Inventory number IRN Number of state registration
0321РК00373 AP09259730-KC-21 0121РК00178
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Краткие сведения Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 0
International publications: 1 Publications Web of science: 0 Publications Scopus: 0
Patents Amount of funding Code of the program
0 18528986.3 AP09259730
Name of work
Изучение кишечного микробиома и микробиома ротовой полости у пациентов, страдающих болезнью Альцгеймера
Type of work Source of funding Report authors
Fundamental Аскарова Шолпан Несипбаевна
0
0
2
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) Нет
Full name of the service recipient
Частное учреждение "National Laboratory Astana"
Abbreviated name of the service recipient National Laboratory Astana
Abstract

Объектами исследования являются люди с диагнозом болезнь Альцгеймера в соответствии с рекомендациями NINCDS-ADRDA 2011 и их кишечный и ротовой микробиом.

Зерттеу субъектілері NINCDS-ADRDA 2011 нұсқауларына сәйкес Альцгеймер ауруы диагнозы қойылған адамдар және олардың ішек және ауыз қуысы микробиомасы.

Целью проекта является изучение состава и разнообразия микробиома кишечника и полости рта, выделенных у местных пациентов с диагнозом болезнь Альцгеймера, по сравнению со здоровыми пожилыми людьми с целью лучшего понимания патологии, поиска новых диагностических биомаркеров и стратегий профилактики на основе анализа микробиома.

Жобаның мақсаты - патологияны жақсырақ түсіну, жаңа диагностикалық биомаркерлерді іздеу және микробиомалық анализге негізделген алдын алу стратегияларын іздеу үшін жергілікті Альцгеймер ауруымен сырқаттанушылардан бөлінген ішек пен ауыз микробиомасының құрамын және әртүрлілігін зерттеу.

Рекрутинг участников на проект производился с участием врачей-неврологов стационарных и амбулаторных лечебно-профилактических учреждений г. Нур-Султан путем подбора тематических пациентов в специализированных отделениях городской больницы №1 (неврология и инсультный центр) по направлению врачей отделений, а также по направлению предварительно информированных врачей неврологов из городских поликлиник и медицинского центра психического здоровья г. Нур-Султан. Оценку когнитивных функций производили посредством краткой шкалы психоневрологического статуса (MMSE) и теста рисования часов (CDT). Выделение бактериальной ДНК производилось по протоколу QIAamp DNA stool Mini Kit (Qiagen, 51504). Подготовка образцов проводилась с использованием набора Nextflex 16s V1-V3 Amplicon-seq (BIOO Scientific, NOVA-4202-04). Ампликоны секвенировали на приборе MiSeq (Illumina). Библиотеку количественно оценивали на приборе Qubit 2.0 с использованием набора для анализа dsDNA BR Qubit (ThermoFisher, 32853). Библиотеки были проверены с использованием Agilent Bioanalyzer 2100 с использованием набора Agilent High Sensitivity DNA Kit (Agilent Technologies, 5067-4626). Анализ данных выполнен с использованием операционных скриптов таксономических единиц (LotuS). Таксономическое присвоение OTU выполнено с использованием баз данных SILVA (v138), greengenes (v13-5) и HITdb (v1.00).

Жобаға қатысушыларды іріктеу Нұр-Сұлтан қаласындағы стационарлық және амбулаторлық емдеу мекемелерінің невропатологтарының қатысуымен № № қалалық аурухананың мамандандырылған бөлімшелеріндегі тақырыптық науқастарды іріктеу арқылы қалалық емханалардың невропатологтары мен Нұр қаласындағы психикалық денсаулық медициналық орталығының қатысуымен өткізілді. -Сұлтан. Когнитивті функция нейропсихиатриялық күйдің қысқаша шкаласы (MMSE) және сағаттық сурет сынағы (CDT) арқылы бағаланды. Бактериялық ДНҚ оқшаулануы QIAamp DNA stool Mini Kit (Qiagen, 51504) протоколына сәйкес орындалды. Үлгіні дайындау Nextflex 16s V1-V3 Amplicon-seq жинағы (BIOO Scientific, NOVA-4202-04) арқылы орындалды. Ампликондар MiSeq құралында (Illumina) реттелген. Кітапхананың саны Qubit 2.0 құралында dsDNA BR Qubit талдау жинағы (ThermoFisher, 32853) арқылы анықталды. Кітапханалар Agilent Bioanalyzer 2100 көмегімен Agilent High Sensitivity DNA Kit (Agilent Technologies, 5067-4626) көмегімен тексерілді. Деректерді талдау таксономиялық бірліктердің операциялық сценарийлерінің (LotuS) көмегімен орындалды. OTU-лардың таксономиялық тағайындалуы SILVA (v138), greengenes (v13-5) және HITdb (v1.00) дерекқорлары арқылы орындалады.

В текущем году нами спроектирован алгоритм исследования и разработаны клинические анкеты, в исследование набраны 77 человек с диагнозом болезнь Альцгеймера, у которых оценен когнитивный и психоневрологический статус, собраны образцы биологического материала, проведен анализ демографических и клинических данных. Также произведена экстракция бактериальной ДНК из образцов стула, проведен количественный и качественный анализ выделенных образцов ДНК. Проведена пробоподготовка образцов с использованием набора Nextflex 16s V1-V3 Amplicon-seq KIT и секвенирование по 16s локусу. С целью определения отличительных черт кишечного микробиома при болезни Альцгеймера, мы проанализировали относительное количество таксонов фекальной микробиоты у пациентов с подтвержденным диагнозом. На уровне филума мы обнаружили низкую численность Bacteroidetes, Proteobacteria и Actinobacteria и относительно более высокую численность Firmicutes. На уровне рода определили относительное высокое количество Streptococcus, Akkermansia, Dorea, Bilophila, Collinsella, группа [Eubacterium] eligens, un_f__UCG-010, Butyrivibrio, группа [Eubacterium] ventriosum, Brucella, un_f__Clostridiaceae, un_f__f__Clostridiaceae, un_f__H__H_H__H__H

Осы жылы біз зерттеу алгоритмін құрдық және клиникалық сауалнамалар әзірледік, зерттеуге Альцгеймер ауруы диагнозы бар 77 адам тартылды, олардың когнитивтік және нейропсихиатриялық жағдайы бағаланды, биологиялық материал үлгілері жиналды, демографиялық және клиникалық деректер талданды. . Сондай-ақ, нәжіс үлгілерінен бактериялық ДНҚ алынды, оқшауланған ДНҚ үлгілеріне сандық және сапалық талдау жүргізілді. Үлгіні дайындау Nextflex 16s V1-V3 Amplicon-seq KIT көмегімен және 16s локусында реттілікпен орындалды. Альцгеймер ауруы кезіндегі ішек микробиомасының ерекше белгілерін анықтау үшін диагнозы расталған науқастарда нәжіс микробиотасының салыстырмалы көптігін талдадық. Филум деңгейінде біз Bacteroidetes, Proteobacteria және Actinobacteria аз мөлшерде және Firmicutes салыстырмалы түрде жоғарырақ көптігін таптық. Тұқым деңгейінде салыстырмалы түрде жоғары саны Streptococcus, Akkermansia, Dorea, Bilophila, Collinsella, [Eubacterium] eligens, un_f__UCG-010, Butyrivibrio, [Eubacterium] ventriosum, Brucella, un_f_Hlostfloscetlocetri, un_f_H_Clostfloscetlose_H_H_H_Clostflostlose_h_df_f__Clostfloscetlo_h_d.

В результате проведенных исследований, согласно календарному плану, все задачи были выполнены в полном объеме. Предварительные результаты анализа таксономической классификации выявила высокую индивидуальную вариабельность относительного количества микробов на уровне родов и филума. Сравнительный анализ полученных результатов будет проведен после набора контрольной группы

Жүргізілген зерттеу жұмыстарының нәтижесінде кестеге сәйкес барлық тапсырмалар толығымен орындалды. Таксономиялық классификацияны талдаудың алдын ала нәтижелері микробтардың салыстырмалы санында тектік және филум деңгейінде жоғары жеке өзгергіштігін анықтады. Алынған нәтижелердің салыстырмалы талдауы бақылау тобын қабылдағаннан кейін жүргізіледі.

биомедицина

биомедицина

UDC indices
577.017.22,576.53, 616-003.93
International classifier codes
76.03.43;
Key words in Russian
болезнь Альцгеймера; кишечный микробиом; оральный микробиом; микробиом; Нейродегенерация;
Key words in Kazakh
Альцгеймер ауруы; ішек микробиомы; ауыз микробиомы; микробиомы; Нейродегенерациясы;
Head of the organization Сарбасов Дос Журмаханбетович Dr.,Ph.D. Biochemistry and Molecular Biology / Professor
Head of work Аскарова Шолпан Несипбаевна PhD in Bioengineering, кандидат биологических наук / Professor