Inventory number IRN Number of state registration
0325РК01328 AP23489538-KC-25 0124РК00342
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Краткие сведения Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 1
International publications: 1 Publications Web of science: 1 Publications Scopus: 1
Patents Amount of funding Code of the program
0 42999410.85 AP23489538
Name of work
Вклад материнской микробиоты в развитие устойчивости к антибиотикам у младенцев
Type of work Source of funding Report authors
Fundamental Кожахметов Самат Серикович
0
0
2
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) Нет
Full name of the service recipient
Частное учреждение "National Laboratory Astana"
Abbreviated name of the service recipient National Laboratory Astana
Abstract

Объектом исследований являются микроорганизмы (микробиом) кишечника детей и их матерей.

Зерттеу объектісі балалар мен олардың аналарының ішектерінің микроорганизмдері (микробиома) болып табылады.

Выяснить вклад вертикальной передачи генов резистентности к антибиотикам в младенческий резистом от матери и охарактеризовать факторы, влияющие на их накопление в раннем детстве.

Антибиотиктерге төзімділік гендерінің анадан нәрестеге төзімділікке тік берілуінің үлесін анықтау және олардың ерте балалық шақта жиналуына әсер ететін факторларды сипаттау.

Проспективное наблюдение диад мать-новорожденный до 24 месяцев. Сбор метаданных (антропометрия, питание, вакцинация, медикаменты, заболеваемость) и образцов фекалий в критические точки (0,1,3,6,9,12,18,24 месяца) в пробирки DNA/RNA Shield (Zymo Research). Выделение ДНК набором ZymoBIOMICS, контроль качества электрофорезом, оценка спектрофотометрией Nabi-UV/Vis Nano. Shotgun-секвенирование Illumina NovaSeq 6000, таксономическое профилирование MetaPhlAn 4, функциональный анализ HUMAnN 3.0.

Ана-жаңа туған диадаларын 24 айға дейін перспективалық бақылау. Метадеректерді (антропометрия, тамақтану, вакцинация, медикаменттер, сырқаттанушылық) және нәжіс сынамаларын сыни нүктелерде (0,1,3,6,9,12,18,24 ай) DNA/RNA Shield түтіктеріне жүйелі жинау. ДНҚ бөлу ZymoBIOMICS жинағымен, сапа бақылауы электрофорезбен, бағалау Nabi-UV/Vis Nano спектрофотометриясымен. Illumina NovaSeq 6000 shotgun-секвенирлеуі, MetaPhlAn 4 таксономиялық профильдеуі, HUMAnN 3.0 функционалды талдауы.

88 бала, 57 ана сынамасы өңделді. Таксономиялық профильдеу (MetaPhlAn 4): Bifidobacterium, Bacteroides, Escherichia, Veillonella, Parabacteroides басым. 18 айға қарай ересектерге тән паттерн: Bacteroides (50-55%), Bifidobacterium (25-30%), Faecalibacterium (10-12%). Қазақстан үшін алғаш рет резистенттілік профилі: фторхинолондарға (27-30 ген), тетрациклиндерге (24-28), пенамдарға (21-24), цефалоспориндерге (19-26) жоғары; карбапенемдерге (5) төмен. Сырқаттанушылық төмендеуі 46.3%→27.3%.

Обработаны 88 образцов детей, 57 матерей. Таксономическое профилирование (MetaPhlAn 4): преобладают Bifidobacterium, Bacteroides, Escherichia, Veillonella, Parabacteroides. К 18 месяцам взрослоподобный паттерн: Bacteroides (50-55%), Bifidobacterium (25-30%), Faecalibacterium (10-12%). Впервые для Казахстана определен профиль резистентности: высокая к фторхинолонам (27-30 генов), тетрациклинам (24-28), пенамам (21-24), цефалоспоринам (19-26); низкая к карбапенемам (5).

База данных 65 пар мать-ребенок с метаданными за 24 месяца. Коллекция ДНҚ из 145 образцов (88 детей + 57 матерей). Shotgun-секвенирование Illumina NovaSeq 6000. Каталог таксономического состава микробиома детей 18-24 месяцев с 10 основными родами бактерий. База генов антибиотикорезистентности к 22 классам. Идентифицировано 8 функциональных метаболических путей. Коэффициент удержания участников 67.7%. Полнота метаданных: 97.7% (18 месяцев), 50% (24 месяца). Открытые инструменты снижают затраты.

65 ана-бала жұбының 24 ай метадеректері бар деректер базасы. 145 сынамадан (88 бала + 57 ана) ДНҚ жинағы. Illumina NovaSeq 6000 shotgun-секвенирлеуі. 18-24 ай балалардың микробиомының таксономиялық құрамының каталогы 10 негізгі бактерия туысымен. 22 антибиотик класына резистенттілік гендер базасы. 8 функционалды метаболикалық жол анықталды. Қатысушыларды ұстау коэффициенті 67.7%. Метадеректер толықтығы: 97.7% (18 ай), 50% (24 ай). Ашық құралдарды қолдану шығындарды төмендетеді.

не внедрено

жүзеге асырылмаған

Эффективность исследования подтверждается высоким уровнем удержания участников (67.7% активных пар к завершению периода наблюдения), что обеспечивает надежность и репрезентативность данных для казахстанской популяции. Комплексный подход к сбору биологических образцов и метаданных в критические временные точки развития (0, 1, 3, 6, 9, 12, 18, 24 месяца) создал уникальную основу для многофакторного анализа взаимосвязей между характеристиками микробиома, физическим развитием и состоянием здоровья детей раннего возраста. Успешное выполнение молекулярно-генетического анализа всех собранных образцов (145 образцов) с получением высококачественных метагеномных данных демонстрирует техническую состоятельность применяемых методов. Впервые для Казахстана получены референсные данные по таксономическому составу и профилю антибиотикорезистентности кишечного микробиома детей 18-24 месяцев, что создает научную базу для разработки персонализированных профилактических стратегий в педиатрической практике. Запланированные исследования выполнены в полном объеме в соответствии с календарным планом проекта.

Зерттеудің тиімділігі қатысушыларды ұстап қалудың жоғары деңгейімен расталады (бақылау кезеңінің аяқталуына қарай 67.7% белсенді жұп), бұл қазақстандық популяция үшін деректердің сенімділігі мен өкілдігін қамтамасыз етеді. Дамудың сыни уақыт нүктелерінде (0, 1, 3, 6, 9, 12, 18, 24 ай) биологиялық үлгілер мен метадеректерді жинаудың кешенді тәсілі микробиом сипаттамалары, дене дамуы және ерте жастағы балалардың денсаулық жағдайы арасындағы өзара байланыстарды көп факторлы талдау үшін бірегей негіз жасады. Барлық жиналған үлгілердің молекулалық-генетикалық талдауын сәтті орындау (145 үлгі) жоғары сапалы метагеномдық деректерді алумен қолданылатын әдістердің техникалық орындылығын көрсетеді. Қазақстан үшін алғаш рет 18-24 ай жастағы балалардың ішек микробиомының таксономиялық құрамы мен антибиотикорезистенттілік профилі бойынша референстік деректер алынды, бұл педиатриялық тәжірибеде дербестендірілген профилактикалық стратегияларды әзірлеу үшін ғылыми база жасайды. Жоспарланған зерттеулер жобаның күнтізбелік жоспарына сәйкес толық көлемде орындалды.

медицина

медицина

UDC indices
615.015.8; 615.281.9; 616-056.716
International classifier codes
34.27.21; 34.27.59; 34.15.59; 76.03.43; 62.00.00;
Key words in Russian
микробиом; метагеном; кишечник; питание; секвенирование ДНК; резистом; новорожденные; гены устойчивости к антибиотикам; технологическая экспертиза;
Key words in Kazakh
микробиом; метагеном; Ішек; тамақ; ДНҚ секвенстеу; резистом; нәрестелер; антибиотиктерге төзімділік гендер; технологиялық сараптама;
Head of the organization Сарбасов Дос Джурмаханбет Ph.D. биохимия и молекулярная биология / Ph.D.
Head of work Кожахметов Самат Серикович Кандидат биологических наук / ассоциированный профессор (доцент)