Inventory number IRN Number of state registration
0220РК00715 AP05131478-OT-20 0118РК00092
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Заключительный Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 3
International publications: 3 Publications Web of science: 3 Publications Scopus: 3
Number of books Appendicies Sources
0 3 52
Total number of pages Patents Illustrations
90 0 17
Amount of funding Code of the program Table
8000000 AP05131478 1
Name of work
«Изучение роли Поли-АДФ-рибоза полимераз Arabidopsis thaliana в ковалентной модификации концов разрывов в цепи ДНК in vitro и in vivo»
Report title
Type of work Source of funding The product offerred for implementation
Fundamental Другая (укажите)
Report authors
Тайпақова Сәбира Мықтыбекқызы , Бисенбаев Амангельды Куанбаевич , Смекенов Изат Темиргалиевич , Кольбаева Гулдарай Айтуреевна ,
0
0
0
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) МНВО РК
Full name of the service recipient
Дочернее государственное предприятие на праве хозяйственного ведения "Научно-исследовательский институт проблем биологии и биотехнологии" РГП на праве хозяйственного ведения "Казахский национальный университет им. Аль-Фараби"
Abbreviated name of the service recipient ДГП на ПХВ НИИ проблем биологии и биотехнологии КазНУ им аль-Фараби
Abstract

Объектом исследования являются рекомбинантные белки AtPARP1 и AtPARP2 Arabidopsis thaliana.

Зерттеу нысаны: Arabidopsis thaliana өсімдігінің рекомбинантты AtPARP1 және AtPARP2 ақуыздары.

Цель работы: Выделение и характеристика кДНК генов Поли-АДФ-рибоза полимераз Arabidopsis thaliana (PARP1, PARP2) и детальное изучение субстратной специфичности рекомбинантных ферментов. А также изучение роли Поли-АДФ-рибоза полимераз A. thaliana в ковалентной модификации разрывов цепей ДНК in vitro и in vivo.

Жобаның мақсаты Arabidopsis thaliana Поли-АДФ-рибоза полимеразаларының (PARP1, PARP2) кДНҚ гендерін бөліп алу және сипаттау, рекомбинантты ферменттердің субстраттық арнайылылығын зерттеу және де Поли-АДФ-рибоза полимеразаларының ДНҚ тізбегі үзілістерінің соңдарын ковалентті модификациялаудағы рөлін in vitro және in vivo жағдайында зерттеу болып табылады.

Методы исследования: Экспрессия белков; Выделение и клонирование генов кДНК; Аффинная хроматография; Анализ активности ферментов; MALDI-TOF масс-спектрометрия; Вестерн-блоттинг; Дот блоттинг.

Әдістемелер: Ферменттер экспрессиясы, кДНҚ гендерін оқшаулау және клондау; Ферменттердің белсенділігін талдау; Иммуноблотинг; Аффинндік хроматография; MALDI-TOF масс-спектрометрия; Вестерн-блоттинг; Дот блоттинг.

Результаты: Показано, что, растительные белки atPARP1 и atPARP2 как и их аналоги из млекопитающих АДФ-рибозилируют 5'-концевые фосфатные остатки в дуплексных олигонуклеотидах ДНК и плазмиде, содержащей по крайней мере два близко расположенных разрыва цепи ДНК. AtPARP1 предпочтительно катализирует ковалентное присоединение звеньев АДФ-рибозы к концам дуплексов ДНК с рецесстом, содержащих либо 3'-кордицепин, либо 5'-фосфат. Тогда как atPARP2 предпочтительно АДФ-рибозилирует дуплексы ДНК с ником и гэпом, содержащие концевой 5'-фосфат. PARP катализируемая ДНК АДФ-рибозилирование особенно чувствительно к расстоянию, которое разделяет разрывы двух цепей в одной и той же молекуле ДНК, 1,5 и 1 или 2 витка спирали для atPARP1 и atPARP2, соответственно. PAR гликогидролаза (PARG) восстанавливает нативную структуру ДНК путем гидролиза аддуктов PAR-ДНК, генерируемых atPARP. Биохимический и масс-спектрометрический анализ аддуктов PAR-ДНК показал, что atPARP используют фосфорилированные концы ДНК в качестве альтернативы белковым акцепторным остаткам для катализа синтеза цепи PAR через образование фосфодиэфирной связи между C1'АДФ-рибозы и фосфатным остатком концевого нуклеотида в фрагменте ДНК. Взятые вместе, эти данные устанавливают присутствие нового типа ДНК-модифицирующей активности в PARP арабидопсиса, предполагая возможную роль АДФ-рибозилирования ДНК в передаче сигналов повреждения ДНК и восстановлении наземных растений.

Алынғын нәтижелер: Өсімдіктер ақуыздары atPARP1 және atPARP2-де, олардың сүтқоректілердегі аналогтары сияқты, дуплексті ДНҚ олигонуклеотидтеріндегі және кем дегенде екі жақын орналасқан ДНҚ тізбегіның үзілісі бар плазмидада 5'-соңдық фосфат қалдықтарын AДФ-рибозильдейтіні көрсетілген. AtPARP1 жақсырақ ADP-рибоза бірліктерінің құрамында 3'-кордицепин немесе 5'-фосфаты бар рецестті ДНҚ дуплекстерінің ұштарына ковалентті қосылуын катализдейді. AtPARP2 өз кезегінде құрамында 5'-соңдық фосфаты бар ник пен гэпті ДНҚ дуплекстерін ADP-рибозильдейді. PARP-катализденген ДНҚ АДФ-рибозильденуі бір ДНҚ молекуласындағы екі тізбек үзілістерін бөлетін қашықтыққа ерекше сезімтал, сәйкесінше ол atPARP1 үшін 1,5 және atPARP2 үшін 1 немесе 2 спираль бұрылыстарын құрайды. PAR гликогидролаза (PARG) atPARP арқылы түзілген PAR-ДНҚ қосымшаларын гидролиздеу арқылы ДНҚ нативті құрылымын қалпына келтіреді. PAR-ДНҚ қосылыстарын биохимиялық және масс-спектрометриялық талдау көрсеткендей, atPARP фосфорланған ДНҚ ұштарын ақуыз акцепторының қалдықтарына балама ретінде C1'ADP-рибоза мен ДНҚ фрагментіндегі терминальды нуклеотидтің фосфат қалдығы арасындағы фосфодиэфир байланысы арқылы PAR тізбегінің синтезін катализдеу үшін қолданады. Бұл деректер Арабидопсистің PARP-ында ДНҚ-модификациялық белсенділіктің жаңа түрінің болуын анықтайды. Сонымен қатар, ДНҚ-ның зақымдануы туралы сигнал беруде және жердегі өсімдіктерде ДНҚ репарациясында АДФ-рибозильдеудің мүмкін рөлін көрсетеді.

нет

нет

Молекулярная биология и биотехнология

Молекулалық биология және биотехнология

UDC indices
577. 24; 577. 21; 575.
International classifier codes
34.15.00; 31.27.00; 34.15.27;
Readiness of the development for implementation
Key words in Russian
ПОЛИ(АДФ-РИБОЗА) ПОЛИМЕРАЗА; РЕПАРАЦИЯ ДНК РАСТЕНИЙ; ПОЛИ-АДФ-РИБОЗИЛИРОВАНИЕ; NAD+; РАЗРЫВЫ ЦЕПЕЙ ДНК; ARABIDOPSIS THALIANA;
Key words in Kazakh
ПОЛИ(АДФ-РИБОЗА) ПОЛИМЕРАЗА; ӨСІМДІК ДНҚ РЕПАРАЦИЯСЫ; ПОЛИ-АДФ-РИБОЗИЛДЕНУ; NAD+; ДНҚ ТІЗБЕКТЕРІНІҢ ҮЗІЛІСТЕРІ; ARABIDOPSIS THALIANA;
Head of the organization Бисенбаев Амангельды Куанбаевич д.б.н. / академик НАН РК
Head of work Тайпақова Сәбира Мықтыбекқызы Phd / ассоциированный профессор
Native executive in charge