Inventory number IRN Number of state registration
0321РК00080 AP09259034-KC-21 0121РК00402
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Краткие сведения Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 1
International publications: 0 Publications Web of science: 0 Publications Scopus: 0
Patents Amount of funding Code of the program
0 18599913 AP09259034
Name of work
Изучение клинико-генетических аспектов раннего развития рака молочной железы на основе секвенирования нового поколения
Type of work Source of funding Report authors
Fundamental Жунусова Гульнур Сагиндыковна
0
0
1
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) МНВО РК
Full name of the service recipient
Республиканское государственное предприятия на праве хозяйственного ведения «Институт генетики и физиологии» Комитета науки Министерства образования и науки Республики Казахстан
Abbreviated name of the service recipient РГП на ПХВ ИГИФ КН МОН РК
Abstract

пациенты с раннем началом развитием рака молочной железы (до 40 лет) и контрольная группа (условно здоровые индивиды). Образцы биологического материала (венозная кровь и ДНК).

сүт безі қатерлі ісігінің ерте дамуы бар пациенттер (40 жасқа дейін) және бақылау тобы (шартты түрде сау адамдар). Биологиялық материалдың үлгілері (веноздық қан және ДНҚ).

Цель проекта (2021-2023 гг.): Комплексный анализ вклада генетических вариантов в патогенез и клиническую гетерогенность рака молочной железы в молодой казахской популяции и разработка рекомендаций по внедрению методов ранней молекулярно-генетической диагностики и скрининговых программ в Казахстане.

Жобаның мақсаты (2021-2023 жж.): Жас қазақ популяциясындағы сүт безі қатерлі ісігі патогенезі мен клиникалық гетерогенділігіне генетикалық нұсқалардың үлесін кешенді талдау және Қазақстанда ерте молекулярлық-генетикалық диагностика мен скринингтік бағдарламалар әдістерін енгізу бойынша ұсынымдар әзірлеу.

В работе применялись cоциологические, клинические, молекулярно-генетические, биоинформатические и статистические методы анализа.

Жұмыста социологиялық, клиникалық, молекулярлы-генетикалық, биоинформатикалық және статистикалық талдау әдістері қолданылды.

Был проведен сбор клинического материала у 320 человек, из них 224 больных с ранним началом развития рака молочной железы и 96 условно здоровых индивидов без отягощенного анамнеза по злокачественным новообразованиям. Клинико-морфологический анализ показал в большинстве случаев умеренную степень дифференцировки опухоли (64,73%). Наиболее часто встречающимся гистотипом была инвазивная протоковая карцинома (90,63%). Из собранного биоматериала была выделена геномная ДНК и подготовлены ДНК-библиотеки, содержащие последовательности 94 генов. Проведено таргетное секвенирование на платформе Miseq Illumina и биоинформационная обработка данных NGS-секвенирования. По результатам биоинформатического анализа обнаружено 38 патогенных и вероятно-патогенных мутаций у 57 пациенток (16,9%), большинство из них в генах BRCA1 и BRCA2, тогда как в других генах (не-BRCA), частота таких мутаций были почти в 2 раза меньше (8,48%). 6 вариантов не были ранее описаны и регистрируются как новые мутации, возможно, специфичные для казахской популяции.

320 адамнан клиникалық материал жиналды, оның ішінде 224-і сүт безі қатерлі ісігінің ерте дамуы басталған науқастар және 96-ы қатерлі ісіктер бойынша ауру анамнезсіз шартты сау адамдар. Клиникалық-морфологиялық талдау көп жағдайда ісік дифференциациясының орташа дәрежесін көрсетті (64,73%). Ең көп таралған гистотип инвазивті түтік карциномасы болды (90,63%). Жиналған биоматериалдан геномдық ДНҚ бөлініп, 94 ген тізбегі бар ДНҚ кітапханалары дайындалды. Miseq Illumina платформасында таргетті секвенирлеу және NGS-секвенирлеу деректерін биоақпараттық өңдеу жүргізілді. Биоинформатикалық талдау нәтижелері бойынша 57 пациентте 38 патогенді және ықтимал патогенді мутация табылды (16,9%), олардың көпшілігі BRCA1 және BRCA2 гендерінде, ал басқа гендерде (BRCA емес) мұндай мутациялардың жиілігі 2 есе аз болды (8,48%). 6 нұсқа бұрын қазақ популяциясына тән жаңа мутациялар ретінде сипатталмаған және тіркелмеген. 6 нұсқа бұрын сипатталмаған, сол себепті жаңа мутация ретінде тіркеледі және тек қазақ халқына тән болуы мүмкін.

Обнаружено 38 патогенных мутаций у 57 пациенток (16,9%).

57 пациентте 38 патогенді мутация табылды (16,9%).

онкология, маммология, генетика.

онкология, маммология, генетика.

UDC indices
577.2, 577.218, 575.224.22, 575.224.29
International classifier codes
34.15.23; 34.15.51;
Key words in Russian
Рак молочной железы; генетическая предрасположенность; патогенная мутация; однонуклеотидный полиморфизм; NGS-секвенирование;
Key words in Kazakh
Сүт безінің қатерлі ісігі; генетикалық бейімділік; патогендік мутация; бір нуклеотидті полиморфизм; NGS-секвенирлеу;
Head of the organization Джансугурова Лейла Булатовна Кандидат биологических наук (PhD) / Профессор (Full professor)
Head of work Жунусова Гульнур Сагиндыковна PhD в области биологических наук / Ассоциированный профессор