Inventory number IRN Number of state registration
0225РК00956 AP19677444-OT-25 0123РК00936
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Заключительный Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 1
International publications: 1 Publications Web of science: 1 Publications Scopus: 1
Number of books Appendicies Sources
1 4 49
Total number of pages Patents Illustrations
69 0 11
Amount of funding Code of the program Table
35500000 AP19677444 9
Name of work
Идентификация локусов количественных признаков продуктивности и качества семян нута (Cicer arietinum L.) на основе использования полногеномного анализа ассоциаций
Report title
Type of work Source of funding The product offerred for implementation
Applied Коллекции
Report authors
Әнуарбек Шынар Нұрланқызы , Затыбеков Алибек Камзабекович , Туруспеков Ерлан Кенесбекович , Абугалиева Сауле Изтелеуовна , Гениевская Юлия Анатольевна , Ешенгалиева Ая Нурлановна ,
0
0
1
1
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) МНВО РК
Full name of the service recipient
Республиканское Государственное предприятие на праве хозяйственного ведения "Институт Биологии и биотехнологии растений"
Abbreviated name of the service recipient РГП на ПХВ «ИББР»
Abstract

258 отандық және шетелдік үлгілерден тұратын Cicer arietinum L. ноқат коллекциясы

Коллекция нута Cicer arietinum L., состоящая из 258 отечественных и зарубежных образцов

Осуществить поиск локусов количественных признаков, определяющих продуктивность и качество семян, на основе изучения мировой коллекции нута и использования методологии полногеномного анализа ассоциаций

Дүниежүзілік ноқат коллекциясын зерттеу және ассоциацияларды толық геномдық талдау әдістемесін қолдану негізінде өнімділік пен дән сапасын анықтайтын сандық белгі локустарын іздеуді жүзеге асыру

Селекциялық тұрғыда құнды белгілерге фенотиптік талдау, ДНҚ-ны оқшаулау және тазарту, толық геномды ресеквенирлеу, биохимиялық талдау, популяциялық талдау, геномдық ассоциацияларды талдау, KASP технологиялары негізінде генотиптеу. Корреляциялық және кластерлік талдау негізінде статистикалық мәліметтерді өңдеу. Бұл жұмыста GATK4, SAMtools, snpEff, VCFtools 4.2, Structure 2.3.4, TASSEL 5.2.90, GAPIT 3, GenAlex 6.5, PAST v3.25, SPSS 22.0 статистикалық қолданбалы бағдарламалары қолданылды.

Фенотипический анализ по селекционно-ценным признакам, выделение и очистка ДНК, полногеномное ресеквенирование, биохимический анализ, популяционный анализ, полногеномный анализ ассоциаций, генотипирование на основе технологий KASP. Статистическая обработка данных на основе корреляционного и кластерного анализа. В работе использованы статистические прикладные программы GATK4, SAMtools, snpEff, VCFtools 4.2, Structure 2.3.4, TASSEL 5.2.90, GAPIT 3, GenAlex 6.5, PAST v3.25, SPSS 22.0.

Проведено исследования по ресеквенированию полного генома 20 казахстанских сортообразцов нута и анализу 238 образцов мировой коллекции. Фенотипический анализ показал значительные различия по хозяйственно-ценным признакам в зависимости от происхождения и условии выращивания. Отмечено высокая изменьчивость по морфологическим характеристикам. Биохимический анализ семян показал широкий диапазон варьирования по содержанию белка и жира. Установлены значимые различия по аминокислотному профилю образцов коллекции. Выявлено 480 866 полиморфных SNP маркеров. Идентифицировано 351 значимые ассоциации маркер-признак, связанные с ключевыми агрономическими показателями из них 40 стабильные, что открывает перспективы для селекции. Применение созданных 27 KASP-маркеров, станет важным шагом в оптимизации селекционных процессов, способствуя увеличению урожайности и качества производства нута, что критически необходимо для продовольственной безопасности региона.

Қазақстандық ноқаттың 20 сортоүлгісінің толық геномын қайта секвенирлеу және дүниежүзілік коллекцияның 238 үлгісін талдау бойынша зерттеулер жүргізілді. Фенотиптік талдау шығу тегі мен өсіру жағдайларына байланысты шаруашылыққа пайдалы белгілер бойынша айтарлықтай айырмашылықтарды көрсетті. Морфологиялық сипаттамалар бойынша жоғары өзгергіштік байқалды. Тұқымның биохимиялық талдауы ақуыз бен май құрамының кең ауқымда өзгеретінін анықтады. Коллекция үлгілерінің аминқышқылдық құрамында да елеулі айырмашылықтар белгіленді. Зерттеу нәтижесінде 480 866 полиморфты SNP-маркерлері анықталды. Негізгі агрономиялық көрсеткіштермен байланысты 351 маңызды маркер–белгі ассоциациясы идентификацияланып, олардың 40-ы тұрақты екені дәлелденді, бұл селекция үшін жаңа мүмкіндіктер ашады. Жасалған 27 KASP-маркерді қолдану селекциялық процестерді оңтайландырудағы маңызды қадам болып табылады және ноқаттың өнімділігі мен сапасын арттыруға ықпал етіп, өңірдің азық-түлік қауіпсіздігін қамтамасыз ету үшін шешуші мәнге ие болады.

Проведен комплексный анализ 258 генотипов нута по фенотипическим, генетическим и биохимическим признакам. Разработано и валидировано 27 KASP-маркеров, связанные с признаками морфологии и урожайности.

Ноқаттың 258 генотипі фенотиптік, генетикалық және биохимиялық белгілер бойынша кешенді талдаудан өткізілді. Морфологиялық және өнімділік белгілерімен байланысқан 27 KASP-маркері әзірленіп, валидациядан өтті.

Высокий отложенный эффект

Жоғары кейінге қалдырылған әсер

SNP-маркеры, идентифицированные на основе ПГАА мировой коллекции нута, могут быть использованы в селекционных программах, направленных на повышение продуктивности и качества семян нута

Дүниежүзілік ноқат коллекциясының АТГТ негізінде анықталған SNP-маркерлері ноқат өнімділігі мен дән сапасын арттыруға бағытталған селекциялық бағдарламаларда қолданылуы мүмкін.

генетика, селекция и семеноводство нута

ноқаттың генетикасы, селекциясы және тұқым шаруашылығы

UDC indices
631.523.4; 577.21:575.113:633.37
International classifier codes
34.15.23; 34.23.57; 68.35.31; 34.23.37;
Readiness of the development for implementation
Key words in Russian
Генетика; Нут; Компоненты урожайности; Качество семян; Продуктивность; Полногеномный анализ ассоциаций; Локусы количественных признаков; Информативные ДНК-маркеры;
Key words in Kazakh
Генетика; Ноқат; Өнімділік компоненттері; Дән сапасы; Өнімділік; Ассоциацияларды толық геномды талдау; Сандық белгі локустары; Ақпаратты ДНҚ-маркерлер;
Head of the organization Жамбакин Кабыл Жапарович Доктор биологических наук / профессор
Head of work Әнуарбек Шынар Нұрланқызы PhD / нет
Native executive in charge Затыбеков Алибек Камзабекович нет