Inventory number IRN Number of state registration
0221РК00262 AP09563474-OT-21 0121РК00577
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Заключительный Gratis Number of implementation: 1
Implemented
Publications
Native publications: 0
International publications: 2 Publications Web of science: 2 Publications Scopus: 2
Number of books Appendicies Sources
1 5 49
Total number of pages Patents Illustrations
105 0 12
Amount of funding Code of the program Table
7994524.3 AP09563474 6
Name of work
Оценка применения кардиогенетической панели генов для секвенирования следующего поколения в молекулярной аутопсии при внезапной сердечной смерти
Report title
Type of work Source of funding The product offerred for implementation
Fundamental Метод, способ
Report authors
Акильжанова Айнур Рахметуловна , Рахимова Сауле Есламовна , Жалбинова Мадина Руслановна , Жакупова Толкын Зейнакабиденовна , Оспанова Кульжами Есимхановна , Полякова Татьяна , Чамойева Аяулым ,
0
1
1
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) Нет
Full name of the service recipient
Частное учреждение "National Laboratory Astana"
Abbreviated name of the service recipient National Laboratory Astana
Abstract

Лица, умершие от внезапной ненасильственной смерти в возрасте от 18 до 44 лет, геномная ДНК.

18-44 жас аралығында кенеттен зорлықсыз өлімнен қайтыс болған адамдар, геномдық ДНҚ.

Оценить диагностическую ценность секвенирования нового поколения с использованием разработанной нами кардиогенетической панели в молекулярной аутопсии при внезапной ненасильственной смерти.

Кенет зорлықсыз жүрек өліміне қатысты молекулалық аутопсияда кардиогенетикалық панельдің көмегімен жаңа секвенирлеу технологиясының диагностикалық мәнін бағалау.

Судебно-медицинская экспертиза, подготовка ДНК библиотек на основе технологии HaloPlex, секвенирование NGS, биоинформатический анализ, секвенирование по Сэнгеру.

Сот-медициналық сараптама, HaloPlex технологиясына негізделген ДНҚ кітапханаларын дайындау, NGS секвенирлеу, биоинформатикалық талдау, Сангерлік секвенирлеу.

9 рекрутированным умершим от ВСС молодым лицам было проведено полное судебно-медицинское исследование, молекулярная аутопсия - таргетное секвенирование всех экзонных участков и экзон-интронных соединений 96 генов-кандидатов, ассоциированных с развитием наследственных сердечных синдромов, кардиомиопатий, нарушений ритма сердца с использованием разработанной панели генов и NGS. Выявлены генетические варианты с вероятными патогенными функциональными эффектами в 63% и 35% случаев ВСС с недиагностическими и диагностическими сердечными аномалиями, соответственно, показывая высокую диагностическую ценность генетического скрининга с помощью панели генов для таргетного NGS. У лиц с ВСС с ишемическими изменениями в сердце посмертно наиболее частые мутации выявлены в генах TTN, MYBPC3, LAMA2, MYH6 и GAA. У лиц с недиагностическими структурными аномалиями сердца, выявлены патогенные варианты в генах ионных каналов. Валидация выявленных генетических вариантов с методом прямого секвенирования по Сэнгеру подтвердила точность, аккуратность таргетного секвенирования с помощью разработанной нами панели генов. Молекулярная аутопсия впервые проведена и внедрена в Казахстане. Опубликовано 2 публикации в международных журналах с импакт фактором и имеющим по базам данных Web of Science and Clarivate analytics Q1, Scopus процентиль не менее 35, 4 тезиса, два выступления с докладами на международных конференциях. Подана статья в международный журнал.

КЖӨ-нен қайтыс болған 9 адам толық сот-медициналық зерттеуден өткізілді, молекулярлық аутопсия - барлық экзон аймақтарының және тұқым қуалайтын жүрек синдромы, кардиомиопатия, жүрек ырғағының бұзылуымен байланысты 96 кандидат гендердің экзон-интрондық түйісулерінің гендер панелі мен NGS қолдану арқылы таргетті секвенирлеу. Ықтимал патогендік функционалдық әсерлері бар генетикалық нұсқалардың диагностикалық емес және диагностикалық жүрек ақаулары бар КЖӨ жағдайлары 63% және 35% деп сәйкесінше анықталды. Бұл гендік панель пайдаланылған NGS секвенирлеу үшін генетикалық скринингтің жоғары диагностикалық мәнін көрсетті. Өлімнен кейінгі жүрегінде ишемиялық өзгерістері бар КЖӨ адамдарында ең жиі кездесетін мутациялар TTN, MYBPC3, LAMA2, MYH6 және GAA гендерінде анықталды. Ал жүректің диагностикалық емес құрылымдық аномалиялары бар адамдарда иондық каналдармен байланысты гендерде патогендік нұсқалар анықталды. Анықталған генетикалық варианттарды Сэнгер секвенирлеу әдісімен тексеру біз дайындаған гендер панелінің таргетті секвенирлеу дәлдігін растады. Қазақстанда молекулалық аутопсия алғашқы рет жасалған, еңгізілген. Web of Science және Clarivate аналитикалық деректер базасында Q1 пайыздық көрсеткіші бар, Scopus-та пайыздық көрсеткіші кемінде 35, импакт-факторы бар халықаралық журналдарында 2 публикация жарияланып, 4 тезис және халықаралық конференцияларда 2 түрлі баяндама жасалды. Мақала халықаралық журналға берілді.

Нами была проведена апробация разработанной кардиогенетической панели в молекулярной аутопсии при внезапной ненасильственной смерти у молодых лиц, умерших от внезапной сердечной смерти, показавшая высокую диагностичекую ценность. Выявлены генетические варианты с вероятными патогенными функциональными эффектами в 63% и 35% случаев ВСС с недиагностическими и диагностическими сердечными аномалиями, соответственно, показывая высокую диагностическую ценность генетического скрининга с помощью панели генов для таргетного NGS.

Кенеттен жүрек өлімінен қайтыс болған жастардың кенеттен зорлық-зомбылықсыз өліміне молекулалық сараптау /молекулярлық аутопсияда жасалған кардиогенетикалық панельді сынадық, бұл жоғары диагностикалық мәнді көрсетті. Ықтимал патогендік функционалдық әсерлері бар генетикалық нұсқалар диагностикалық емес және диагностикалық жүрек ақаулары бар КЖӨ жағдайларының 63% және 35% сәйкес анықталды, бұл таргетті NGS үшін гендік панельді пайдалана отырып, генетикалық скринингтің жоғары диагностикалық мәнін көрсетті.

Был внедрен метод таргетного секвенирования следующего поколения (NGS) с использованием разработанной панели для целевого обогащения кодирующих последовательностей 96 генов-кандидатов при молекулярной аутопсии молодых людей, умерших от ВСС. Имеется акт внедрения.

Кенеттен жүрек өлімінен қайтыс болған жастарды молекулалық аутопсияда 96 кандидат гендер үшін кодтау реттілігін мақсатты түрде байыту үшін әзірленген панельді қолдану арқылы мақсатты келесі ұрпақ секвенирлеу (NGS) әдісі енгізілді. Іске асыру актісі бар.

Апробирована технология секвенирования следующего поколения с применением разработанной нами панели генов для таргетного обогащения кодирующих частей 96 генов в молекулярной аутопсии молодых лиц с ВСС, показавшая диагностичекую ценность.

Келесі ұрпақ секвенирлеу технологиясы диагностикалық құндылықты көрсеткен СКД бар жастарды молекулалық аутопсияда 96 геннің кодтау бөліктерін мақсатты түрде байыту үшін біз әзірлеген гендер панелінің көмегімен сынақтан өтті.

Генетика человека (кардиология), медицина, судебная медицина, применение технологий секвенирования в клинических исследованиях

Адам генетикасы (кардиология), медицина, сот медицинасы, клиникалық зерттеулерде секвенирлеу технологияларын қолдану.

UDC indices
616+577.21
International classifier codes
76.29.30;
Readiness of the development for implementation
Key words in Russian
внезапная смерть; молекулярная аутопсия; секвенирование следующего поколения; кардиогенетическая панель; мутация; биоинформатический анализ; внезапная сердечная смерть;
Key words in Kazakh
кенеттен өлімі; молекулалық аутопсия; келесі /жаңа буынды секвенирлеу; кардиогенетикалық панелі; мутация; биоинформатикалық талдау; кенеттен жүрек өлімі;
Head of the organization Сарбасов Дос Джурмаханбет Ph.D. Biochemistry and Molecular Biology / Professor
Head of work Акильжанова Айнур Рахметуловна Доктор медицинских наук (2012), PhD in Medical Sciences (Japan, 2014) / Профессор (2020, КОКСОН)
Native executive in charge