The object of research, development or design (in Russian) : Объектами исследования являлись геномы Amaranthus palmeri S.Wats., Sorghum bicolor, Vitis vinifera, Medicago truncatula, Saccharum hybrid, Panicum virgatum L., Solanum lycopersicum, Garcinia mangostana L., Silene latifolia Poir., Deschampsia antarctica E.Desv, Colobanthus quitensis (Kunth) Bartl., Colpodium Drakensbergense Hedberg and I.Hedberg, Zingeria biebersteiniana (Claus) P.A.Smirn., Oryza glaberrima Steud, Oryza minuta J. Presl.

The object of research, development or design (in Kazakh) : Зерттеу нысандары - Amaranthus palmeri S.Wats., Sorghum bicolor, Vitis vinifera, Medicago truncatula, Saccharum hybrid, Panicum virgatum L., Solanum lycopersicum, Garcinia mangostana L., Silene latifolia Poir., Deschampsia antarctica E.Desv, Colobanthus quitensis (Kunth) Bartl., Colpodium Drakensbergense Hedberg and I.Hedberg, Zingeria biebersteiniana (Claus) P.A.Smirn., Oryza glaberrima Steud, Oryza minuta J. Presl.

Aim of work (in Russian) : Цель работы – разработать методику детекции активных мобильных элементов, связанных с гетерозисом и стрессоустойчивостью; сформировать пул праймеров для метода детекции мобильных элементов; оптимизировать термоциклические профили для метода детекции на основе ПЦР.

Aim of work (in Kazakh) : Жоба мақсаты - гетерозиямен және стресске төзімділікпен байланысты белсенді қозғалмалы элементтерді анықтау әдісін әзірлеу; жылжымалы элементтерді анықтау әдісіне арналған праймерлер пулын қалыптастыру; ПТР негізінде анықтау әдісі үшін термоциклдік профильдерді оңтайландыру.

Методы исследования (на русском) : Методы исследования: молекулярная биология, биоинформатика.

Методы исследования (на казахском) : Зерттеу әдістері: молекулярлық биология, биоинформатика.

Obtained results and novelty (in Russian) : В результате исследования разработаны схемы двухэтапной ПЦР для детекции мобильных элементов и соответствующие протокола по ее выполнению. Были выполнены термодинамические расчеты и моделирование вторичных структур праймеров с использованием программного обеспечения собственной разработки. Оптимизирован дизайн «блуждающего» праймера для проведения первого этапа модифицированной ПЦР. Разработана нуклеотидная последовательность универсального праймера для проведения второго этапа модифицированной ПЦР. Была вычислена лингвистическая сложность (ЛС) соответствующих нуклеотидных последовательностей. Установлены номера критических циклов для переключения ПЦР из температурного режима, благоприятного для достижения высоких значений меры специфичности на режим, обеспечивающий собой достижение высоких значений меры чувствительности для обеспечения оптимального баланса между этими значениями в ходе реакции и снижения образования побочных продуктов по ее результату. Выявлены новые последовательности ретротранспозонов Cassandra. Обнаруженные консенсусные последовательности 17-и полных ретротранспозонов Cassandra были отправлены в базу данных NCBI (регистрационные номера EU140956, EU177767, EU867815, EU882730, FJ975775-FJ975780, HM481419, HM481420, KC686837-KC686839, KM262797 и MT230479). Область применения: биотехнология.

Obtained results and novelty (in Kazakh) : Зерттеу нәтижесінде жылжымалы элементтерді табудың екі сатылы ПТР схемалары және оны іске асырудың сәйкес хаттамалары жасалды. Термодинамикалық есептеулер және праймерлердің қайталама құрылымдарын модельдеу меншікті бағдарламалық жасақтама көмегімен жүзеге асырылды. Өзгертілген ПТР-дің бірінші кезеңіне арналған «кезбе» праймердің дизайнын оңтайландырды. Модификацияланған ПТР екінші кезеңіне арналған әмбебап праймердің нуклеотидтік дәйектілігі жасалды. Сәйкес нуклеотидтік тізбектердің лингвистикалық күрделілігі (ЛС) есептелді. ПТР-ді температура режимінен нақтылық өлшемінің жоғары мәндеріне қол жеткізуге қолайлы реакция кезінде осы шамалар арасындағы оңтайлы тепе-теңдікті қамтамасыз ету және оның нәтижесі бойынша қосалқы өнімдердің түзілуін азайту үшін сезімталдық өлшемінің жоғары мәндеріне жетуді қамтамасыз ететін режимге ауыстырудың критикалық циклдарының саны белгіленді. Cassandra ретротранспозондарының жаңа тізбектері анықталды. 17 толық Cassandra ретротранспозондарының консенсус дәйектілігі NCBI дерекқорына жіберілді (қосылу нөмірлері EU140956, EU177767, EU867815, EU882730, FJ975775-FJ975780, HM481419, HM481420, KC686837-KM304796839)

The main constructive and technical economic indicators (in Russian) : В качестве основного оборудования использовали спектрофотометр, бидистиллятор, ламинары, холодильники, термостаты, оборудование для ПЦР, центрифуги, сушильные шкафы, микроскопы, весы, автоклав, магнитные мешалки

The main constructive and technical economic indicators (in Kazakh) : Пайдаланылған негізгі жабдық спектрофотометр, қос дистиллятор, ламинар, тоңазытқыш, термостат, ПЦР үшін жабдықтар, центрифугалар, кептіру шкафтары, микроскоптар, таразы, автоклав, магниттік араластырғыштар, рН метрі, электрофорез камералары, гельді құжаттау жүйесі, компьютер.

Level of implementation (in Russian) :

Level of implementation (in Kazakh) :

Efficiency (in Russian) :

Efficiency (in Kazakh) :

Field of application (in Russian) : биотехнология

Field of application (in Kazakh) : биотехнология