Inventory number IRN Number of state registration
0325РК01019 AP22784368-KC-25 0124РК00033
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Краткие сведения Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 0
International publications: 0 Publications Web of science: 0 Publications Scopus: 0
Patents Amount of funding Code of the program
0 29899538.72 AP22784368
Name of work
Изучение распространения и видового разнообразия Babesia spp на территории Казахстана и разработка ПЦР для дифференциальной диагностики бабезиозов.
Type of work Source of funding Report authors
Applied Ахметова Асель Еркиновна
0
0
0
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) МНВО РК
Full name of the service recipient
Товарищество с ограниченной ответственностью "Национальный центр биотехнологии"
Abbreviated name of the service recipient ТОО "Национальный центр биотехнологии"
Abstract

ДНК Babesia spp

Babesia spp ДНҚ-сы.

Изучение видового разнообразия Babesia spp на территории Казахстана и разработка мультиплекс ПЦР тест-системы для дифференциальной диагностики бабезиозов КРС

Қазақстан аумағындағы Babesia spp түрлік алуантүрлілігін зерттеу және ірі қара мал бабезиозын дифференциалды диагностикалауға арналған мультиплексті ПТР тест-жүйесін әзірлеу.

Применялись молекулярно-генетические методы исследований

Зерттеулер барысында молекулалық-генетикалық зерттеу әдістері қолданылды

Для оценки эффективности ПЦР были сконструированы синтетические плазмиды, содержащие фрагменты генома Babesia spp. (B. bigemina, B. bovis, B. major). Рибосомальные и митохондриальные гены (coxI, cytb, LSU) клонировали во вектор pGEM-T и трансформировали в клетки E. coli XL1-Blue. Рекомбинантные колонии определяли с помощью синебелого скрининга и ПЦР с праймерами M13, положительные клоны подтверждали секвенированием по Сэнгеру. Клещи собраны на пастбищах Туркестанской, Атырауской и Жамбылской областей (Отырарский, Сауранский, Байзакский районы, г. Кентау) - в регионах с высоким уровнем кровепаразитарных инфекций. Сбор проводился методом протаскивания флага, каждый экземпляр помещали в отдельную пробирку с указанием даты и места сбора и доставляли в Алматинский филиал НЦБ, имеющий разрешение на работу с патогенами II-III групп. Babesia spp. идентифицировали методом ПЦР и секвенирования гена 18S рРНК, результаты сравнивали с базой NCBI BLAST. ДНК Babesia spp. обнаружена менее чем у 10% клещей; наиболее часто встречались B. bigemina, B. bovis и B. sp. Kashi 2. Синтетические плазмиды показали высокую эффективность как положительные контроли, повышая чувствительность и надёжность диагностики. Определены виды клещей: Hyalomma excavatum, H. anatolicum, H. scupense и H. detritum. Полученные данные отражают видовое разнообразие клещей и необходимость их мониторинга для оценки эпидемиологических рисков.

ПТР тиімділігін бағалау үшін Babesia spp. (B. bigemina, B. bovis, B. major) геномының фрагменттері бар синтетикалық плазмидалар жасалды. Рибосомалық және митохондриялық гендер (coxI, cytb, LSU) pGEM-T векторына клондалып, E. coli XL1-Blue жасушаларына трансформацияланды. Рекомбинантты колониялар көк-ақ скрининг және M13 праймерлерімен ПТР арқылы анықталып, оң клондар Sanger секвенирлеуімен расталды. Кенелер Түркістан, Атырау және Жамбыл облыстарындағы (Отырар, Сауран, Байзақ және Кентау) жайылымдардан жалаушаны сүйреу әдісімен жиналды. Әр үлгі жинау уақыты мен орны көрсетілген жеке түтікке салынып, II және III топ патогендерін өңдеуге лицензиясы бар Ұлттық биотехнология орталығының Алматы филиалына жеткізілді. Babesia spp. анықтау ПТР және 18S рРНҚ генін секвенирлеу арқылы жүргізіліп, нәтижелер NCBI BLAST дерекқорымен салыстырылды. Кенелердің 10%-дан азында Babesia ДНҚ табылды. Ең жиі кездескен түрлер - B. bigemina, B. bovis және B. sp. Kashi 2. Синтетикалық плазмидалар оң бақылау ретінде диагностиканың сезімталдығы мен сенімділігін арттырды. Анықталған кене түрлері: Hyalomma excavatum, H. anatolicum, H. scupense және H. detritum. Зерттеу кенелердің түрлік әртүрлілігі мен Babesia spp. тасымалдау қаупін көрсетіп, олардың популяциясын тұрақты бақылау қажеттілігін дәлелдеді.

Сконструированы плазмиды содержащие фрагменты генома Babesia spp. (B. bigemina, B. bovis, B. major)

Babesia spp. (B. bigemina, B. bovis, B. major) геномының фрагменттері бар плазмидалар құрастырылды.

Синтетические плазмиды показали высокую эффективность как положительные контроли, обеспечивая чувствительность и надежность диагностики.

Синтетикалық плазмидалар оң бақылау ретінде жоғары тиімділік көрсетті, диагностиканың сезімталдығы мен сенімділігін қамтамасыз етеді.

Ветеринария

Ветеринария

UDC indices
619:616
International classifier codes
68.41.00;
Key words in Russian
Babesia spp; секвенирование; видовое разнообразие; Real-time PCR; бабезиоз КРС;
Key words in Kazakh
Babesia spp; секвенирлеу; түрлердің әртүрлілігі; Real-time PCR; ІҚМ бабезиозы;
Head of the organization Абеев Арман Бейсенбаевич Кандидат медицинских наук /
Head of work Ахметова Асель Еркиновна PhD in Epidemiology / N/A