Inventory number IRN Number of state registration
0220РК01061 AP05131549-OT-20 0118РК00197
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Заключительный Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 1
International publications: 1 Publications Web of science: 0 Publications Scopus: 1
Number of books Appendicies Sources
1 5 28
Total number of pages Patents Illustrations
66 0 11
Amount of funding Code of the program Table
8000000 AP05131549 10
Name of work
Изучение вирома перелетных птиц как источников трансконтинентального переноса возбудителей инфекционных болезней человека и животных
Report title
Type of work Source of funding The product offerred for implementation
Applied Базы, банки данных
Report authors
Карамендин Кобей Омертаевич , Хан Елизавета Яковлевна ,
0
0
1
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) Нет
Full name of the service recipient
ТОО "Научно-производственный центр микробиологии и вирусологии"
Abbreviated name of the service recipient ТОО "Научно-производственный центр микробиологии и вирусологии"
Abstract

Объектом исследования являлись биологические образцы от диких птиц водного и околоводного комплексов, собранные в Республике Казахстан.

Зерттеу нысаны – Қазақстандағы су кешендерін мекендейтін жабайы құстардан алынған биологиялық сынамалар.

Цель проекта заключается в выявлении спектра вирусных популяций, циркулирующих среди диких птиц Казахстана, их молекулярно-генетических исследованиях и рекомендации протокола массового параллельного секвенирования.

Зерттеу мақсаты – Қазақстан жабайы құстар арасында айналымындағы вирустік популяцияларды анықтау, оларды молекулалық биология жағынан сипаттау және жаңа буын секвендеу протоколын ұсыну.

В работе использовали приборное и методическое обеспечение, предназначенное для вирусологических и молекулярно-биологических исследований.

Жұмыс барысында вирусологиялық және молекуло-биологиялық зерттеулерге арналған жабдықтар мен әдістемелер қолданылды

В местах весеннего и осеннего перелетов в 2018-2020 гг. собрано 337 проб от 231 птиц 21 вида для последующего скрининга. Выбраны оптимальные протоколы для секвенирования: для получения полного генома РНК вируса рекомендуется использовать набор NEBNext Ultra RNA Sequencing Kit (NEB, США), для исследования вирома рекомендуется протокол Sequence Independent Single Primer Amplification. Выявлена циркуляция в Казахстане ортоавулавирусов 1 и 16 и параавулавирусов 4 , а также вирусов гриппа подтипов Н10 и Н1 в составе виромов диких птиц, что подтверждает ключевую роль орнитофауны в поддержании орто- и паорамиксовирусов в биосфере. Определено, что виром Пластинчатоклювых содержит лентогенные ортоавулавирусы 1, в то время как виром бакланов содержит велогенные штаммы ортоавулавирусов 1 (ВБН). Пластинчатоклювые также явились переносчиком непатогенных вариантов вируса гриппа птиц H1N1 и H10N1. Выявлено, что виром Чайковых содержит новый смертельный аденовирус, который может вызвать массовые падежи. При исследовании вирома летучих мышей обнаружены аденовирусы и ретровирусы животных, а также вируса сходного с респираторно-синцитиальным вирусом человека.

Скрининг үшін 2018-2020 жж жабайы құстардың 21 түрінен 231 бастан 337 сынама жинады. 2019 ж. Секвендеу мақсатында тиімді протоколдар тағайындалды: толық геном секвендеу үшін NEBNext Ultra RNA Sequencing Kit (NEB, АҚШ) протоколы пайдаланды. Метагеном секвендеуге Sequence Independent Single Primer Amplification протоколы ұсынылды. Қазақстанда ортоавулавирустардың 1, 16 және 4 параавулавирустардың, сондай-ақ жабайы құстардың виромдарындағы H10 және H1 типтармақтары тұмау вирустарының айналымы туралы мәліметтерді көрсетті, бұл авифаунаның биосферадағы орто- және парамиксовирустарды сақтаудағы маңызды рөлін растайды. Anseriformes тектес виромында лентогендік ортоавулавирустар 1, ал суқұзғын мен шағалалар виромында ортававулавирустардың 1 велогендік штамдары бар екендігі анықталды. Anseriformes патогенді емес H1N1 және H10N1 құс тұмауының вирусын алып жүрді. Шағала тұқымдастарының (шағала мен қарқылдақ) виромында өлімге әкелетін жаңа аденовирус бар екендігі анықталды. Жарқанаттардың виромын зерттеу кезінде жануарлардың аденовирустары мен ретровирустарын, сонымен қатар адамның тыныс алу синцитиалды вирусына ұқсас вирус табуылуы қызықты.

Основные конструктивные и технико экономические показатели заключаются в повышении эффективности мониторинговых исследований авифауны и улучшении знаний об эпидемической ситуации и распространения вирусов в природе.

Негізгі конструктивті және техникалық-экономикалық көрсеткіштер авифауна мониторингтік зерттеулерінің тиімділігін арттыру және эпидемиялық ахуал және вирустардың табиғатта таралуы туралы білімді жетілдіру болып табылады.

Рекомендации по внедрению или итоги внедрения результатов НИР. Результаты исследований могут быть использованы практическими учреждениями ветеринарного контроля Республики Казахстан при расшифровке вспышек заболеваемости и контроле возникающих чрезвычайных эпидемических ситуаций.

Зерттеу нәтижелерін өндіріске енгізу немесе енгізу жөнінде ұсыныстар. Қазақстан малдәрігерлік бақылау қызметтері зерттеу нәтижелердің мақсатты тұтынушылар болып саналады өйткені алынған мәліметтер аурудың таралуын ажыратуға және төтенше індеттік жағдайлардың бақылауында пайдалануға болады

Область применения – вирусология, молекулярная биология, ветеринария.

Қолданылу саласы – вирусология, молекулалық биология, ветеринария.

UDC indices
578.832.1:578.4
International classifier codes
34.25.00; 34.25.21;
Readiness of the development for implementation
Key words in Russian
Вирус; Виром; Микробиом; Массовое параллельное секвенирование; Перелетная птица; Вид; Биоинформационный анализ; Геном; Казахстан;
Key words in Kazakh
Вирус; Виром; Микробиом; Жаппай бір-мезгілді секвендеу; Жыл құстар; Түр; Биоинформациялық талдау; Геном; Қазақстан;
Head of the organization Саданов Аманкелди Курбанович доктор биологических наук / профессор
Head of work Карамендин Кобей Омертаевич Кандидат ветеринарных наук / профессор
Native executive in charge Хан Елизавета Яковлевна Докторант Ветеринарной медицины