The object of research, development or design (in Russian) : Объектом исследования настоящего проекта является микробиом кожи, жаберных пластин и кишечника осётровых рыб, биофильтров УЗВ

The object of research, development or design (in Kazakh) : Осы жобаның зерттеу объектісі бекіре балықтарының терісінің, желбезек пластиналарының және ішектерінің, сонымен қатар ТСҚеҚ биофильтрларының микробиомалары болып табылады

Aim of work (in Russian) : Целью исследования является разработка методов анализа микробиома кожи, жаберных пластин и кишечника осётровых рыб, а так же микробиома биофильтров УЗВ с последующей оптимизацией процесса выращивания осетра на основании данных метагеномного анализа

Aim of work (in Kazakh) : Зерттеу мақсаты болып бекіре тұқымдас балықтардың тері, желбезек пластиналарын және ішектерін микробиомасын, сондай-ақ ТСҚеҚ биофильтрлерінің микробиомасын талдау әдістерін жасақтау, метагеномдық талдау деректері негізінде бекіре өсіру процесін оңтайландыру болып табылады

Методы исследования (на русском) : Методы исследования: анализ проводился с использованием ряда статистических и биоинформационных пакетов: cutadapt, а также dada2 и DECIPHER в программной среде R. Анализ биоразнообразия и представление таксономической структуры проводились при помощи программных пакетов QIIME и QIIME2. Выделение филотипов (таксонов), дифференциально представленных в сравниваемых сообществах проводилось в среде R при помощи пакета DESeq2.

Методы исследования (на казахском) : Қолданылған зерттеу әдістері: талдау cutadapt, сондай-ақ бағдарламалық ортадағы dada2 және DECIPHER R-дей бірқатар статистикалық және биоақпараттық пакеттерді қолдана отырып жүргізілді. Биологиялық әртүрлілікті талдау және таксономиялық құрылымды анықтау QIIME және QIIME2 бағдарламалық пакеттерін қолдану арқылы жүргізілді. Салыстырылатын қауымдастықтарда дифференциалды түрде ұсынылған филотиптерді (таксондарды) бөлу R ортасында DESeq2 пакетін қолданып жүргізілді.

Obtained results and novelty (in Russian) : За 2018-2020 годы в результате проведенных исследований: – за 2018 год: Составлена коллекция образцов микробиома осётра. Выделена бактериальная ДНК и проведено высокопроизводительное секвенирование гена 16sрРНК в полученной коллекции. Проведен предварительный анализ данных. – за 2019 год: Составлена коллекции образцов мкиробиома биофильтров установок УЗВ. Выделена бактериальная ДНК и проведено высокопроизводительное секвенирование гена 16sрРНК в полученной коллекции. – за 2020 год: Проведен анализ полученных результатов. Установлена корреляция между микробиомами биофильтров и осётра. Выявлены особенности структуры микробиома в разных фильтрах УЗВ. Составлены рекомендации по оптимизации условий выращивания осетровых в УЗВ.

Obtained results and novelty (in Kazakh) : 2018-2020 жылғы зерттеулер нәтижесінде: – 2018 жылы: Бекіре микробиомы үлгілерінің коллекциясы жасалды. Бактериалдық ДНҚ бөлінді және жасақталған коллекцияның 16ѕрРНҚ генінің жоғары өнімді секвенерлеу жүргізілді. Деректердің алдын ала талдануы жүргізілді; – 2019 жылы: ТСҚеҚ биофильтрлерінің микробиомы үлгілерінің коллекциясы жасалды. Бактериалдық ДНҚ бөлінді және жасақталған коллекцияның 16ѕрРНҚ генінің жоғары өнімді секвенерлеу жүргізілді; – 2020 жылы: Алынған нәтижелер талданды. Биофильтрлер мен бекіре тұқымдас балықтардың микробиомалары арасындағы корреляция орнатылды. ТСҚеҚ-ның түрлі фильтрлерінің микробиома құрылымының ерекшеліктері анықталды. ТСҚеҚ-да бекіре өсіру жағдайларын оңтайландыру бойынша ұсыныстар жасалды.

The main constructive and technical economic indicators (in Russian) : Метод, способ

The main constructive and technical economic indicators (in Kazakh) : Әдіс, тәсіл

Level of implementation (in Russian) : Разработанные технологии внедрены на базе Товарищества с ограниченной ответственностью «Учебно-научный комплекс опытно-промышленного производства аквакультуры», г. Уральск.

Level of implementation (in Kazakh) : Әзірленген технологиялар Орал қаласы «Аквакультура тәжірибелік-өнеркәсіптік өндірісінің оқу-ғылыми кешені» ЖСШ-нің базасына енгізілді.

Efficiency (in Russian) : Эффективность проводимых исследований заключается во внедрении методов метагеномики для оценки состояния микробиома УЗВ.

Efficiency (in Kazakh) : Жүргізілген зерттеулердің тиімділігі ТСҚеҚ микробиомасының жағдайын бағалау үшін метагеномика әдістерін енгізуден тұрады.

Field of application (in Russian) : Рыбное хозяйство

Field of application (in Kazakh) : Балық шаруашылығы