Inventory number IRN Number of state registration
0220РК00523 AP05134722-OT-20 0118РК01054
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Заключительный Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 2
International publications: 3 Publications Web of science: 3 Publications Scopus: 3
Number of books Appendicies Sources
1 3 33
Total number of pages Patents Illustrations
64 0 5
Amount of funding Code of the program Table
6000000 AP05134722 2
Name of work
Изучение генетической экспрессии опухолевых тканей пищевода казахстанских пациентов на основе технологии секвенирования нового поколения.
Report title
Type of work Source of funding The product offerred for implementation
Fundamental Базы, банки данных
Report authors
Рахимова Сауле Есламовна , Кожамкулов Улан Анетович , Молкенов Асхат Балтабекович , Шәріп Айгүл , Маткаримов Бахыт Турганбаевич ,
0
2
3
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) Нет
Full name of the service recipient
Частное учреждение "National Laboratory Astana"
Abbreviated name of the service recipient National Laboratory Astana
Abstract

Образцы РНК, выделенной из опухолевой ткани пищевода на разных стадиях развития, и условно-нормальных тканей пищевода

Зерттеу нысаны зерттеуге қабылданған өңеш ісігі диагнозы бар науқастардан алынған (әртүрлі даму сатысындағы) өңештің ісік тіндерінен айырылған РНҚ үлгілері

Поиск потенциальных генетических биомаркеров для ранней диагностики плоскоклеточного рака пищевода на основе изучения генетической экспресии опухолевой ткани

Жұмыстың мақсаты ісік ұлпаларының генетикалық экспрессиясын зерттеу негізінде өңештің жалпақ жасушалы ісігін ерте диагностикалау үшін генетикалық биомаркерттерді іздестіру болып табылады

Комплекс современных молекулярно-биологических методов исследования, различные биоинформатические методы анализа

Жұмыста қазіргі заманауи молекулалық биологиялық зерттеу әдістерінің кешені, биоинформатиканы талдаудың әртүрлі әдістері қолданылады

проведен анализ дифференциальной экспрессии казахстанских пациентов с ПКРП, который выявил в общей сложности 2956 значимых ДЭГ (1672 гена с повышенной и 1284 гена с пониженной экспрессией). Анализ функционального обогащения этих генов показал, что большинство сигнальных путей иммунного ответа были сверхэкспессированы, что указывает на то, что они активированы в патогенезе ПКРП. Атлас ПКРП - это самая большая база данных, которая дает исчерпывающий обзор различных молекулярных изменений в ПКРП на основе опубликованных данных для разных популяций. Сравнительный анализ ДЭГ при ПКРП в разных популяциях был проведен путем сравнения данных из Атласа ПКРП с нашими транскриптомными данными и выявил новые общие гены и новые идеи для лучшего понимания патогенеза ПКРП.

Барлығы 2956 маңызды ДЭГ анықтаған өңеш карциномасы бар қазақстандық науқастардың дифференциалды экспрессиясын талдау (экспрессиясы төмен 1672 ген және экспрессиясы төмен 1284 ген). Осы гендердің функционалды байытуын талдау иммундық жауаптың сигналдық жолдарының көп бөлігі шамадан тыс әсер еткендігін көрсетті, бұл олардың өңеш карциномасының патогенезінде актив тенетіндігін көрсетеді. өңеш карциномасы атлас - бұл әр түрлі популяциялар үшін жарияланған мәліметтер негізінде өңеш карциномасынің әр түрлі молекулалық өзгерістерге толық шолу жасайтын ең үлкен мәліметтер базасы. Әр түрлі популяциялардағы өңеш карциномасының ДЭГ-ді салыстырмалы талдау өңеш карциноманы Атласындағы деректерді біздің транскриптомдық деректермен салыстыру арқылы жүргізілді және өңеш карциномасының патогенезін жақсы түсіну үшін жаңа кең таралған гендер мен жаңа идеяларды анықтады.

1) CXCL1 и RGS1 были общими для четырех популяций (кроме японских), а CKS2 был общим для всех популяций, кроме казахов среди высокоэкспрессированных генов 2) Для генов со сниженной экспрессией также было много общих для 3-4 популяций. Было установлено, что ECM1 и PTK6 обычно подавляются во всех исследованных популяциях, кроме японцев. В целом у казахов, китайцев и индийцев больше общих генов, чем у японцев и австралийцев. 3) Для каждой популяции были определены отдельные наборы генов, которые были уникальными только для этой популяции, возможно, эти гены дадут лучшее понимание популяционных характеристик болезни

1) Жоғары экспрессияланған гендер ішінде CXCL1 және RGS1 төрт популяцияға (жапондардан басқа) жалпы ортақ болды, ал CKS2 қазақтардан басқа барлық популяцияларға ортақ болды. 2) Экспрессиясы төмен гендер үшін 3-4 популяцияға арналған көптеген гендер болды. ECM1 және PTK6 әдетте жапондарды қоспағанда, зерттелген барлық популяцияларда басым екені анықталды. Жалпы, жапондықтар мен австралиялықтарға қарағанда, қазақтар, қытайлар мен үнділерде гендер көп кездеседі. 3) Әр популяция үшін, тек осы популяцияға ғана тән гендердің жеке жиынтығы анықталды, мүмкін бұл гендер аурудың популяциялық ерекшеліктерін жақсы түсінуге мүмкіндік береді.

молекулярная биология, медицина

молекулалық биология, медицина.

UDC indices
616-092.11-329-006.61; 577.21
International classifier codes
34.15.23; 76.29.49;
Readiness of the development for implementation
Key words in Russian
Рак пищевода; Плоскоклеточный рак; Транскриптом; Высокопроизводительное секвенирование; Высокопроизводительное секвенирование;
Key words in Kazakh
Өңеш ісігі; Жалпақ жасушалы ісік; Транскриптом; Жоғары өнімді секвенирлеу; Жоғары өнімді секвенирлеу;
Head of the organization Сарбасов Дос PhD / Профессор
Head of work Рахимова Сауле Есламовна кандидат биологических наук / ассоциированный профессор
Native executive in charge