The object of research, development or design (in Russian) : Образцы ДНК B. anthracis и F. tularensis.

The object of research, development or design (in Kazakh) : B.anthracis және F.tularensis ДНҚ сынамалары алынды.

Aim of work (in Russian) : Изучить генотипы и геномные особенности возбудителей сибирской язвы и туляремии, циркулирующих в Казахстане с использованием высоко дискриминационных методов и полногеномного секвенирования, составить карту распределения генотипов для усовершенствования эпиднадзора за особо опасными инфекциями.

Aim of work (in Kazakh) : Толықгеномды секвенерлеу және жоғарғы кемсітушілік әдістерін қолдана отырып, Қазақстанда айналымда жүрген сібір жарасы мен туляремия қоздырғыштарының генотипімен геномды ерекшеліктерін зерттеу, аса қауіпті инфекцияларға эпидемиялогиялық бақыладуды жақсарту үшін генотиптердің таралу картасын құру.

Методы исследования (на русском) : Поставленные цели и вытекающие из нее задачи были выполнены с использованием молекулярно-генетических и информационных методов.

Методы исследования (на казахском) : Алға қойылған мақсат пен одан туындаған міндеттер молекулалы - генетикалық және ақпараттық әдістерді қолдану арқылы жүзеге асырылды.

Obtained results and novelty (in Russian) : В результате проведенных исследований: создана коллекция образцов ДНК, выделенных из 162 штаммов Bacillus anthracis, проведено MLVA типирование 155 штаммов Bacillus anthracis по 31 VNTR маркеру. Проведен анализ результатов MLVA генотипирования штаммов Bacillus anthracis. В результате определено генетическое разнообразие, проведен кластерный анализ, построено минимальное островное дерево и определено географическое распределение генотипов Bacillus anthracis в Казахстане. Отобраны 75 штамма Bacillus anthracis из разных кластеров и проведено их полногеномное секвенирование. Проведен посев на селективные питательные среды 50 коллекционных штаммов Francisella tularensis. Создана коллекция ДНК из 50 штаммов Francisella tularensis пригодных для полногеномного секвенирования. Проведен анализ результатов полногеномного секвенирования 75 штаммов Bacillus anthracis. Опубликованы методические рекомендации по генотипированию возбудителей сибирской язвы и туляремии. Проведен анализ результатов полногеномного секвенирования 50 штаммов Francisella tularensis. Депонированы бактериальные штаммы выделенные в ходе выполнения проекта. Новизна результатов: изучено генетическое разнообразие 155 штаммов B. anthracis методом MLVA-31, получены полногеномные данные и определены генетические особенности для 75 штаммов B. anthracis. Проведено полногеномное секвенирование и установлены генетические особенности 50 штаммов Francisella tularensis.

Obtained results and novelty (in Kazakh) : Жүргізілген зерттеулер нәтижесінде: Bacillus anthracis-тің 162 штаммынан бөліп алынған ДНҚ-ның коллекциясы құрылды, 31 VNTR маркер бойынша Bacillus anthracis-тің 155 штаммына MLVA типтеу жүргізілді. Bacillus anthracis штамдарын MLVA типтеу нәтижелеріне талдау жүргізілді. Нәтижесінде генетикалық әртүрлілік анықталды, кластерлік талдау жүргізілді, минималды аралдық ағаш салынды және Bacillus anthracis генотиптерінің Қазақстандағы географиялық таралуы анықталды. Әртүрлі кластерлерден Bacillus anthracis 75 штамдары іріктеліп алынды және оларға толық геномдық секвенирленуі жүргізілді. Селективті қоректік орталарға Francisella tularensis-тің 50 коллекциялық штаммы егілді. Francisella tularensis-тің 50 штаммынан толықгеномды секвенерлеуге жарамды ДНҚ коллециясы құрылды. Bacillus anthracis-тің 75 штаммының толықгеномды секвенерлеу нәтижесіне талдау жүргізілді. Сібір жарасы және туляремия қоздырғыштарын генотипирлеу бойынша әдістемелік нұсқаулық жарияланды. Francisella tularensis-тің 50 штаммының толықгеномды секвенерлеу нәтижесіне талдау жүргізілді. Жобаны орындау барысында бөліп алынған бактериалды штаммдар депозитке берілді. Нәтижелердің жаңашылдығы: MLVA-31 әдісімен B. anthracis-тің 155 штаммының генетикалық әралуандылығы зерттелді, B. anthracis-тің 75 штаммы үшін толықгеномды мәліметтер алынды және генетикалық ерекшеліектері анықталды. Francisella tularensis-тің 50 штаммына толықгеномды секвенерлеу жүргізіліп, олардың генетикалық ерекшеліктері анықталды.

The main constructive and technical economic indicators (in Russian) : Реализация проекта позволит внедрить в эпидемиологический мониторинг современные средства молекулярно-генетической типизации штаммов Bacillus anthracis и Francisella tularensis.

The main constructive and technical economic indicators (in Kazakh) : Жобаны жүзеге асыру эпидемиологиялық бақылауға Bacillus anthracis және Francisella tularensis штаммдарын молекулярлы-генетикалық типтеудің замануи құралдарын енгізуге мүмкіндік береді.

Level of implementation (in Russian) :

Level of implementation (in Kazakh) :

Efficiency (in Russian) :

Efficiency (in Kazakh) :

Field of application (in Russian) : Эпидемиология, контроль за особо опасными инфекциями.

Field of application (in Kazakh) : Эпидемиология, аса қауіпті жұқпалы ауруларды бақылау.