The object of research, development or design (in Russian) : Объектом исследования являются рекомбинантные белки BAP-X и BirA-Y, где X, Y - Sox2, Oct4, Nanog и GFP.

The object of research, development or design (in Kazakh) : Зерттеу объектісі: BAP-X және BirA-Y, X, Y - Sox2, Oct4, Nanog және GFP рекомбинантты ақуыздар болып табылады.

Aim of work (in Russian) : Целью проекта является разработка способа мониторинга и количественного анализа пост-трансляционных модификаций рекомбинантных белков на основе транскрипционных факторов плюрипотентности Sox2, Oct4, Nanog, а также идентификация их белков-партнеров в ядрах эукариотических клеток с использованием сайт-специфичного и неспецифичного биотинилирования in vivo

Aim of work (in Kazakh) : Жобаның мақсаты, Sox2, Oct4, Nanog транскрипциялық плурипотенттілік факторлары негізінде рекомбинантты ақуыздардың кейінгі трансляциялық модификацияларын бақылау және сандық талдау әдісін жасау, сондай-ақ in vivo сайтқа тән және спецификалық емес биотинилирлеуді пайдалана отырып, эукариоттық жасуша ядроларындағы олардың серіктес ақуыздарын анықтау болып табылады.

Методы исследования (на русском) : Методы исследования: В работе были использованы молекулярно-биологические, биохимические, генетические методы анализа, а также масс-спектрометрия.

Методы исследования (на казахском) : Жұмыстың әдістері: Жұмыста молекулярлы-биологиялық, биохимиялық, генетикалық талдау әдістері және масс-спектрометрия қолданылды.

Obtained results and novelty (in Russian) : По результатам анализа рекомбинантых белков с помощью тандемной хромато-масс спектрометрии в различных режимах получены следующие данные. С помощью поисковой системы Mascot проведена идентификация белка Sox2 с высоким скором (Score; 2030) и покрытием сиквенса в (sequence coverage: 39%). На основании спектров MS/MS, идентифицированы 6 модифицированных форм пептида, входящего в активационный домен белка Sox2. Среди идентифицированных фосфорилированных и гликозилированных форм обнаружены две новые модифицированные формы, содержащие N-ацетилглюкозамин в положении 263 остатка серина.

Obtained results and novelty (in Kazakh) : Рекомбинантты ақуыздарды талдау нәтижелері бойынша әртүрлі режимдерде тандемді хромато-масса спектрометриясын қолдана отырып, келесі мәліметтер алынды. Mascot іздеу жүйесінің көмегімен Sox2 ақуызы жоғары скор (Score; 2030) және сиквенс жабыны (sequence coverage: 39%) сәйкестендірілді. MS/MS спектрлері негізінде Sox2 ақуызының активтендіру доменіне кіретін пептидтің 6 өзгертілген түрі анықталды. Анықталған фосфорланған және гликозилденген формалардың ішінде 263 серин қалдығы күйінде N-ацетилглюкозамин бар екі жаңа модификацияланған форма табылды.

The main constructive and technical economic indicators (in Russian) : Установлено, что наиболее подходящим набором для выделения биотинилированных фракций рекомбинантных белков BAP-Sox2, BAP-Oct4 и BAP-Nanog из лизатов ядер клеток HEK293T и CHO является набор Dynabeads MyOne Streptavidin (ThermoFisher Scientific), который в два раза эффективнее другого набора BD IMag. Наиболее оптимальным буферным раствором для выделения всех биотинилированных и небиотинилированных фракций рекомбинантных белков является 6М раствор гуанидина гидрохлорида в PAT буферном растворе.

The main constructive and technical economic indicators (in Kazakh) : BAP-Sox2, BAP-Oct4 және BAP-Nanog рекомбинантты ақуыздарының биотинилденген фракцияларын HEK293T және CHO жасуша ядросының лизаттарынан оқшаулау үшін Dynabeads MyOne Streptavidin (ThermoFisher Scientific) ең қолайлы жиынтық болып анықталды. Бұл жиынтық басқа BD IMag жиынтығынан салыстырғанда екі есе тиімді жиынтығы болып табылды. Рекомбинантты ақуыздардың барлық биотинилденген және биотинилденбеген фракцияларын оқшаулау үшін ең оңтайлы буферлік ерітінді - PAT буферлік ерітіндісіндегі 6М гуанидин гидрохлоридінің ерітіндісі болып анықталды.

Level of implementation (in Russian) :

Level of implementation (in Kazakh) :

Efficiency (in Russian) :

Efficiency (in Kazakh) :

Field of application (in Russian) : Область применения: Результаты этой работы будут иметь непосредственное применение в разработке клеточных препаратов в персонализированной медицине.

Field of application (in Kazakh) : Қолдану саласы: Бұл жұмыстың нәтижелері жеке медицинада жасушалық препараттарды әзірлеуде тікелей қолданылады.