The object of research, development or design (in Russian) : Объектами исследования являлись образцы ДНК Neisseria meningitidis.

The object of research, development or design (in Kazakh) : Зерттеу нысандары Neisseria meningitidis ДНҚ үлгілері қолданылды.

Aim of work (in Russian) : Целью проекта является изучение генетического разнообразия штаммов Neisseria meningitidis и улучшение методологии эпидемиологического мониторинга за менингококковой инфекцией в Казахстане.

Aim of work (in Kazakh) : Жобаның мақсаты Neisseria meningitidis штаммдарының генетикалық алуантүрлілігін зерттеу және Қазақстанда менингококк инфекциясына эпидемиологиялық мониторинг әдістемесін жақсарту болып табылады.

Методы исследования (на русском) : Поставленные цели и вытекающие из нее задачи были выполнены с использованием молекулярно-генетических и информационных методов.

Методы исследования (на казахском) : Қойылған мақсаттар мен одан туындайтын міндеттер молекулалық-генетикалық және ақпараттық әдістерді қолдану арқылы орындалды.

Obtained results and novelty (in Russian) : В ходе выполнения НИР получены следующие результаты: подготовлены ДНК-библиотеки и проведено полногеномное секвенирование 41 штамма Neisseria meningitidis; в результате анализа качества секвенирования было получено от 236 140 до 2 904 570 прочтений и собранных контигов от 88 до 1140 на штамм; анализ полногеномных данных установил 10 MLST7-генотипов среди которых: 2 уникальных генотипа, ST-767 (CC ST-167), ST-2146 (CC 198), ST-3346 (CC41/44), ST-11 (CC ST-11), ST-11585, ST-3015, ST-5636 и ST-12790 (CC ST-4821); на основе SNP построены UPGMA и MST филогенетические деревья; разработаны методические рекомендаций генотипирования штаммов Neisseria meningitidis на основании полногеномных данных; проведен обучающий семинар для сотрудников РГП «Национальный центр экспертизы» МЗ РК (НЦЭ); подана 1 статья в рецензируемое научное издание; опубликованы полногеномные данные штаммов Neisseria meningitidis циркулирующих в Казахстане. Новизна результатов НИР: получены полногеномные данные и определены генетические особенности для 41 штаммов Neisseria meningitidis вызвавших локальные вспышки в Казахстане на протяжении 2017-2018 годов.

Obtained results and novelty (in Kazakh) : ҒЗЖ орындау барысында келесі нәтижелер алынды: ДНҚ-кітапханалар дайындалды және Neisseria meningitidis 41 штаммының толық геномдық секвенирленуі жүргізілді; секвенирлеу сапасын талдау нәтижесінде 236 140-тан 2 904 570-ке дейін оқулар және штаммға 88-ден 1140-қа дейін жиналған контигтер алынды; толық геномдық деректерді талдау 10 MLST7-генотиптерді белгіледі, олардың ішінде: 2 бірегей генотип, ST-767 (CC ST-167), ST-2146 (CC 198), ST-3346 (CC41/44), ST-11 (CC ST-11), ST-11585, ST-3015, ST-5636 және ST-12790 (CC ST-4821); SNP негізінде UPGMA және MST филогенетикалық ағаштары құрастырылды; толық геномдық деректер негізінде Neisseria meningitidis штаммдарын генотиптеудің әдістемелік ұсынымдары әзірленді; ҚР ДСМ "Ұлттық сараптама орталығы" РМК (ҰСО) қызметкерлері үшін оқыту семинары өткізілді; рецензияланатын ғылыми басылымға 1 мақала берілді; Қазақстанда айналымдағы Neisseria meningitidis штаммдарының толық геномдық деректері жарияланды. ҒЗЖ нәтижелерінің жаңалығы: 2017-2018 жылдар ішінде Қазақстанда аурудың жергілікті тарауы туындатқан Neisseria meningitidis 41 штаммы үшін толық геномдық деректер алынды және генетикалық ерекшеліктер айқындалды.

The main constructive and technical economic indicators (in Russian) : Проведено полногеномное секвенирование и анализ полногеномных данных 41 штаммов Neisseria meningitidis; опубликованы методические рекомендации для генотипирования штаммов Neisseria meningitidis на основании полногеномных данных.

The main constructive and technical economic indicators (in Kazakh) : Neisseria meningitidis 41 штаммының толық геномдық секвенирленуі және талдауы жүргізілді; толық геномдық деректер негізінде Neisseria meningitidis штаммдарын генотиптеудің әдістемелік ұсынымдары әзірленді.

Level of implementation (in Russian) :

Level of implementation (in Kazakh) :

Efficiency (in Russian) :

Efficiency (in Kazakh) :

Field of application (in Russian) : лабораторная диагностика, эпидемиология.

Field of application (in Kazakh) : зертханалық диагностика, эпидемиология.