Inventory number IRN Number of state registration
0325РК01264 AP23490126-KC-25 0124РК00585
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Краткие сведения Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 1
International publications: 1 Publications Web of science: 1 Publications Scopus: 1
Patents Amount of funding Code of the program
0 42999307.93 AP23490126
Name of work
Разработка и оптимизация элементов системы CRISPR/Cas9 для изучения механизмов засухоустойчивости картофеля
Type of work Source of funding Report authors
Fundamental Манабаева Шуга Аскаровна
0
0
1
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) МНВО РК
Full name of the service recipient
Товарищество с ограниченной ответственностью "Национальный центр биотехнологии"
Abbreviated name of the service recipient ТОО "Национальный центр биотехнологии"
Abstract

Объектом исследования являются отечественные сорта картофеля

Зерттеу нысаны - отандық картоп сорттары

Целью проекта является повышение эффективности технологии CRISPR/Cas9 путем оптимизации элементов системы, и методов доставки компонентов CRISPR/Cas9 в ядерный геном для изучения механизмов устойчивости к засухе картофеля.

Жобаның мақсаты - картоптың құрғақшылыққа төзімділігінің механизмдерін зерттеу үшін CRISPR/Cas9 компоненттерін ядролық геномға жеткізу әдістері мен жүйе элементтерін оңтайландыру арқылы CRISPR/Cas9 технологиясының тиімділігін арттыру.

Зерттеу әдістері - протопласттардың ПЭГ арқылы трансформациясы және Agrobacterium арқылы экспланттардың трансформациясы

Методами исследования являются ПЭГ-опосредованная трансформация протопластов и Agrobacterium-опосредованная трансформация эксплантов.

Жұмыста отандық картоп сорттарының ядролық геномына CRISPR/Cas9 компоненттерін жеткізудің кешенді жүйесі жасалып, оңтайландырылды. ПЭГ-опосредовандық протопласт трансформациясында 18 сағаттық ферментация 6,5 × 10⁶ кл/мл шығымдылық пен 90,8% тіршілікке қабілеттілікті қамтамасыз етті, кейін альгинат линзаларға инкапсуляцияланып, 2 апта ішінде микрокаллус түзілуін көрсетті. Agrobacterium арқылы трансформация pMR287 конструкциясының жоғары тиімділігін көрсетті (Аксор – 7,6%, Тохтар – 12,2%). Cas-OFFinder арқылы мақсатты сайттарды талдау офф-мақсаттардың жоқ екенін көрсетті. Фосфинотрицин бойынша кезеңдік селекцияның оңтайландырылуы тірі қалатын тұрақты клеткаларды алуға мүмкіндік беріп, OST2 және TRE гендерін редакциялаудың тиімділігін арттырды.

В работе разработана и оптимизирована комплексная система доставки CRISPR/Cas9 в ядерный геном отечественных сортов картофеля. ПЭГ-опосредованная трансформация протопластов с ферментацией 18 часов обеспечила выход 6,5 × 10⁶ кл/мл и жизнеспособность 90,8%, с последующей инкапсуляцией в альгинатные линзы и формированием микрокаллусов через 2 недели. Agrobacterium-опосредованная трансформация показала высокую эффективность конструкции pMR287 (Аксор 7,6%, Тохтар 12,2%). Анализ таргетов Cas-OFFinder подтвердил отсутствие офф-таргетов. Оптимизация ступенчатой селекции на фосфинотрицине позволила отбирать устойчивые клетки без потери жизнеспособности, что повышает эффективность редактирования генов OST2 и TRE.

В работе разработаны и оптимизированы методы доставки компонентов CRISPR/Cas9 в ядерный геном картофеля, результаты опубликованы в научных статьях. Конструктивные показатели включают выбор таргетных последовательностей без внецелевых сайтов, оптимизацию ферментации протопластов (6–18 ч) и условий ко-культивации с Agrobacterium (ацетосирингон 100 µM, OD600 0,3–0,6, 2 дня). Технико-экономические показатели демонстрируют высокую эффективность: жизнеспособность протопластов до 90,8%, формирование микрокаллусов через 2 недели, регенерация трансформированных эксплантов до 12,2%, оптимизация селекции с фосфинотрицином (3 мг/л) с сохранением жизнеспособности. Предложенные протоколы обеспечивают высокую продуктивность, воспроизводимость и минимизацию затрат на культивирование, трансформацию и отбор трансформированных растений, что делает их перспективными для создания генетически модифицированных отечественных сортов картофеля.

Картоп ядросына CRISPR/Cas9 жеткізу әдістері оңтайландырылды және ғылыми мақалаларда жарияланды. Протопласттарды 6–18 сағат ферментациялау өміршеңдікті 90,8%-ға дейін арттырды, микрокаллустар 2 аптада түзіледі. Agrobacterium-пен трансформацияда оптималды шарттар: ацетосирингон 100 µM, OD600 0,3–0,6, ко-культивация 2 күн. Трансформацияланған экспланттардың регенерациясы 12,2%-ға жетті. Ступенчатая селекциямен 3 мг/л фосфинотрицин қолдану өміршеңдікті сақтап, тұрақты каллус желілерін алуға мүмкіндік берді. Бұл протоколдар отандық картоп сорттарын тиімді генетикалық модификациялау мен экономикалық тұрғыдан үнемді әдістерді қамтамасыз етеді.

ПЭГ-опосредованная трансформация обеспечила получение протопластов с высокой жизнеспособностью (до 90,8%) и формирование микрокаллусов через 2 недели, пригодных для регенерации. Agrobacterium-опосредованная трансформация с конструкцией pMR287 дала регенеранты у сортов Аксор (7,6%) и Тохтар (12,2%). Оптимизация селекции с использованием поэтапного повышения концентрации фосфинотрицина (3–7 мг/л) позволила эффективно отбирать трансформированные клетки без потери жизнеспособности. Результаты подтверждают высокую эффективность выбранных методов доставки компонентов CRISPR/Cas9 и регенерации растений картофеля .

ПЭГ арқылы делдалдық трансформация протопласттардың жоғары өміршеңдігін қамтамасыз етіп, 2 апта ішінде микрокаллус қалыптасуына мүмкіндік берді. Agrobacterium арқылы трансформация pMR287 конструкциясымен Аксор сорты үшін 7,6%, Тохтар сорты үшін 12,2% регенеранттарды берді. Фосфинотрицин концентрациясын кезең-кезеңімен арттыру арқылы селекцияны оңтайландыру трансформацияланған жасушаларды өміршеңдігін жоғалтпай тиімді таңдауға мүмкіндік берді. Бұл нәтижелер CRISPR/Cas9 компоненттерін жеткізу мен картоп өсімдіктерін регенерациялаудың жоғары тиімділігін көрсетті.

биотехнология, генетическая инженерия растений, селекция картофеля

биотехнология, өсімдіктердің генетикалық инженериясы, картоп селекциясы,

UDC indices
577
International classifier codes
62.37.29;
Key words in Russian
Засухоустойчивость; Картофель; Редактирование; CRISPR/Сas9; Экспрессия;
Key words in Kazakh
Құрғақшылыққа төзімділік; Картоп; Өңдеу; CRISPR/Сas9; Экспрессия;
Head of the organization Абеев А.Б. Кандидат медицинских наук /
Head of work Манабаева Шуга Аскаровна Кандидат биологических наук / нет