Inventory number IRN Number of state registration
0220РК00608 AP05131106-OT-20 0118РК00165
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Заключительный Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 2
International publications: 3 Publications Web of science: 0 Publications Scopus: 3
Number of books Appendicies Sources
1 5 45
Total number of pages Patents Illustrations
81 0 17
Amount of funding Code of the program Table
8000000 AP05131106 7
Code of the program's task under which the job is done
Г. 2018
Name of work
Изучение биоразнообразия бактериофагов в экологически неблагополучных регионах Арало-Сырдарьинского бассейна
Report title
Type of work Source of funding The product offerred for implementation
Fundamental Методическая документация
Report authors
Алексюк Мадина Сапарбаевна , Богоявленский Андрей Павлинович , Молдаханов Ергали Сламидинович , Аканова Куралай Сайлауовна ,
0
0
0
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) Нет
Full name of the service recipient
ТОО "Научно-производственный центр микробиологии и вирусологии"
Abbreviated name of the service recipient ТОО "Научно-производственный центр микробиологии и вирусологии"
Abstract

водоёмы Арало – Сырдарьинского бассейна, геномная ДНК, вирусы.

Арал-Сырдария бассейнінің су қоймалары, геномдық ДНҚ, вирустар.

Изучить биоразнообразие бактериофагов в экологически неблагополучных регионах Арало-Сырдарьинского бассейна для оценки антропогенного влияния на водные экосистемы.

Су экожүйелеріне антропогендік әсерді бағалау үшін Арал-Сырдария бассейнінің экологиялық жағынан қолайсыз аудандарында бактериофагтардың биоәртүрлілігін зерттеу.

вирусологические, молекулярно-биологические, микробиологические

Вирусологиялық, молекулалы- биологиялық және микробиологиялық

Впервые было проведено изучение разнообразия вирома водоемов Арало - Сырдарьинского бассейна. Полученные результаты: был проведен анализ экологического состояния различных водоемов Арало-Сырдарьинского бассейна. Показано, что водные объекты региона относятся к трем группам степени загрязнения. Со всех трех групп водоемов собраны образцы. После ступенчатого концентрирования из исследуемых образцов были выделены нуклеиновые кислоты и подготовлены метагеномные библиотеки. Проведено секвенирования 6 метагеномных библиотек в результате которого было получено 12 баз данных, каждая из которых содержала от 1768633 до 2346461 ридов. В результате таксономической классификации, что количество вирусных последовательностей варьировало от 0,9% до 5,2%, Среди них было выявлено до 26 семейств дцДНК вирусов. Таксономический анализ оцДНК вирома выявил присутствие 8 семейств вирусов. Показано, что в водных образцах, кроме автохтонных вирусов типичных для гидроэкосистем, присутствуют бактериофаги микроорганизмов, вызывающих заболевания человека и животных. Была создана лабораторная коллекция из 6 штаммов бактериофагов лизирующих E. coli, база данных, объединяющих представителей 7 семейств вирусов. Составлены рекомендации по возможному использованию фагов для оценки состояния водных объектов. По результатам исследований опубликовано 13 работ, из которых 4 входят в международную базу данных.

Алғаш рет арал-Сырдария бассейініндегі су қоймаларындағы вирустардың алуан түрлілігіне зерттеу жүргізілді. Зерттеулер нәтижесінде келесі негізгі нәтижелер алынды. 2017-2018 жылдары жарияланған деректерді пайдалана отырып, Арал-Сырдария бассейніндегі әртүрлі су қоймаларының экологиялық жағдайына талдау жүргізілді. Аймақтың су объектілері ластану дәрежесінің үш тобына жататындығы көрсетілген. Су қоймаларының барлық үш тобынан үлгілер жиналды. Қадамдық концентрациядан кейін нуклеин қышқылдары зерттелетін үлгілерден бөлініп, метагеномдық кітапханалар дайындалды. 6 метагеномдық кітапхананы ретке келтіру жүргізілді, нәтижесінде 12 дерекқор алынды, олардың әрқайсысында 1768633-тен 2346461 ридке дейін болды. Алынған тізбектердің таксономиялық жіктелуі жүргізілді, нәтижесінде вирустық тізбектердің саны 0,9% - дан 5,2% - ға дейін өзгерді, олардың ішінде 26-ға дейін екі тізбекті ДНҚ вирустары анықталды. Бір тізбекті ДНҚ виромы таксономиялық талдауы вирустардың 8 тұқымдасының болуын анықтады. Су үлгілерінде гидроэкожүйелерге тән автохтонды вирустардан басқа, адамдар мен жануарлардың ауруларын тудыратын микроорганизмдердің бактериофагтары бар екендігі көрсетілген. E. coli лизисті бактериофагтардың 6 штаммынан тұратын зертханалық жинақ жасалды вирустардың нуклеотидтік тізбегінің мәліметтер базасы-8 тұқымдас. Су объектілерінің жай-күйін бағалау үшін фагтарды пайдалану бойынша ұсынымдар жасалды. Зерттеу нәтижелері бойынша 13 жұмыс жарияланды, олардың 4-і халықаралық деректер базасына кіреді.

Было изучено разнообразие бактериофагов в различных водоемах Арадо - Сырдарьинского бассейна, составлена база данных по фрагментам геномов, объединяющих представителей 7 семейств вирусов,создана лабораторная коллекция из 6 штаммов бактериофагов, лизирующих E. coli, выделенных из водоема Арадо - Сырдарьинского бассейна. Составлены рекомендации по возможному использованию фагов для оценки состояния водных объектов.

Арал-Сырдария бассейінінің әртүрлі су айдындарындағы бактериофагтардың әртүрлілігі зерттелді, вирустардың 7 тұқымдасының өкілдерін біріктіретін геномдардың фрагменттері бойынша мәліметтер базасы құрылды, Арал-Сырдария бассейінінің су қоймасынан оқшауланған E. coli лизирлеуші бактериофагтардың 6 штаммынан тұратын зертханалық жинақ жасалды. Су объектілерінің жай-күйін бағалау үшін фагтарды барынша пайдалану бойынша ұсыныстар жасалды.

связана с изучением биоразнообразия бактериофагов водных экосистемах Арало-Сырдарьинского бассейна, и возможным использованием бактериофагов в качестве новой системы биоиндикации экологического состояния водоёмов.

Арал-Сырдария бассейнінің су экожүйелеріндегі бактериофагтардың биологиялық әртүрлілігін және су объектілерінің экологиялық мәртебесіне жаңа биоиндикациялық жүйе ретінде бактериофагтарды пайдалану мүмкіндігімен байланысты.

UDC indices
574.5; 578.4
International classifier codes
34.25.00; 34.25.29;
Readiness of the development for implementation
Key words in Russian
Бактериофаги; Биоразнообразие; Арало-Сырдарьинский бассейн; Экосистема; Метагеномика; Массивное параллельное секвенирование;
Key words in Kazakh
Бактериофагтар; Биоәртүрлік; Арал-Сырдария бассейіні; Экожүйе; Метагеномика; Жаппай параллель секвендеу;
Head of the organization Саданов Аманкелди Курбанович Доктор биологических наук / профессор
Head of work Алексюк Мадина Сапарбаевна Доктор философии (PhD) в области экологии / нет
Native executive in charge Богоявленский Андрей Павлинович профессор