Inventory number IRN Number of state registration
0325РК00439 AP23485953-KC-25 0124РК01002
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Краткие сведения Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 1
International publications: 1 Publications Web of science: 1 Publications Scopus: 1
Patents Amount of funding Code of the program
0 42622249 AP23485953
Name of work
Эпидемиология и молекулярная биология резистома патогенов птиц
Type of work Source of funding Report authors
Fundamental Коротецкий Илья Сергеевич
0
0
0
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) МНВО РК
Full name of the service recipient
"Международный инженерно-технологический университет"
Abbreviated name of the service recipient "Международный инженерно-технологический университет"
Abstract

Трахеальные и клоакальные смывы, яйца

Трахея және клоакальды тампондар, жұмыртқалар

Изучение распространенности и характеристик резистома бактериальных патогенов, выделенных из популяций домашних и промышленных птиц в Казахстане, что обеспечит основу для разработки эффективных стратегий борьбы с распространением устойчивости к антибиотикам в сельскохозяйственной и медицинской сферах

Қазақстандағы отандық және өнеркәсіптік құстардың популяцияларынан оқшауланған бактериялық патогендердің резистомасының таралуы мен сипаттамаларын зерделеу, бұл ауыл шаруашылығы және медицина салаларында антибиотиктерге төзімділіктің таралуына қарсы күрестің тиімді стратегияларын әзірлеу үшін негізді қамтамасыз етеді

Молекулярно-генетические (выделение ДНК, секвенирование), биоинформатические (выявление генов резистентности и механизмов их передачи), программирование (создание скриптов на языке программирования Python 3 для работы с данными).

Молекулалық-генетикалық (ДНҚ оқшаулау, реттілік), биоинформатикалық (қарсылық гендерін және олардың берілу механизмдерін анықтау), бағдарламалау (деректермен жұмыс істеу үшін Python 3 бағдарламалау тілінде сценарийлер жасау).

Для оценки географических различий антибиотикорезистентности у птиц собрано 63 образца из различных зон Казахстана. Это также дало основу для первичного картирования региональных профилей резистентности у птиц. Выполнено секвенирование ДНК 30 пулов на платформе Ion Torrent PGM. Применение Resistance Gene Identifier (RGI bwt) позволило выделить в бактериальном геноме гены устойчивости и описать их механизмы. Ведется создание базы генов резистентности по регионам.

Құстардағы антибиотиктерге төзімділіктің географиялық айырмашылықтарын бағалау үшін Қазақстанның әртүрлі аймақтарынан 63 үлгі жиналды. Бұл сондай-ақ құстардағы аймақтық төзімділік профильдерін бастапқы картаға түсіруге негіз болды. Ion Torrent PGM платформасында 30 пулдың ДНҚ секвенирлеуі жүргізілді. Резистенттілік генінің идентификаторын (RGI bwt) пайдаланып, бактериялық геномдағы төзімділік гендері анықталды және олардың механизмдері сипатталды. Аймақтар бойынша төзімділік гендерінің дерекқоры жасалуда.

Разработка целенаправленных стратегий для борьбы с устойчивостью к антибиотикам позволит снизить затраты на лечение заболеваний у птиц. Это, в свою очередь, приведет к снижению потерь от болезней и увеличению производительности птицеводства. Полученные знания о механизмах и путях распространения устойчивости к антибиотикам помогут оптимизировать их использование, что сократит затраты на закупку антибиотиков и уменьшит риск развития устойчивости. Повышение качества продукции и уменьшение использования антибиотиков улучшат восприятие продукции на рынке, что может привести к увеличению спроса и, соответственно, доходов.

Антибиотиктерге төзімділікпен күресудің мақсатты стратегияларын әзірлеу құстардағы ауруларды емдеуге кететін шығындарды азайтады. Бұл өз кезегінде аурудан болатын шығындардың төмендеуіне және құс шаруашылығының өнімділігінің артуына әкеледі. Антибиотиктерге төзімділіктің таралу механизмдері мен жолдары туралы алынған білім оларды пайдалануды оңтайландыруға көмектеседі, бұл антибиотиктерді сатып алу шығындарын азайтады және төзімділіктің даму қаупін азайтады. Өнім сапасын жақсарту және антибиотиктерді қолдануды азайту нарықтағы өнімді қабылдауды жақсартады, бұл сұраныстың және сәйкесінше кірістің артуына әкелуі мүмкін.

не внедрено

енгізілген жоқ

Комбинация протокола CTAB со спин-колонками, проверенный и воспроизводимый способ выделения бактериальной ДНК, обеспечивающий получение высококачественных образцов для последующего секвенирования. Обработка результатов в системе Resistance Gene Identifier (RGI, модуль bwt) позволяет обнаруживать и прогнозировать присутствие генов антибиотикорезистентности в бактериальном геноме, а также уточнять механизмы устойчивости. Включение современных исследовательских методик и раздела по антибиотикорезистентности в учебные программы Международного инженерно-технологического университета повысит уровень подготовки студентов и молодых ученых для сфер здравоохранения и сельского хозяйства. В совокупности эти факторы указывают на успешную реализацию проекта. Научная значимость работы обусловлена обоснованным выбором методов, применением передовых технологий и комплексным, многоуровневым анализом данных.

CTAB хаттамасының спин бағандарымен үйлесімі бактериялық ДНҚ-ны бөліп алудың дәлелденген және қайталанатын әдісі болып табылады, бұл кейінгі секвенирлеу үшін жоғары сапалы үлгілерді қамтамасыз етеді. Нәтижелерді Резистенттілік Генінің Идентификаторы (RGI, bwt модулі) жүйесінде өңдеу бактериялық геномдағы антибиотикке төзімділік гендерін анықтауға және болжауға, сондай-ақ төзімділік механизмдерін анықтауға мүмкіндік береді. Халықаралық инженерлік және технологиялық университеттің оқу бағдарламаларына заманауи зерттеу әдістерін және антибиотикке төзімділік бөлімін қосу денсаулық сақтау және ауыл шаруашылығы салаларындағы студенттер мен жас ғалымдарды даярлауды жақсартады. Жалпы алғанда, бұл факторлар жобаның сәтті жүзеге асырылғанын көрсетеді. Жұмыстың ғылыми маңыздылығы әдістерді дұрыс таңдаумен, озық технологияларды қолданумен және кешенді, көп деңгейлі деректерді талдаумен анықталады.

Результаты исследования позволят заранее выявлять и предотвращать вспышки, вызванные патогенами с устойчивостью к антибиотикам. Птицеводческие предприятия получат прикладные сведения о путях распространения и методах контроля таких бактерий, что повысит производственные показатели и безопасность пищевой продукции. Государственные и международные структуры, отвечающие за общественное здоровье, смогут опираться на эти данные при формировании стратегий противодействия антибиотикорезистентности и укрепления здоровья населения.

Зерттеу нәтижелері антибиотиктерге төзімді патогендер тудыратын індеттерді ерте анықтауға және алдын алуға мүмкіндік береді. Құс фабрикалары бұл бактериялардың таралуы мен бақылау әдістері туралы практикалық түсініктерге ие болады, өндіріс көрсеткіштерін және азық-түлік қауіпсіздігін жақсартады. Ұлттық және халықаралық қоғамдық денсаулық сақтау агенттіктері бұл деректерді антибиотиктерге төзімділікпен күресу және қоғамдық денсаулықты жақсарту стратегияларын әзірлеу үшін пайдалана алады.

UDC indices
577.2, 579.64
International classifier codes
34.15.23; 34.15.00;
Key words in Russian
бактерии; секвенирование нового поколения; метагеном; эпидемиология; резистом;
Key words in Kazakh
бактериялар; жаңа буын секвенциясы; метаген; эпидемиология; қарсы тұру;
Head of the organization Акпанбетов Дархан Берикович Кандидат технических наук / Ассоциированный профессор
Head of work Коротецкий Илья Сергеевич Кандидат биологических наук / Ассоциированный профессор