| Inventory number | IRN | Number of state registration |
|---|---|---|
| 0225РК00169 | AP19678106-OT-25 | 0123РК00754 |
| Document type | Terms of distribution | Availability of implementation |
| Заключительный | Gratis | Number of implementation: 0 Not implemented |
| Publications | ||
| Native publications: 1 | ||
| International publications: 1 | Publications Web of science: 1 | Publications Scopus: 1 |
| Number of books | Appendicies | Sources |
| 1 | 7 | 40 |
| Total number of pages | Patents | Illustrations |
| 112 | 0 | 15 |
| Amount of funding | Code of the program | Table |
| 33165024.75 | AP19678106 | 10 |
| Name of work | ||
| Выявление новых герминальных и соматических мутаций при интракраниальных артериовенозных мальформациях | ||
| Report title | ||
| Type of work | Source of funding | The product offerred for implementation |
| Fundamental | Базы, банки данных | |
| Report authors | ||
| Жолдыбаева Елена Витальевна , Мұхтарова Қымбат Ерланқызы , Менлибаева Қарашаш Кайратқызы , Кулмамбетова Гульмира Нигметжановна , Нугманова Раушан , Бекбаева Аяжан , Курентай Ботакөз , Гусмаулемова Алуа , Башарова Диана Азаматовна , | ||
|
0
0
0
0
|
||
| Customer | МНВО РК | |
| Information on the executing organization | ||
| Short name of the ministry (establishment) | МНВО РК | |
| Full name of the service recipient | ||
| Товарищество с ограниченной ответственностью "Национальный центр биотехнологии" | ||
| Abbreviated name of the service recipient | ТОО "Национальный центр биотехнологии" | |
| Abstract | ||
|
Венозная кровь и ткань, взятые от пациентов с артериовенозными мальформациями головного мозга. Артериовеноздық мальформациялары (АВМ) бар науқастардан алынған веноздық қан мен ми қан тамырларының үлгілері Цель работы заключается в идентификации новых и редких герминальных и соматических мутаций, обуславливающие развитие АВМ головного мозга; выявление ключевых генов и биологических путей, участвующих в прогрессировании АВМ головного мозга на основе РНК-секвенирования. Мидың АВМ дамуын анықтайтын жаңа және сирек кездесетін герминалды және соматикалық мутацияларды идентификациялау; РНҚ секвенирлеу (RNA-seq) негізінде АВМ-нің үдеуіне қатысатын негізгі гендер мен биологиялық жолдарды анықтау. Молекулярно-генетические – выделение геномной ДНК из крови и ткани пациентов, тотальной РНК, полноэкзомное секвенирование (NGS), РНК-секвенирование (NGS), ДНК секвенирование по Сэнгеру, ПЦР в режиме реального времени. Молекулалық-генетикалық әдістер – науқастардың қан мен тін үлгілерінен геномдық ДНҚ мен толық РНҚ бөліп алу, толық экзомдық секвенирлеу (NGS), РНҚ-секвенирлеу (NGS), Сэнгер әдісімен ДНҚ секвенирлеу, нақты уақыттағы ПТР (qPCR). В результате исследований на основе анализа in silico выявлены гены-кандидаты, связанные с развитием поражения АВМ, включая COL3A1, CTNNB1, LAMA1, NPHP3, SLIT2, SLIT3, SMO, MAPK3, LRRK2, TTN, ERBB2, PARD3 и OBSL1. Из них генетические варианты (герминальные мутации): ERBB2, SLIT3, SMO, MAPK3 и TTN классифицированы согласно SIFT как «повреждающие» (damaging). Большинство из вышеперечисленных генов участвуют в сигнальных путях, которые контролируют васкулогенез и ангиогенез. В этом исследовании мы обнаружили повышенную экспрессию FOS, JUNB и ATF3, которые являются членами семейства факторов транскрипции AP-1, участвующий в сигнальных путях. Картирование сети белок-белковых взаимодействий продемонстрировало взаимосвязь между спорадическими мутациями в генах IFNA4, GATA4, CTDP1, PARP4 и подобранных набором генов, связанных с развитием АВМ головного мозга. Наши результаты свидетельствуют о том, что спорадические АВМ могут возникать не только из-за прямых нарушений сосудистой сигнализации, но и из-за соматических нарушений в регуляции транскрипции, иммунных путях и механизмах репарации ДНК. Зерттеу нәтижесінде In silico талдау негізінде АВМ дамуымен байланысты COL3A1, CTNNB1, LAMA1, NPHP3, SLIT2, SLIT3, SMO, MAPK3, LRRK2, TTN, ERBB2, PARD3 және OBSL1 ген-кандидаттары анықталды. Олардың ішінде герминалды мутациялар болып табылатын ERBB2, SLIT3, SMO, MAPK3 және TTN генетикалық варианттары SIFT бойынша «зақымдаушы» (damaging) ретінде жіктелді. Аталған гендердің көпшілігі васкулогенез бен ангиогенезді реттейтін сигналдық жолдарға қатысатыны анықталды. Бұл зерттеуде біз AP-1 транскрипциялық факторлар отбасының мүшелері болып табылатын FOS, JUNB және ATF3 гендерінің жоғары экспрессиясын байқадық. Ақуыз-ақуыз өзара әрекеттесу желісін карталау нәтижесінде IFNA4, GATA4, CTDP1, PARP4 гендеріндегі спорадикалық мутациялар мен АВМ дамуымен байланысты басқа гендер жиынтығы арасында байланыс анықталды. Нәтижелеріміз спорадикалық АВМ-нің тек қана тамырлық сигнал беру жүйелерінің тікелей бұзылуынан емес, сонымен қатар транскрипцияны реттеу, иммундық жолдар және ДНҚ репарациясы механизмдеріндегі соматикалық бұзылыстардан да туындауы мүмкін екенін көрсетеді. Накопленный опыт и информация на основе результатов измерений может быть использована при разработке передовых диагностических методов в области медицины. Алынған нәтижелерге негізделген жинақталған тәжірибе мен ақпаратты медицины саласындағы озық диагностикилық әдістерді әзірлеу кезінде пайдалануға болады. Можно использовать в виде методических рекомендаций Нұсқаулық ретінде пайдалануға болады Будет получена допонительная информация о мутациях и генах, чтo pаcшиpит понимание пaтoгeнeтичeских мeхaнизмoв рaзвития зaбoлeвaния, это позволит использовать результаты как инстурмент для диагностикив области персонализированной медицины, и способствоать разработкам таргетной терапии с целью предотвращения разрыров АВМ голвного мозга и кровоизилиянию. Бұл зерттеу нәтижесінде мутациялар мен гендер туралы қосымша ақпарат алынып, аурудың патогенетикалық механизмдерін түсінуді кеңейтеді. Алынған нәтижелер дербестендірілген медицина саласында диагностика құралы ретінде қолдануға және ми АВМ-нің жарылуы мен қан кетуін болдырмауға бағытталған таргеттік терапия әзірлеуге мүмкіндік береді. Здравоохранение, персонализированная медицина Денсаулық сақтау, дербестендірілген медицина. |
||
| UDC indices | ||
| 579.61:615.281.9 | ||
| International classifier codes | ||
| 34.23.35; 34.23.53; 34.15.23; 76.03.39; | ||
| Readiness of the development for implementation | ||
| Key words in Russian | ||
| АВМ головного мозга; патогенные варианты; экзом; секвенирование; молекулярная сигнализация; | ||
| Key words in Kazakh | ||
| ми АВМ; патогендік нұсқалар; экзом; секвенирлеу; молекулалық сигнализация; | ||
| Head of the organization | Абеев | к.б.н / нет |
| Head of work | Жолдыбаева Елена Витальевна | Кандидат биологических наук / ассоциированный профессор |
| Native executive in charge | Мұхтарова Қымбат Ерланқызы | BS in Biolgical Sciences, MS in Public Health |