Inventory number IRN Number of state registration
0224РК01253 BR24992900-OT-24 0124РК01238
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Промежуточный Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 0
International publications: 0 Publications Web of science: 0 Publications Scopus: 0
Number of books Appendicies Sources
1 4 14
Total number of pages Patents Illustrations
81 0 14
Amount of funding Code of the program Table
73000000 Ф.1401 0
Code of the program's task under which the job is done
01
Name of work
Увеличение продолжительности здоровой жизни: использование новых технологий и машинного обучения для контроля обращения старения в старых клетках
Report title
Type of work Source of funding The product offerred for implementation
Fundamental Метод, способ
Report authors
Сингх Прим , Табыс Дина , Әжібек Дулат Мейірбекұлы , Белякин Степан , Салиев Тимур Муйдинович , Sharif Jafar , Newman Andrew , Бексеитов Ергали , Бақыт Лаура Ғалымқызы , Кабимолдаев Ильяс Максатканович , Хамза Айша , Фазылов Тимур ,
0
0
0
4
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) Нет
Full name of the service recipient
Nazarbayev University
Abbreviated name of the service recipient NU
Abstract

Первичные признаки старения (эпигенетические изменения в хромосомах, утрата протеостаза, укорочение теломер и некоторые другие), вторичные признаки старения (нарушение функции митохондрий).

Қартаюдың бастапқы белгілері (хромосомалардағы эпигенетикалық өзгерістер, протеостаздың жоғалуы, теломерлердің қысқаруы және басқалары), қартаюдың қайталама белгілері (митохондриялық функцияның бұзылуы).

разработка новых технологий, способных замедлять или обращать вспять старение клеток и тканей организма, сохраняя их специализированную функцию, и, таким образом, продлевать здоровое долголетие

дене жасушалары мен тіндерінің қартаюын бәсеңдететін немесе қалпына келтіретін, олардың мамандандырылған қызметін сақтай алатын және осылайша сау ұзақ өмір сүруді ұзартатын жаңа технологияларды әзірлеу

эпигенетические изменения в ГПД: Модификации гистонов и ДНК: ChIP-Seq, MeDIP и микрочипы, доступность хроматина в ГПД: метод ATAC, анализ общего пула гистоновых модификаций, анализ цикла дробления-слияния митохондрий

ГТД-дегі эпигенетикалық өзгерістер: гистон және ДНҚ модификациялары: ChIP-Seq, MeDIP және микрочиптер, ГТД-де хроматиннің болуы: АТАС әдісі, гистон модификациясының жалпы пулын талдау, митохондрияның бөліну-синтез циклін талдау

Проведены работы по определению характеристики потенциала митохондриальной мембраны, которая будет использоваться в качестве маркера возрастных изменений функции митохондрий. Были загружены и предварительно обработаны наборы данных для чипового секвенирования триметилирования H3K9. Был проведен анализ наборов данных с использованием алгоритма normR. Были аннотированы бины с использованием базы данных InterPro для областей KRAB-ZNF. Соседние бины были объединены (по 500 пар оснований для каждого набора данных). Были объединены и перекрыты бины по всем наборам данных.

Митохондрия функциясының жасқа байланысты өзгерістерінің маркері ретінде пайдаланылатын митохондриялық мембрананың потенциалының сипаттамасын анықтау бойынша жұмыстар жүргізілді. H3k9 триметилденуінің чиптік реттілігі үшін деректер жиынтығы жүктелді және алдын ала өңделді. Normr алгоритмін қолдана отырып, мәліметтер жиынтығына талдау жасалды. Krab-ZNF аймақтары үшін InterPro дерекқорын пайдаланып биналар түсіндірілді. Көршілес биналар біріктірілді (әр деректер жиынтығы үшін 500 базалық жұп). Барлық деректер жиынтығы бойынша биналар біріктіріліп, жабылды.

на данном этапе работ отсутствуют.

жұмыстың осы кезеңінде-жоқ.

на данном этапе работ отсутствуют.

жұмыстың осы кезеңінде-жоқ.

На протяжении нескольких лет модели для оценки эпигенетического возраста (eAge) на основе метилирования CpG были почти исключительно основаны на линейных регрессионных моделях с регуляризацией. В последнее время наблюдается переход к нелинейным эпигенетическим "часам" на основе метилирования CpG с использованием глубокого обучения. Особенно примечательна модель AltumAge, основанная на структуре глубоких нейронных сетей, которая показывает значительно лучшие результаты по сравнению с линейными моделями. Что важно, AltumAge выявила наиболее важные CpG, которые вносят наибольший вклад в предсказание возраста. Как оказалось, они находятся в крупных ГПД, в которых находятся гены KRAB-ZNF на хромосоме 19 человека. Это дает нам возможность создать многофакторную модель для определения возраста человека по возрастным эпигенетическим изменениям в крупных ГПД на хромосоме 19. Возрастные изменения эпигенетического ландшафта будут включать метилирование CpG, открытость хроматина, уровни метилирования H3K9me3 и размер ГПД. Эти параметры будут интегрированы в единую нелинейную модель для оценки возраста.

Бірнеше жыл ішінде CPG метилденуіне негізделген эпигенетикалық жасты (eAge) бағалауға арналған модельдер тек дерлік сызықтық регрессиялық регрессиялық модельдерге негізделген. Жақында терең оқытуды қолдана отырып, CPG метилденуіне негізделген сызықтық емес эпигенетикалық "сағаттарға" көшу байқалды. Терең нейрондық желілердің құрылымына негізделген AltumAge моделі ерекше назар аударады, бұл сызықтық модельдермен салыстырғанда айтарлықтай жақсы нәтиже көрсетеді. Ең бастысы, AltumAge жасты болжауға ең көп үлес қосатын ең маңызды CpG-ді анықтады. Белгілі болғандай, олар адамның 19-хромосомасында KRAB-ZNF гендері бар үлкен ГТД-да кездеседі. Бұл бізге 19-хромосомадағы үлкен ГТД - дағы жасына байланысты эпигенетикалық өзгерістер арқылы адамның жасын анықтау үшін көп факторлы модель құруға мүмкіндік береді. Эпигенетикалық ландшафттағы жасқа байланысты өзгерістерге CPG метилденуі, хроматиннің ашықтығы, h3k9me3 метилдену деңгейі және ГТД мөлшері кіреді. Бұл параметрлер жасты бағалау үшін бір сызықты емес модельге біріктіріледі.

Здравоохранение, регенеративная медицина, снижение рисков заболеваний у пожилых людей, увеличение продолжительности здорового долголетия

Денсаулық сақтау, Регенеративті медицина, егде жастағы адамдарда ауру қаупінің төмендеуі, салауатты ұзақ өмір сүру ұзақтығының артуы

UDC indices
57.017.67, 577.24
International classifier codes
34.03.27; 34.15.49; 76.29.59; 34.23.29; 34.03.23;
Readiness of the development for implementation
Key words in Russian
Старение; геронтология; омоложение; человеческие клетки; эпигенетика;
Key words in Kazakh
Қартаю; геронтология; жасарту; адам жасушалары; эпигенетика;
Head of the organization Адесида Илесанми Phd / Провост
Head of work Сингх Прим PhD in Biological Sciences (Genetics) / Full Professor
Native executive in charge