Inventory number IRN Number of state registration
0220РК00506 AP05131592-OT-20 0118РК00243
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Заключительный Gratis Number of implementation: 4
Implemented
Publications
Native publications: 3
International publications: 2 Publications Web of science: 0 Publications Scopus: 1
Number of books Appendicies Sources
1 7 51
Total number of pages Patents Illustrations
94 1 14
Amount of funding Code of the program Table
8000000 AP05131592 24
Code of the program's task under which the job is done
Г.2018, AP05131592
Name of work
Полногеномное исследование ассоциаций устойчивости к грибковым болезням сои в Казахстане
Report title
Type of work Source of funding The product offerred for implementation
Applied Коллекции
Report authors
Абугалиева Сауле Изтелеуовна , Туруспеков Ерлан Кенесбекович , Затыбеков Алибек Камзабекович , Дидоренко Светлана Владимировна , Әнуарбек Шынар Нұрланқызы , Досжанова Ботакоз Нурмаганбетовна ,
0
0
2
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) МНВО РК
Full name of the service recipient
Республиканское Государственное предприятие на праве хозяйственного ведения "Институт Биологии и биотехнологии растений"
Abbreviated name of the service recipient РГП на ПХВ «ИББР»
Abstract

Коллекция сои Glycine max (L.) Merrill., состоящая из 288 отечественных и зарубежных образцов.

288 отандық және шетелдік үлгілерден тұратын Glycine max (L.) Merrill. соя коллекциясы.

Идентификация и картирование локусов количественных признаков (QTL), связанных с устойчивостью к наиболее опасным грибным болезням сои на основе использования фенотипических данных, полногеномного генотипирования изучаемой коллекции и метода ассоциативного картирования генов.

Фенотиптік деректерді пайдалану, зерттелетін коллекцияны толық геномдық генотиптеу және гендерді ассоциативті карталау әдісі негізінде сояның аса қауіпті саңырауқұлақ ауруларына төзімділігімен байланысты сандық белгілер локустарын (QTL) анықтау және карталау.

Выделение и очистка ДНК, метод полимеразной цепной реакции, микросателлитный анализ, электрофорез в полиакриламидном геле, генотипирование с использованием новых геномных технологий, KASP, полногеномный анализ ассоциаций (GWAS), методы определения устойчивости зернобобовых культур к грибным болезням, структуры урожая. Статистическая обработка данных на основе корреляционного и кластерного анализа. В работе использованы статистические прикладные программы GraphPad Prism5, SPSS 22.0, GenAlEx 6.5.

ДНҚ бөлу және тазарту, полимеразды тізбекті реакция әдісі, микросателлитті талдау, полиакриламидті гель электрофорезі, жаңа геномдық технологияларды қолдана отырып генотиптеу, KASP, ассоциацияларды толық геномдық талдау (GWAS), дәнді-бұршақты дақылдардың саңырауқұлақ ауруларына төзімділігін анықтау әдістері, өнім құрылымы. Корреляциялық және кластерлік талдау негізінде деректерді статистикалық өңдеу. Жұмыста GraphPad Prism5, SPSS 22.0, GenAlEx 6.5 статистикалық қолданбалы бағдарламалары қолданылды.

Мировая коллекция сои (288 образцов) охарактеризована по устойчивости к церкоспорозу, фузариозу (корневая гниль), пурпурному церкоспорозу и септориозу. Проведен анализ 8 хозяйственно-ценных признаков. Выявлены наиболее перспективные сортообразцы. Скрининг центральной коллекции сои по 9 полиморфным микросателлитным маркерам, связанным с устойчивостью к грибным болезням, показал высокий уровень генетического разнообразия, о чем свидетельствуют средние показатели индекса Нея (0,54) и PIC (0,66). В результате GWAS идентифицированы и картированы 15 QTL, связанных с устойчивостью к церкоспорозу, септориозу и пурпурному церкоспорозу. Осуществлена конвертация идентифицированных высокозначимых 20 SNP-маркеров, ассоциированных с устойчивостью к грибным болезням и урожайностью, в экономически выгодные и удобные KASP-маркеры (патент на полезную модель, Приложение А). Создан и подготовлен для передачи на госсортоиспытания в ГКСИСК МСХ РК сорт сои Данелия (совместно с ТОО «Сельскохозяйственная опытная станция «Заречное»).

Сояның дүниежүзілік коллекциясы (288 үлгі) церкоспорозға, фузариозға (тамыршірік), қызылкүрең церкоспорозға және септориозға төзімділігімен сипатталды. 8 шаруашылық-құнды белгілерге талдау жүргізілді. Ең перспективалы сұрыптар анықталды. Саңырауқұлақ ауруларына төзімділікпен байланысты 9 полиморфты микросателлиттік маркерлер бойынша сояның орталық коллекциясының скринингі генетикалық алуантүрліліктің жоғары деңгейін көрсетті, мұны Ней (0,54) және PIC (0,66) индекстерінің орташа көрсеткіштері дәлелдейді. GWAS нәтижесінде церкоспорозға, септориозға және қызылкүрең церкоспорозға төзімділікпен байланысты 15 QTL анықталды және карталанды. Саңырауқұлақ ауруларына төзімділікпен және өнімділікпен байланысты анықталған жоғары мәнді 20 SNP-маркерлерді экономикалық жағынан тиімді және ыңғайлы KASP-маркерлерге айырбастау жүзеге асырылды (пайдалы модельге патент, Қосымша А). Данелия сорты ҚР АШМ «Ауыл шаруашылығы дақылдарының сортын сынау жөніндегі мемлекеттік комиссиясына» сорт сынағына беру үшін құрылды және дайындалды («Заречное» ауылшаруашылық тәжірибе станциясы ЖШС бірге).

Коллекция, состоящая из 288 образцов сои мировой и казахстанской селекции, охарактеризованная по устойчивости к болезням и продуктивности в условиях Алматинской области; 21 перспективных сортообразцов сои; 9 информативных полиморфных SSR маркеров, связанных с устойчивостью к церкоспорозу, фузариозу, пурпурному церкоспорозу. 15 QTL, ассоциированных с устойчивостью к церкоспорозу, септориозу и пурпурному церкоспорозу

Алматы облысы жағдайында ауруларға төзімділігі мен өнімділігі бойынша сипатталған әлемдік және қазақстандық селекциядағы сояның 288 үлгісінен тұратын коллекция; сояның 21 перспективалық сұрыптық үлгілері; церкоспорозға, фузариозға, қызылкүрең церкоспорозға төзімділікпен байланысты 9 информативті полиморфты SSR маркерлер. Церкоспорозға, септориозға және қызылкүрең церкоспорозға төзімділікпен байланысты15 QTL

Информативные SSR- и KASP-маркеры, а также выделенные образцы сои могут быть успешно использованы в селекционных программах, направленных на повышение продуктивности и устойчивости сортов сои к грибным болезням.

Ақпараттық SSR - және KASP-маркерлер, сондай-ақ сояның арнайы үлгілері соя сорттарының өнімділігін және саңырауқұлақ ауруларына төзімділігін арттыруға бағытталған селекциялық бағдарламаларда сәтті пайдаланылуы мүмкін.

Генетика, биотехнология и селекция зернобобовых культур.

Генетика, биотехнология, дәнді-бұршақты дақылдар селекциясы.

UDC indices
581.1:577.21: 631.527: 635.655
International classifier codes
34.23.37; 34.15.23; 68.37.31; 68.35.31; 68.35.03;
Readiness of the development for implementation
Key words in Russian
Соя; грибковые болезни; геномика; картирование QTL; компоненты урожайности; KASP маркеры;
Key words in Kazakh
Соя; саңырауқұлақ аурулары; геномика; QTL карталау; өнімділік компоненттері; KASP маркерлері;
Head of the organization Жамбакин Кабыл Жапарович Доктор биологических наук / Академик Национальной Академии Наук Республики Казахстан
Head of work Абугалиева Сауле Изтелеуовна Доктор биологических наук / профессор
Native executive in charge Туруспеков Ерлан Кенесбекович профессор