The object of research, development or design (in Russian) : Объектом исследования являлись необработанные данные высокоплотных микрочипов c профилями экспрессии различных типов опухолевых тканей, а также экспрессионные профили опухолевых тканей, полученных с помощью технологий секвенирования нового поколения

The object of research, development or design (in Kazakh) : Зерттеу объектілері ретінде жоғары тығыздықты микрочиптерден алынған әртүрлі ісік тіндердің экспрессия профильдердің және жаңа буынды секвенирлеу технологиялар көмегімен алынған ісің тіндердің экспрессиялық профильдердің өңделмеген мәліметтері қолданылды

Aim of work (in Russian) : Цель проекта заключается в изучении и деконволюции «мульти-омиксных» данных с высокопроизводительных геномных платформ с применением Метода Независимых Компонент для детального поиска и изучения скрытых биологических сигналов и сигнальных путей в онкозаболеваниях

Aim of work (in Kazakh) : Жобаның мақсаты – жоғары өнімді геномдық платформалардан (жоғары тығыздықты микрочиптер және жаңа буынды секвенирлеу) алынған ісік транскриптом мәліметтерге Тәуелсіз Компоненттер Әдісін қолдану арқылы толық талдау жасап, жасырын биологиялық сигналдарды және сингалды жолдарды іздеу және зерттеу

Методы исследования (на русском) : Методы матричной факторизации и методы биоинформатики

Методы исследования (на казахском) : Матрицалық факторизация әдістері және биоинформатика әдістері

Obtained results and novelty (in Russian) : Экспрессионные профили из тканей, для опухолевых наборов GSE32701, GSE21293, GSE26886, GSE69925, TCGA (BRCA, BLCA) были проанализированы биоинформатическими методами и с помощью МНК. Идентифицированы воспроизводимые сигнальные пути взаимодействия генов для различных опухолевых наборов. Реализована визуализация независимых компонент на молекулярных картах с помощью интерфейса BIODICA. Проведена интеграция BIODICA и NaviCell с целью проецирования мета-генов, полученных с помощью МНК, и их визуализации поверх молекулярных карт, представленных в формате NaviCell. Реализован стабилизированный МНК (sICA) в виде пакета Python и проведено сравнение с текущей реализацией в BIODICA. Получены результаты сравнительного анализа Python sICA в сравнении с BIODICA по профилю стабильности компонент.

Obtained results and novelty (in Kazakh) : GSE32701, GSE21293, GSE26886, GSE69925, TCGA (BRCA, BLCA) ісік жиынтықтарына арналған тіндердің экспрессиялық профильдері биоинформатикалық әдістермен және ТКӘ көмегімен талданды. Әр түрлі ісік жиынтықтары үшін гендердің өзара әрекеттесуінің репродуктивті сигналдық жолдары анықталды. BIODICA интерфейсін қолдана отырып, тәуелсіз компоненттерді молекулалық карталарда визуализациялау жүзеге асырылады. BIODICA және NaviCell интеграциясы ТКӘ көмегімен алынған мета-гендерді жобалау және оларды NaviCell форматында ұсынылған молекулалық карталардың үстіне бейнелеу мақсатында жүргізілді. Тұрақтандырылған ТКӘ (sICA) Python пакеті ретінде жүзеге асырылды және BIODICA -дағы ағымдағы іске асырумен салыстырылды. Компоненттің тұрақтылық профилі бойынша BIODICA -мен салыстырғанда Python sICA салыстырмалы талдауының нәтижелері алынды.

The main constructive and technical economic indicators (in Russian) : нет

The main constructive and technical economic indicators (in Kazakh) : жоқ

Level of implementation (in Russian) :

Level of implementation (in Kazakh) :

Efficiency (in Russian) :

Efficiency (in Kazakh) :

Field of application (in Russian) : биоинформатика, геномика, транскриптомика, биомедицина

Field of application (in Kazakh) : биоинформатика, геномика, транскриптомика, биомедицина