Inventory number IRN Number of state registration
0220РК00079 AP05130607-OT-20 0118РК00910
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Заключительный Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 0
International publications: 0 Publications Web of science: 0 Publications Scopus: 0
Number of books Appendicies Sources
1 3 66
Total number of pages Patents Illustrations
50 0 7
Amount of funding Code of the program Table
8688989 AP05130607 3
Name of work
Картирование белок-белковых взаимодействий в репликативном комплексе вируса жёлтой лихорадки и идентификация неизвестной протеазы, участвующей в процессинге белков флавивирусов
Report title
Type of work Source of funding The product offerred for implementation
Fundamental Препараты
Report authors
Шустов Александр Вячеславович , Кеер Виктория Владимировна , Сыздыкова Лаура Ризабековна ,
0
0
0
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) МНВО РК
Full name of the service recipient
Товарищество с ограниченной ответственностью "Национальный центр биотехнологии"
Abbreviated name of the service recipient ТОО "Национальный центр биотехнологии"
Abstract

Объекты исследования: геном вируса жёлтой лихорадки, ген GFP, плазмиды E.coli.

Зерттеу нысандары: сары безгегі вирусының геномы, GFP гені, E. coli плазмидтері.

Цель проекта: с помощью масс-спектрометрии идентифицировать белки, взаимодействующие с белками репликативного комплекса NS1 и NS2A вируса желтой лихорадки.

Жобаның мақсаты: масс-спектрометрияны қолдана отырып, сары безгегі вирусының NS1 және NS2A репликативті кешенінің ақуыздарымен әрекеттесетін ақуыздарды анықтау.

Использовали методы генетической инженерии и вирусологии.

Генетикалық инженерия және вирусология әдістері қолданылды.

В результате работ сконструированы генетически модифицированные геномы вируса желтой лихорадки (YFV) YFV/GFP–NS1 и YFV/GFP–NS2A. Создана система для оживления вирусов путём трансфекции инфекционных клонов. Компонент репликативного комплекса NS1 слит с зелёным флуоресцентным белком у вируса YFV/GFP–NS1, у вируса YFV/GFP–NS2A другой белок – NS2A - слит с GFP. Репликативные комплексы YFV выделены из инфицированных клеток с помощью хроматографии на сорбенте, несущем антитела против GFP. Проведено расщепление белков репликативного комплекса трипсином, триптические пептиды исследованы с помощью масс-спектрометрии и идентифицированы белки, совыделяющиеся вместе с GFP-NS1 и GFP-NS2A. Новизна результатов: впервые в Казахстане и в мире получены репортёрные вирусы из рода Flavivirus, у которых неструктурные белки NS1 и NS2 слиты с GFP. Аналогичные вирусы в мировой научной литературе по состоянию на октябрь 2020 г. не опубликованы. Впервые проведено масс-спектрометрическое исследование белков интерактома NS1 и NS2A для вируса YFV. Полученные результаты обладают патентоспособностью.

Жұмыс нәтижесінде сары безгегі вирусының (YFV) YFV/GFP–NS1 және YFV/GFP–NS2A генетикалық түрлендірілген геномдары құрастырылды. Инфекциялық клондарды трансфекциялау жолымен вирустарды жандандыруға арналған жүйе құрылды. NS1 репликативті кешенінің құрамдас бөлігі YFV/GFP-NS1 вирусында жасыл флуоресцентті ақуызбен, YFV/GFP-NS2A вирусында басқа ақуыз – NS2A – GFP-мен біріктіріледі. YFV репликативті кешендері жұқтырған жасушалардан GFP-ге қарсы антиденелер бар сорбенттегі хроматография арқылы оқшауланған. Репликативті кешеннің ақуыздары трипсинмен ыдыратылды, триптидті пептидтер масс-спектрометрия арқылы зерттелді және GFP-NS1 және GFP-NS2A-мен бірге бөлінетін ақуыздар анықталды. Нәтижелердің жаңалығы: Қазақстанда және әлемде алғаш рет NS1 және NS2 құрылымдық емес ақуыздары GFP-мен біріктірілген Flavivirus тектес репортерлік вирустар алынды. Әлемдік ғылыми әдебиеттерде ұқсас вирустар 2020 жылдың қазан айындағы жағдай бойынша жарияланған жоқ. Алғаш рет YFV вирусына арналған NS1 және NS2A интерактом ақуыздарын масс-спектрометриялық зерттеу жүргізілді. Алынған нәтижелер патенттілікке ие.

Основные конструктивные и технико–эксплуатационные показатели: высокая репликативная активность рекомбинантных вирусов.

Негізгі дизайн және техникалық және пайдалану көрсеткіштері: рекомбинантты вирустардың жоғары репликативті белсенділігі.

Степень внедрения: в процессе разработки. Проект является фундаментальным исследованием, внедрение в практику возможно в качестве модели репликации флавивирусов.

Іске асыру дәрежесі: даму процесінде. Жоба іргелі зерттеу болып табылады, флавивирустың репликациясының үлгісі ретінде практикаға енгізуге болады.

Эффективность разработки определяется репликативными характеристиками вирусов.

Даму тиімділігі вирустардың репликативті сипаттамасымен анықталады.

Область применения – молекулярная вирусология, поиск лекарств против инфекций, вызываемых флавивирусами, создание живых вирусных вакцин.

Қолдану саласы – молекулалық вирусология, флавивирустар тудыратын инфекцияларға қарсы дәрі-дәрмектерді іздеу, тірі вирустық вакциналар жасау.

UDC indices
578.233.444; 578.233.446
International classifier codes
34.15.31; 34.15.27;
Readiness of the development for implementation
Key words in Russian
РЕПЛИКАТИВНЫЙ КОМПЛЕКС; ВИРУС ЖЁЛТОЙ ЛИХОРАДКИ; ФЛАВИВИРУС; НЕСТРУКТУРНЫЙ БЕЛОК; МЕЧЕНИЕ;
Key words in Kazakh
РЕПЛИКАТИВТІК КОМПЛЕКС; САРЫ БЕЗГЕК ВИРУСЫ; ФЛАВИВИРУС; ҚҰРЫЛЫМСЫЗ АҚУЫЗ; ТАҢБАЛАУ;
Head of the organization Раманкулов Ерлан Мирхайдарович Phd / Профессор
Head of work Шустов Александр Вячеславович Кандидат биологических наук / нет
Native executive in charge