Inventory number IRN Number of state registration
0225РК00452 AP19676216-OT-25 0123РК00723
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Заключительный Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 0
International publications: 1 Publications Web of science: 1 Publications Scopus: 1
Number of books Appendicies Sources
1 4 19
Total number of pages Patents Illustrations
60 0 14
Amount of funding Code of the program Table
35800000 AP19676216 5
Name of work
Эволюционная геномика Mycobacterium tuberculosis в Казахстане: связь между древними и современными вспышками
Report title
Type of work Source of funding The product offerred for implementation
Fundamental Метод, способ
Report authors
Тарлыков Павел Викторович , Жолдыбаева Елена Витальевна , Скиба Юрий Александрович , Атавлиева Сабина Шамшиддинкызы , Ауганова Дана , Конарбаева Амина ,
0
0
0
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) МНВО РК
Full name of the service recipient
Товарищество с ограниченной ответственностью "Национальный центр биотехнологии"
Abbreviated name of the service recipient ТОО "Национальный центр биотехнологии"
Abstract

Клинические изоляты M. tuberculosis семейства L2/Beijing с различным спектром лекарственной чувствительности

Әртүрлі дәрілік сезімталдық спектрі бар M. tuberculosis отбасының L2/Beijing клиникалық изоляттары

Улучшение контроля над туберкулезом и изучение путей его передачи с уделением особого внимания возникновению вспышек МЛУ-ТБ в Казахстане и Центральной Азии с использованием методов геномной эпидемиологии, мультиомного анализа, и анализа данных

Геномдық эпидемиология, мульти-омдық талдау және деректерді талдау әдістерін пайдалана отырып, Қазақстан мен Орталық Азияда ДТ-туберкулез ошақтарының пайда болуына ерекше назар аудара отырып, туберкулезбен күресті жақсарту және оның таралу жолдарын зерттеу

В процессе работы использовались такие молекулярно-генетические методы, как выделение ДНК, РНК, белков, ПЦР, секвенирование нового поколения, масс-спектрометрический анализ

Зерттеу барысында келесідей молекулалы-генетикалық әдістері қолданылды: ДНҚ экстракциясы, ақуыз экстракциясы, ПТР, толық геномды секвенирлеу және сұйық хроматографиямен байланысқан масс-спектрометрия талдауы

Была сформирована репрезентативная выборка клинических изолятов M.tuberculosis. Был проведен сбор 332 образцов ДНК для пополнения коллекции клинических изолятов M. tuberculosis, из них 265 изолятов M.tuberculosis семейства L2 были генотипированы с помощью ПЦР в реальном времени. Получены 173 высококачественные полные геномные последовательности местных изолятов M.tuberculosis семейства L2. В результате работ проанализированы геномные данные выборки из 173 клинических изолятов M.tuberculosis семейства L2 с использованием биоинформатической платформы TB-Annotator. Проведена кластеризация и классификация изолятов L2, выявлено шесть новых генетических кластеров. Проведен филогенетический, протеомный и транскриптомный анализ

Алынған нәтижелер: M.tuberculosis клиникалық изоляттарының репрезентативті үлгісі қалыптастырылды. M.tuberculosis клиникалық изоляттары ДНҚ жинағын толықтыру мақсатында 332 үлгі жиналынды, оның ішінде 265 изоляты L2 тұқымдасы нақты уақыттағы ПТР көмегімен генотиптелді. M.tuberculosis жергілікті M. tuberculosis изоляттарының L2 линиясына жататын 173 жоғары сапалы толық геномды тізбектері алынды. Нәтижесінде секвенирлеу бойынша алынған L2 линиясына жататын 173 M.tuberculosis клиникалық изоляттары TB-Annotator биоинформатикалық платформасында талданды. L2 тұқымдасына жататын изоляттарды классификациялау және кластеризациялау жұмыстары жүргізілді, 6 жаңа генетикалық кластер анықталды. Филогенетикалық, протеомдық және транскриптомдық талдау жұмыстары жүргізілді.

Высокая точность прочтения последовательности ДНК M. tuberculosis за счет использования технологии секвенирования нового поколения

Жаңа буындағы секвенирлеу технологиясын пайдалану арқылы M. tuberculosis ДНҚ тізбегін жоғары дәлдікпен анықтау қамтамасыз етілді

Данный проект относится к фундаментальному направлению

Бұл жоба іргелі зерттеу бағытына жатады

Методы геномной эпидемиологии, мультиомного анализа, и анализа данных позволили лучше понять особенности локальных штаммов M. tuberculosis, что может повысить экономическую эффективность применяемых стратегий контроля M. tuberculosis

Геномдық эпидемиология, мультиомдық талдау және деректерді талдау әдістерін қолдану жергілікті M. tuberculosis штаммдарының ерекшеліктерін тереңірек түсінуге мүмкіндік берді, бұл өз кезегінде M. tuberculosis бақылау стратегияларының экономикалық тиімділігін арттыруы мүмкін

Медицина

Медицина

UDC indices
616-002.5:579.252.55-07
International classifier codes
76.29.50;
Readiness of the development for implementation
Key words in Russian
Туберкулез; Эволюция; Вспышка; Инфекционное заболевание; Геномика;
Key words in Kazakh
Туберкулез; Эволюция; Індет; Жұқпалы ауру; Геномика;
Head of the organization Абеев Арман Бейсенбаевич К.б.н. / нет
Head of work Тарлыков Павел Викторович Ph.D / Профессор
Native executive in charge