген көк сүңгуір үйректің сынамасы анықталды. Sanger тәсілімен секвендеу арқылы HA тізбегінің толық ашық оқу аясы (1686 нт) анықталды. Мәліметтер базасындағы ауқымды ізденістер оның HA гені шартараптың жабайы және үй құстарынан бөліп алған H9 типтармағы тізбегімен ең жоғары 75,41% гомологиялы болды, бұл тұмау А вирусының жаңа H19 типтармағы табылғанын айғақтайды. Данные о циркуляции ранее не идентифицированного, нового для науки подтипа вируса гриппа А в орнитофауне РК, а также новых актуальных и адаптированных к млекопитающим животным патогенных и реассортантных вариантов, представляющих эпидемическую и эпизоотическую значимость. Бүгінгі күнге дейін ажыратылып баланбаған, Қазақстан Республикасындағы авифаунада ғылым үшін жаңа А типті тұмаудың айналымда жүргені туралы нақты мәліметтердің болуы, сондай-ақ сүтқоректілерге бейімделген және эпидемиялық маңызы бар патогенді және реасортанттық нұсқаларының болуы.
Область применения: вирусология, медицинская вирусология, ветеринарная вирусология, молекулярная биология, экология, эпидемиология, эпизоотология. Қолданылуы: вирусология, медициналық вирусология, ветеринариялық вирусология, молекулалық биология, экология, эпидемиология, эпизоотология. |
||||
UDC indices | ||||
578.4 | ||||
International classifier codes | ||||
34.25.21; 34.25.29; 34.25.39; 34.15.31; 34.15.29; | ||||
Key words in Russian | ||||
вирус гриппа А; новый подтип гемагглютинина; секвенирование генома вируса; грипп птиц; молекулярная эволюция; молекулярная экология; вирусная инфекция; эпизоотия; филогенетическое древо; циркуляция вируса; | ||||
Key words in Kazakh | ||||
А тұмауы вирусы; гемагглютниннің жаңа типтармағы; вирус геномын секвендеу; құс тұмауы; молекулалық эволюция; молекулалық экология; вирустық инфекция; індет; филогенетикалық дарақ; вирустың айналымы; | ||||
Head of the organization | Саданов Аманкелди Курбанович | Доктор биологических наук / профессор, академик КазНАЕН | ||
Head of work | Кыдырманов Айдын Исагалиевич | Доктор ветеринарных наук / профессор |