Inventory number IRN Number of state registration
0225РК00518 AP19676334-OT-25 0123РК00234
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Заключительный Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 1
International publications: 2 Publications Web of science: 2 Publications Scopus: 2
Number of books Appendicies Sources
1 2 48
Total number of pages Patents Illustrations
108 0 30
Amount of funding Code of the program Table
35789130 AP19676334 8
Name of work
Исследование наследования нитей ДНК в митохондриальной ДНК человека
Report title
Type of work Source of funding The product offerred for implementation
Fundamental Методическая документация
Report authors
Тайпақова Сәбира Мықтыбекқызы , Маткаримов Бахыт Турганбаевич , Манапқызы Диана , Жаманбаева Гулжан Толеугажиевна , Джолдыбаева Ботагоз Сердалыевна , Ищенко Александр Анатольевич , Сапарбаев Мурат Калиевич , Рамазанова Замарт Елтаевна , Әліқул Айжан Берікқызы ,
0
0
2
2
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) Нет
Full name of the service recipient
Частное учреждение "National Laboratory Astana"
Abbreviated name of the service recipient National Laboratory Astana
Abstract

Клеточные линии человека HeLaS3, HEK293 митохондриальная дцДНК и оцДНК

Адамның HeLaS3, HEK293 жасушалық желілері, митохондриялық екі тізбекті ДНҚ және бір тізбекті ДНҚ.

исследование эквивалентности нитей ДНК митохондриального генома клеток человека и дрожжей с помощью применения принципа эксперимента Месельсона-Сталя.

Мезельсон-Сталь тәжірибесінің қағидаларын қолдана отырып, адам жасушалары мен ашытқылардың митохондриялық геномының ДНҚ тізбектерінің эквиваленттілігін зерттеу.

Культивирование клеток человека, oбработка клеток ДНК повреждающими агентами, выделение клеточной ДНК, сепарация нитей мтДНК ультрацентрифугированием в градиенте CsCl, HPLC-MSn анализ, мечение митоДНК стабильными изотопами и BrdU, иммунопреципитация, Саузерн-блот, Радиоаутография.

Адам жасушаларын өсіру, жасушаларды ДНҚ зақымдайтын агенттермен өңдеу, жасушалық ДНҚ-ны оқшаулау, CsCl градиентінде ультрацентрифугалау арқылы мтДНҚ тізбектерін бөлу, HPLC-MSn талдау, мтДНҚ-ны тұрақты изотоптармен және BrdU-мен белгілеу, иммунопреципитация, Саузерн-блот, Радиоавтография.

Разработаны и оптимизированы протоколы выделения ядерной и митоДНК из клеток человека, обеспечивающие высокую чистоту и выход целевых фракций. На их основе усовершенствованы условия включения стабильных изотопов углерода в ядерную и митоДНК, что обеспечило воспроизводимость экспериментов и высокую точность измерений. Для анализа распределения изотопов в H и L цепях создан метод их разделения с использованием ультрацентрифугирования в градиенте CsCl. Разработаны методики ферментативного гидролиза и LC-MS/MS-анализа дезоксинуклеозидов, позволяющие точно определять соотношение изотопов ¹³C/¹²C в ДНК. Кроме того, внедрён воспроизводимый протокол выделения митоДНК, при этом установлено, что для проведения LC-MS/MS-анализа требуется дальнейшее повышение её выхода. Также реализован подход с in situ BrdU-мечением для количественного анализа H и L цепей мтДНК. Показано, что в исследованных условиях отсутствуют значимые различия в инкорпорации и деплеции BrdU между цепями H и L, что подтверждает симметричность процессов репликации митохондриальной ДНК.

Мақсатты фракциялардың жоғары тазалығы мен шығуын қамтамасыз ететін адам жасушаларынан ядролық және мтДНҚ-ны оқшаулау хаттамалары әзірленді және оңтайландырылды. Олардың негізінде тұрақты көміртегі изотоптарын ядролық және мтДНҚ-ға қосу шарттары жетілдірілді, бұл эксперименттердің қайталануын және өлшеудің жоғары дәлдігін қамтамасыз етті. H және L-тізбектеріндегі изотоптардың таралуын талдау үшін CsCl градиентіндегі ультрацентрифугалауды қолдана отырып, оларды бөлу әдісі жасалды. ДНҚ-дағы 13С/12C изотоптарының арақатынасын дәл анықтауға мүмкіндік беретін ферментативті гидролиз және LC-MS/MS дезоксинуклеозидті талдау әдістері әзірленді. Сонымен қатар, қайталанатын мтДНҚ-ны оқшаулау хаттамасы енгізілді, LC-MS/MS талдауын жүргізу үшін оның шығымдылығын одан әрі арттыру қажет екендігі анықталды. мтДНҚ-ның H және L- тізбектерін сандық талдау үшін in situ BrDU таңбалау әдісі де жүзеге асырылды. Зерттелген жағдайларда митохондриялық ДНҚ репликациясы үдерісінің симметриялылығын растайтын H және L-тізбектері арасындағы BrDU инкорпорациясы мен депляциясында айтарлықтай айырмашылықтар жоқ екені көрсетілген.

Практическое внедрение результатов проекта планируется в рамках последующего этапа коммерциализации и диссертационной работы. Полученные методические разработки могут быть использованы при создании лабораторных диагностических тестов для оценки митохондриального статуса и при обучении специалистов в области молекулярной биологии и биотехнологии. В ходе выполнения проекта была укреплена материально-техническая база лаборатории молекулярной генетики Казахского национального университета им. Аль-Фараби и Национальной лаборатории Астана, что позволит расширить спектр проводимых исследований.

Жобаның нәтижелерін практикалық енгізу келесі коммерцияландыру кезеңіне және диссертациялық жұмысқа жоспарланған. Алынған әдістемелік әзірлемелер митохондриялық күйді бағалауға арналған зертханалық диагностикалық сынақтарды әзірлеу және молекулалық биология және биотехнология мамандарын дайындау үшін пайдаланылуы мүмкін. Жоба әл-Фараби атындағы ҚазҰУ молекулярлық-генетика зертханасының және Астана ұлттық зертханасының материалдық-техникалық қорын нығайтты, бұл жүргізілетін зерттеулердің ауқымын кеңейтеді.

Результаты НИР могут быть включены в учебные курсы и программы повышения квалификации по молекулярной биологии и генетике.

ҒЗЖ нәтижелері молекулалық биология және генетика бойынша оқу курстары мен біліктілікті арттыру бағдарламаларына енгізілуі мүмкін.

Проект фундаментального характера. Впервые проведено экспериментальное исследование эквивалентности нитей митохондриальной ДНК человека с использованием изотопного мечения и BrdU-инкорпорации. Разработаны и верифицированы методы LC-MS/MS-анализа и цепь-специфического определения мтДНК, обеспечивающие воспроизводимое измерение изотопного состава. Эффективность проекта заключается в создании научно обоснованной экспериментальной модели для анализа динамики митохондриальной репликации, обеспечивающей возможность углублённого изучения механизмов клеточного старения, мутагенеза и нарушений энергетического обмена в человеке.

Бұл жоба іргелі сипаттамаға ие. Алғаш рет изотоптық таңбалау және BrdU инкорпорациясын қолдана отырып, адам митохондриялық ДНҚ тізбектерінің эквиваленттілігін эксперименттік зерттеу жүргізілді. LC-MS/MS талдауы және мтДНҚ-ны тізбекке тән анықтау әдістері әзірленіп, тексерілді, бұл изотоптық құрамның қайталанатын өлшемдерін қамтамасыз етеді. Жобаның тиімділігі митохондриялық репликация динамикасын талдауға арналған ғылыми негізделген эксперименттік модельді жасауда жатыр, бұл адамдардағы жасушалық қартаю, мутагенез және энергия алмасуының бұзылу механизмдерін терең зерттеуге мүмкіндік береді.

Результаты могут служить основой для дальнейших исследований в области биохимии и молекулярной биологии.

Нәтижелер биохимия және молекулалық биология саласындағы қосымша зерттеулерге негіз бола алады.

UDC indices
577. 21; 577. 24
International classifier codes
34.00.00; 34.15.00; 34.15.23; 62.33.31;
Readiness of the development for implementation
Key words in Russian
Полуконсервативная репликация ДНК; Эксперимент Мезельсона-Сталя; Повреждение и репарация ДНК; Митохондриальная ДНК; Эквивалентность нитей ДНК; Паттерны мутаций; Смещение нуклеотидного состава; Маркировка устойчивыми изотопами;
Key words in Kazakh
ДНҚ-ның жартылай консервативті репликациясы; Мезельсон-Сталь тәжірибесі; ДНҚ-ның зақымдануы және қалпына келуі; Митохондриялық ДНҚ; ДНҚ тізбектерінің эквиваленттілігі; Мутация заңдылықтары; Нуклеотидтер құрамының ығысуы; Тұрақты изотоптармен таңбалау;
Head of the organization Сарбасов Дос Джурмаханбет Ph.D. Biochemistry and Molecular Biology / Ph.D.
Head of work Тайпақова Сәбира Мықтыбекқызы Phd / ассоциированный профессор
Native executive in charge Ищенко Александр Анатольевич Research Director