Inventory number | IRN | Number of state registration | ||
---|---|---|---|---|
0324РК01465 | AP23490406-KC-24 | 0124РК00249 | ||
Document type | Terms of distribution | Availability of implementation | ||
Краткие сведения | Gratis | Number of implementation: 0 Not implemented |
||
Publications | ||||
Native publications: 0 | ||||
International publications: 0 | Publications Web of science: 0 | Publications Scopus: 0 | ||
Patents | Amount of funding | Code of the program | ||
0 | 34000000 | AP23490406 | ||
Name of work | ||||
Молекулярно-генетическая характеристика циркулирующих на птицефабриках РК штаммов сальмонелл и разработка экспресс-теста для их обнаружения | ||||
Type of work | Source of funding | Report authors | ||
Applied | Боровиков Сергей Николаевич | |||
0
1
0
0
|
||||
Customer | МНВО РК | |||
Information on the executing organization | ||||
Short name of the ministry (establishment) | МСХ РК | |||
Full name of the service recipient | ||||
Казахский агротехнический исследовательский университет имени Сакена Сейфуллина | ||||
Abbreviated name of the service recipient | НАО «КАТИУ им. С.Сейфуллина» | |||
Abstract | ||||
Образцы материала из птицефабрик северных регионов РК Қазақстан Республикасының солтүстік облыстарының құс фабрикаларынан алынған материал үлгілері Отбор образцов материала из птицефабрик северных регионов РК, их исследование методом ИФА и ПЦР, генотипирование выделенных изолятов 1. Қазақстан Республикасының солтүстік облыстарындағы құс фабрикаларынан материал үлгілерін іріктеу, оларды ИФТ және ПТР арқылы зерттеу, оқшауланған изоляттарды генотиптеу микробиологические, биохимические, серологические, бактериологические и молекулярно-генетические микробиологиялық, биохимиялық, серологиялық, бактериологиялық және молекулалы-генетикалық Проведен отбор образцов биологического материала на птицефабриках Акмолинской, Костанайской и Карагандинской областей. Исследования образцов проведены в Казахстанско-китайской лаборатории по биологической безопасности КАТИУ им. С.Сейфуллина. В результате иммунологических исследований (метод непрямого ИФА) выявлено наличие специфических антител в 33 образцах сывороток крови из 188 исследованных, молекулярно-генетический анализ биологического материала подтвердил наличие ДНК возбудителя Salmonella spp. в 8 пробах. Проведено выделение бактериальных изолятов Salmonella из биологического материала, родовую принадлежность определяли методом матричной лазерной масс-спектрометрии (MALDI-TOF MS), в результате в 18-ми пробах обнаружены бактерии рода Salmonella. Проведено выделение ДНК из бактериальной массы 18 изолятов Salmonella spp., средний суммарный выход ДНК составил 2,3 мкг. Проведено полногеномное секвенирование 6 выделенных изолятов Salmonella spp.. Генотипирование изолятов проведено на основании анализа фрагмента 16S rRNA, изоляты кластеризовались с референтными штаммами Salmonella enterica. Проведен анализ результатов полногеномного секвенирования 6 изолятов. Средняя длина прочтений варьировалась от 241 до 269 пар нуклеотидов. GC состав равен 53%. Количество полученных ридов позволила получить кратность покрытия более 30. Средний размер собранных геномов составил около 4,8 миллионов пар нуклеотидов - Ақмола, Қостанай және Қарағанды облыстарының құс фабрикаларынан алынған биологиялық материал үлгілері жинап алынды. Үлгілерді зерттеу С. Сейфуллин атныдағы ҚАТЗУ-нің базасындағы биологиялық қауіпсіздік бойынша Қазақстан-Қытай зертханасында жүргізілді. Иммунологиялық зерттеулер (жанама ИФТ әдісі) нәтижесінде 188 зерттелген қан сарысуының 33 сынамасында телімді антиденелердің болуы анықталды және биологиялық материалдың молекулалық-генетикалық талдауы барысында 8 үлгіде Salmonella spp. қоздырғышының ДНҚ болуын растады. -Биологиялық материалдан Salmonella бактерияларының изоляттары бөлініп алынды, олардың түрі матрицалық лазерлік масс-спектрометрия (MALDI-TOF MS) көмегімен анықталды, нәтижесінде 18 сынамадан Salmonella туысының бактериялары табылды. -18 Salmonella spp изоляттарының бактериялық массасынан ДНҚ оқшаулануы жүргізіліп, ДНҚ-ның орташа жалпы көрсеткіші 2,3 мкг құрады. -6 оқшауланған Salmonella spp изоляттарының толық геномдық секвенирлеуі жасалды. Изоляттарды генотиптеу 16s rRNA фрагментін талдау негізінде жүзеге асырылы, изоляттар Salmonella enterica референтті штамдарымен сәйкестендірілді. -Оқшауланған 6 изоляттың толық геномдық секвенирлеуінің нәтижелері талданды. Орташа оқу ұзындығы 241-ден 269 ж.н. аралығында болды. GC құрамы орташа есеппен 53% құрады. Алынған оқулар саны 30-дан астам қамту коэффициентін алуға мүмкіндік берді. Жиналған геномдардың орташа мөлшері шамамен 4,8 миллион негізгі жұпты құрады. выделены изоляты Salmonella spp. из образцов материала птиц Salmonella spp изоляттары оқшауланған құстардың материал үлгілерінен
ветеринария ветеринария |
||||
UDC indices | ||||
637.075:571.27:579.6:57.083.3 | ||||
International classifier codes | ||||
62.41.99; | ||||
Key words in Russian | ||||
Сальмонеллез птиц; Изоляты; Генотипирование; Антибиотикорезистентность; Экспресс-диагностика; | ||||
Key words in Kazakh | ||||
Құстардың сальмонеллезі; Изоляттар; Генотиптеу; Антибиотикке төзімділік; Жедел диагностика; | ||||
Head of the organization | Тиреуов Канат Маратович | Доктор экономических наук / профессор | ||
Head of work | Боровиков Сергей Николаевич | Кандидат биологических наук / доцент |