| Inventory number | IRN | Number of state registration |
|---|---|---|
| 0225РК00452 | AP19676216-OT-25 | 0123РК00723 |
| Document type | Terms of distribution | Availability of implementation |
| Заключительный | Gratis | Number of implementation: 0 Not implemented |
| Publications | ||
| Native publications: 0 | ||
| International publications: 1 | Publications Web of science: 1 | Publications Scopus: 1 |
| Number of books | Appendicies | Sources |
| 1 | 4 | 19 |
| Total number of pages | Patents | Illustrations |
| 60 | 0 | 14 |
| Amount of funding | Code of the program | Table |
| 35800000 | AP19676216 | 5 |
| Name of work | ||
| Эволюционная геномика Mycobacterium tuberculosis в Казахстане: связь между древними и современными вспышками | ||
| Report title | ||
| Type of work | Source of funding | The product offerred for implementation |
| Fundamental | Метод, способ | |
| Report authors | ||
| Тарлыков Павел Викторович , Жолдыбаева Елена Витальевна , Скиба Юрий Александрович , Атавлиева Сабина Шамшиддинкызы , Ауганова Дана , Конарбаева Амина , | ||
|
0
0
0
0
|
||
| Customer | МНВО РК | |
| Information on the executing organization | ||
| Short name of the ministry (establishment) | МНВО РК | |
| Full name of the service recipient | ||
| Товарищество с ограниченной ответственностью "Национальный центр биотехнологии" | ||
| Abbreviated name of the service recipient | ТОО "Национальный центр биотехнологии" | |
| Abstract | ||
|
Клинические изоляты M. tuberculosis семейства L2/Beijing с различным спектром лекарственной чувствительности Әртүрлі дәрілік сезімталдық спектрі бар M. tuberculosis отбасының L2/Beijing клиникалық изоляттары Улучшение контроля над туберкулезом и изучение путей его передачи с уделением особого внимания возникновению вспышек МЛУ-ТБ в Казахстане и Центральной Азии с использованием методов геномной эпидемиологии, мультиомного анализа, и анализа данных Геномдық эпидемиология, мульти-омдық талдау және деректерді талдау әдістерін пайдалана отырып, Қазақстан мен Орталық Азияда ДТ-туберкулез ошақтарының пайда болуына ерекше назар аудара отырып, туберкулезбен күресті жақсарту және оның таралу жолдарын зерттеу В процессе работы использовались такие молекулярно-генетические методы, как выделение ДНК, РНК, белков, ПЦР, секвенирование нового поколения, масс-спектрометрический анализ Зерттеу барысында келесідей молекулалы-генетикалық әдістері қолданылды: ДНҚ экстракциясы, ақуыз экстракциясы, ПТР, толық геномды секвенирлеу және сұйық хроматографиямен байланысқан масс-спектрометрия талдауы Была сформирована репрезентативная выборка клинических изолятов M.tuberculosis. Был проведен сбор 332 образцов ДНК для пополнения коллекции клинических изолятов M. tuberculosis, из них 265 изолятов M.tuberculosis семейства L2 были генотипированы с помощью ПЦР в реальном времени. Получены 173 высококачественные полные геномные последовательности местных изолятов M.tuberculosis семейства L2. В результате работ проанализированы геномные данные выборки из 173 клинических изолятов M.tuberculosis семейства L2 с использованием биоинформатической платформы TB-Annotator. Проведена кластеризация и классификация изолятов L2, выявлено шесть новых генетических кластеров. Проведен филогенетический, протеомный и транскриптомный анализ Алынған нәтижелер: M.tuberculosis клиникалық изоляттарының репрезентативті үлгісі қалыптастырылды. M.tuberculosis клиникалық изоляттары ДНҚ жинағын толықтыру мақсатында 332 үлгі жиналынды, оның ішінде 265 изоляты L2 тұқымдасы нақты уақыттағы ПТР көмегімен генотиптелді. M.tuberculosis жергілікті M. tuberculosis изоляттарының L2 линиясына жататын 173 жоғары сапалы толық геномды тізбектері алынды. Нәтижесінде секвенирлеу бойынша алынған L2 линиясына жататын 173 M.tuberculosis клиникалық изоляттары TB-Annotator биоинформатикалық платформасында талданды. L2 тұқымдасына жататын изоляттарды классификациялау және кластеризациялау жұмыстары жүргізілді, 6 жаңа генетикалық кластер анықталды. Филогенетикалық, протеомдық және транскриптомдық талдау жұмыстары жүргізілді. Высокая точность прочтения последовательности ДНК M. tuberculosis за счет использования технологии секвенирования нового поколения Жаңа буындағы секвенирлеу технологиясын пайдалану арқылы M. tuberculosis ДНҚ тізбегін жоғары дәлдікпен анықтау қамтамасыз етілді Данный проект относится к фундаментальному направлению Бұл жоба іргелі зерттеу бағытына жатады Методы геномной эпидемиологии, мультиомного анализа, и анализа данных позволили лучше понять особенности локальных штаммов M. tuberculosis, что может повысить экономическую эффективность применяемых стратегий контроля M. tuberculosis Геномдық эпидемиология, мультиомдық талдау және деректерді талдау әдістерін қолдану жергілікті M. tuberculosis штаммдарының ерекшеліктерін тереңірек түсінуге мүмкіндік берді, бұл өз кезегінде M. tuberculosis бақылау стратегияларының экономикалық тиімділігін арттыруы мүмкін Медицина Медицина |
||
| UDC indices | ||
| 616-002.5:579.252.55-07 | ||
| International classifier codes | ||
| 76.29.50; | ||
| Readiness of the development for implementation | ||
| Key words in Russian | ||
| Туберкулез; Эволюция; Вспышка; Инфекционное заболевание; Геномика; | ||
| Key words in Kazakh | ||
| Туберкулез; Эволюция; Індет; Жұқпалы ауру; Геномика; | ||
| Head of the organization | Абеев Арман Бейсенбаевич | К.б.н. / нет |
| Head of work | Тарлыков Павел Викторович | Ph.D / Профессор |
| Native executive in charge | ||