Inventory number | IRN | Number of state registration | ||
---|---|---|---|---|
0321РК00207 | AP09258813-KC-21 | 0121РК00154 | ||
Document type | Terms of distribution | Availability of implementation | ||
Краткие сведения | Gratis | Number of implementation: 0 Not implemented |
||
Publications | ||||
Native publications: 1 | ||||
International publications: 0 | Publications Web of science: 0 | Publications Scopus: 0 | ||
Patents | Amount of funding | Code of the program | ||
0 | 17441360 | AP09258813 | ||
Name of work | ||||
Мультиомный подход к изучению клеточного ответа Bacteroides fragilis на карбопенемы | ||||
Type of work | Source of funding | Report authors | ||
Fundamental | Жолдыбаева Елена Витальевна | |||
0
1
0
0
|
||||
Customer | МНВО РК | |||
Information on the executing organization | ||||
Short name of the ministry (establishment) | МНВО РК | |||
Full name of the service recipient | ||||
Товарищество с ограниченной ответственностью "Национальный центр биотехнологии" | ||||
Abbreviated name of the service recipient | ТОО "Национальный центр биотехнологии" | |||
Abstract | ||||
Объектом исследования являлся штамм B.fragilis BFR KZ01, который был выделен в 2018 г от пациента с диагнозом острый гангрезно-перфоративный аппендицит, перитонит. Зерттеу нысаны: B. fragilis FR KZ01 штаммы, ол 2018 жылы жедел гангрез-перфорациялық аппендицит, перитонит диагнозы бар пациенттен бөлінген. Цель работы -in vitro оценить транскрипционный и протеомный профиль Bacteroides fragilis при воздействии меропенема для изучения взаимосвязи бактериальных генов с механизмами резистентности и метобалическими путями, вовлеченных в ответ на действие меропенема. Жұмыстың мақсаты – Bacteroides fragilis транскрипциялық және протеомдық профилін меропенемнің әсеріне жауап ретінде қатысатын бактериялық гендердің төзімділік механизмдерімен және метобаликалық жолдармен байланысын зерттеу үшін бағалау. Методы исследования: микробиологические–культивирование, изучения антибиотикочувствительности; масс-спектрометрические – определение чистоты культур; молекулярно-генетические – выделение бактериального РНК и подготовка к последующему секвенированию. Зерттеу әдістері: микробиологиялық-өсіру, антибиотикке сезімталдықты зерттеу; масс-спектрометриялық-дақылдардың тазалығын анықтау; молекулалық-генетикалық – бактериалды РНҚ-ны оқшаулау және кейінгі секвенирлеуге дайындық. В результате исследований наработаны свежие культуры Bacteroides fragilis; определена субингибирующая концентрации (SIC) меропенема; получены субкультуры под действием антибиотика меропенема и при культивирование без него; выделены тотальные РНК, проводятся подготовка образцов РНК для этапа приготовления библиотек, а также начаты работы по пробоподготовке (синтез кДНК, пришивание поли А, лигирование, ПЦР-амплификация, измерение количества и нормализация библиотек). Зерттеу нәтижесінде жаңа Bacteroides fragilis дақылдары әзірленді; меропенемнің субингибирлеуші концентрациясы (SIC) анықталды; меропенем антибиотигінің әсерінен және онсыз өсіру кезінде субкультуралар алынды; жалпы РНҚ бөлінді, кітапханаларды дайындау кезеңі үшін РНҚ үлгілерін дайындау жүргізілуде, сондай-ақ сынама дайындау жұмыстары басталды (кДНҚ синтезі, поли А тігу, лигерлеу, ПТР-күшейту, кітапханалардың санын өлшеу және қалыпқа келтіру). данный проект решает фундаментальную задачу, поскольку изучение у В. fragilis транскрипционного ответа после воздействия субингибирующих концентраций меропенема способствует пониманию различных стратегий выживания бактерий в стрессовых условиях окружающей среды, то есть способствует более глубокому пониманию механизмов формирования резистентности у бактероидов. – бұл жоба негізгі мәселені шешеді, өйткені Bacteroides fragilis меропенемнің субингибирлеуші концентрациясының әсерінен кейін транскрипциялық реакцияны зерттеу бактериялардың қоршаған ортаның стресстік жағдайларында өмір сүруінің әртүрлі стратегияларын түсінуге көмектеседі, яғни бактероидтерде қарсылықтың қалыптасу механизмдерін тереңірек түсінуге көмектеседі.
фундаментальная наука. іргелі ғылым үшін. |
||||
UDC indices | ||||
579.61:615.281.9 | ||||
International classifier codes | ||||
34.15.00; 34.27.21; 34.27.29; | ||||
Key words in Russian | ||||
Bacteroides fragilis; масс-спектрометрия; меропенем; RNA-seq; экспрессия генов; | ||||
Key words in Kazakh | ||||
Bacteroides fragilis; масс-спектрометрия; меропенем; RNA-seq; гендердің экспрессиясы; | ||||
Head of the organization | Раманкулов Ерлан Мирхайдарович | Ph.D / профессор | ||
Head of work | Жолдыбаева Елена Витальевна | Кандидат биологических наук / ассоциированный профессор |